seq1 = pF1KB8167.tfa, 1317 bp
seq2 = pF1KB8167/gi568815583r_43705097.tfa (gi568815583r:43705097_43924569), 219473 bp

>pF1KB8167 1317
>gi568815583r:43705097_43924569 (Chr15)

(complement)

1-79  (100001-100079)   100% ->
80-299  (107122-107341)   100% ->
300-429  (109496-109625)   100% ->
430-617  (109882-110069)   100% ->
618-726  (111213-111321)   100% ->
727-887  (111423-111583)   100% ->
888-1047  (114656-114815)   100% ->
1048-1137  (119105-119194)   100% ->
1138-1317  (119294-119473)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGTCCCAAGCGCTCTCATGAAGCAACCGCCCATTCAGTCTACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGTCCCAAGCGCTCTCATGAAGCAACCGCCCATTCAGTCTACGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGGGCCGTCCCAGTTCGCAATGAGAAAG         GTGAGATTTCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100051 TGGGGCCGTCCCAGTTCGCAATGAGAAAGGTA...CAGGTGAGATTTCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGAAAAAGTGAAGGTAAAGCGTTATGTGTCCGGAAAAAGGCCAGACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107134 TGGAAAAAGTGAAGGTAAAGCGTTATGTGTCCGGAAAAAGGCCAGACTAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCCCTATGGAGTCCTCAGATGAGGAGGATGAAGAATTTCAGTTCATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107184 GCCCCTATGGAGTCCTCAGATGAGGAGGATGAAGAATTTCAGTTCATTAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAAGCCAAAGAACAAGAAGCAGAGCCTGAGGAACAGGAGGAGGATTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107234 GAAAGCCAAAGAACAAGAAGCAGAGCCTGAGGAACAGGAGGAGGATTCAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCAGTGACCCCCGGCTACGGCGTTTACAGAACCGTATTAGTGAAGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107284 CCAGTGACCCCCGGCTACGGCGTTTACAGAACCGTATTAGTGAAGATGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAAGAGAG         ATTGGCTCGACATCGAAAAATAGTGGAACCTGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 107334 GAAGAGAGGTA...CAGATTGGCTCGACATCGAAAAATAGTGGAACCTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGTGGTAGGAGAGAGTGACTCAGAAGTAGAAGGAGATGCTTGGCGCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109529 AGTGGTAGGAGAGAGTGACTCAGAAGTAGAAGGAGATGCTTGGCGCATGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AACGAGAAGACAGCAGTGAAGAAGAGGAGGAGGAAATTGATGATGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 109579 AACGAGAAGACAGCAGTGAAGAAGAGGAGGAGGAAATTGATGATGAGGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    430       GAAATAGAGCGGCGGCGTGGCATGATGCGTCAGCGAGCACAGGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109629 ...TAGGAAATAGAGCGGCGGCGTGGCATGATGCGTCAGCGAGCACAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GAGAAAAAATGAAGAGATGGAAGTCATGGAAGTGGAAGATGAGGGTCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109926 GAGAAAAAATGAAGAGATGGAAGTCATGGAAGTGGAAGATGAGGGTCGTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTGGAGAGGAGTCAGAATCAGAGTCTGAGTATGAAGAGTACACAGACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109976 CTGGAGAGGAGTCAGAATCAGAGTCTGAGTATGAAGAGTACACAGACAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAAGATGAGATGGAGCCTCGCCTTAAGCCAGTCTTCATTCGAAA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 110026 GAAGATGAGATGGAGCCTCGCCTTAAGCCAGTCTTCATTCGAAAGTA...

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    618    GAAGGACCGAGTGACAGTTCAAGAACGTGAAGCCGAAGCATTGAAAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111210 CAGGAAGGACCGAGTGACAGTTCAAGAACGTGAAGCCGAAGCATTGAAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGAAGGAGCTGGAGCAGGAAGCAAAACGCATGGCTGAGGAAAGGCGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111260 AGAAGGAGCTGGAGCAGGAAGCAAAACGCATGGCTGAGGAAAGGCGCAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TACACACTCAAG         ATTGTCGAAGAGGAAACCAAAAAAGAGCT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 111310 TACACACTCAAGGTA...CAGATTGTCGAAGAGGAAACCAAAAAAGAGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGAAGAGAACAAGCGATCCCTGGCTGCATTGGATGCACTCAATACTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111452 GGAAGAGAACAAGCGATCCCTGGCTGCATTGGATGCACTCAATACTGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ATGAAAATGATGAGGAGGAATATGAGGCATGGAAAGTTCGAGAGCTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111502 ATGAAAATGATGAGGAGGAATATGAGGCATGGAAAGTTCGAGAGCTAAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AGAATCAAGAGGGACAGAGAAGATCGAGAAGC         GCTTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 111552 AGAATCAAGAGGGACAGAGAAGATCGAGAAGCGTG...CAGGCTTGAGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GGAGAAAGCAGAAATTGAACGCATGCGAAACCTGACTGAGGAAGAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114665 GGAGAAAGCAGAAATTGAACGCATGCGAAACCTGACTGAGGAAGAGAGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GAGCTGAACTTCGGGCAAACGGCAAAGTCATTACCAACAAAGCTGTTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114715 GAGCTGAACTTCGGGCAAACGGCAAAGTCATTACCAACAAAGCTGTTAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GGCAAATACAAGTTCTTACAGAAGTATTATCACCGGGGTGCCTTCTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114765 GGCAAATACAAGTTCTTACAGAAGTATTATCACCGGGGTGCCTTCTTCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 G         GATGAGGATGAAGAAGTATACAAGAGAGATTTCAGCGCTC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114815 GGTA...CAGGATGAGGATGAAGAAGTATACAAGAGAGATTTCAGCGCTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CTACCCTGGAGGATCATTTCAATAAAACCATTCTTCCTAAAGTCATGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119145 CTACCCTGGAGGATCATTTCAATAAAACCATTCTTCCTAAAGTCATGCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138          GTCAAGAACTTTGGACGCTCAGGTCGCACCAAATACACTCA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119195 GTA...CAGGTCAAGAACTTTGGACGCTCAGGTCGCACCAAATACACTCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CCTTGTGGATCAAGATACCACCTCCTTTGACTCAGCTTGGGGCCAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119335 CCTTGTGGATCAAGATACCACCTCCTTTGACTCAGCTTGGGGCCAAGAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GTGCCCAGAACACAAAGTTCTTCAAACAAAAGGCAGCTGGGGTACGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119385 GTGCCCAGAACACAAAGTTCTTCAAACAAAAGGCAGCTGGGGTACGAGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .
   1279 GTATTTGAGCGGCCATCTGCCAAGAAGCGGAAAACTACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119435 GTATTTGAGCGGCCATCTGCCAAGAAGCGGAAAACTACC