seq1 = pF1KB8160.tfa, 780 bp
seq2 = pF1KB8160/gi568815588f_28577898.tfa (gi568815588f:28577898_28782398), 204501 bp

>pF1KB8160 780
>gi568815588f:28577898_28782398 (Chr10)

1-76  (100001-100076)   100% ->
77-364  (103361-103648)   100% ->
365-780  (104086-104501)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATCGCCACTCCAGCTACATCTTCATCTGGCTGCAGCTGGAGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATCGCCACTCCAGCTACATCTTCATCTGGCTGCAGCTGGAGCTCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCCATGGCCGTGCTGCTCACCAAAG         GTGAAATTCGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100051 CGCCATGGCCGTGCTGCTCACCAAAGGTG...CAGGTGAAATTCGATGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACTGTGATGCTGCCCACTGTGTAGCCACTGGTTATATGTGTAAATCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103376 ACTGTGATGCTGCCCACTGTGTAGCCACTGGTTATATGTGTAAATCTGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTCAGCGCCTGCTTCTCTAGACTTCTTGATCCTCAGAACTCAAATTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103426 CTCAGCGCCTGCTTCTCTAGACTTCTTGATCCTCAGAACTCAAATTCCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACTCACCCATGGCTGCCTGGACTCTCTTGCAAGCACGACAGACATCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103476 ACTCACCCATGGCTGCCTGGACTCTCTTGCAAGCACGACAGACATCTGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAGCCAAACAGGCCCGAAACCACTCTGGCACCACCATACCCACATTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103526 AAGCCAAACAGGCCCGAAACCACTCTGGCACCACCATACCCACATTGGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGCTGTCATGAAGACATGTGCAATTACAGAGGGCTGCACGATGTTCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103576 TGCTGTCATGAAGACATGTGCAATTACAGAGGGCTGCACGATGTTCTCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TCCTCCCAGGGGTGAGGCCTCAG         GACAAGGAAACAGGTATC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 103626 TCCTCCCAGGGGTGAGGCCTCAGGTA...TAGGACAAGGAAACAGGTATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGCATGATGGTAGCAGAAACCTTATCACCAAGGTGCAGGAGCTGACTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104104 AGCATGATGGTAGCAGAAACCTTATCACCAAGGTGCAGGAGCTGACTTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TCCAAAGAGTTGTGGTTCCGGGCAGCGGTCATTGCCGTGCCCATTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104154 TCCAAAGAGTTGTGGTTCCGGGCAGCGGTCATTGCCGTGCCCATTGCTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AGGGCTGATTTTAGTGTTGCTTATTATGTTGGCCCTGAGGATGCTTCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104204 AGGGCTGATTTTAGTGTTGCTTATTATGTTGGCCCTGAGGATGCTTCGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GTGAAAATAAGAGGCTGCAGGATCAGCGGCAACAGATGCTCTCCCGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104254 GTGAAAATAAGAGGCTGCAGGATCAGCGGCAACAGATGCTCTCCCGTTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CACTACAGCTTTCACGGACACCATTCCAAAAAGGGGCAGGTTGCAAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104304 CACTACAGCTTTCACGGACACCATTCCAAAAAGGGGCAGGTTGCAAAGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 AGACTTGGAATGCATGGTGCCGGTCAGTGGGCACGAGAACTGCTGTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104354 AGACTTGGAATGCATGGTGCCGGTCAGTGGGCACGAGAACTGCTGTCTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CCTGTGATAAAATGAGACAAGCAGACCTCAGCAACGATAAGATCCTCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104404 CCTGTGATAAAATGAGACAAGCAGACCTCAGCAACGATAAGATCCTCTCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    733 CTTGTTCACTGGGGCATGTACAGTGGGCACGGGAAGCTGGAATTCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104454 CTTGTTCACTGGGGCATGTACAGTGGGCACGGGAAGCTGGAATTCGTA