seq1 = pF1KB8158.tfa, 1131 bp
seq2 = pF1KB8158/gi568815588f_97351676.tfa (gi568815588f:97351676_97556888), 205213 bp

>pF1KB8158 1131
>gi568815588f:97351676_97556888 (Chr10)

1-243  (100001-100243)   100% ->
244-438  (100415-100609)   100% ->
439-527  (100740-100828)   100% ->
528-556  (101220-101248)   100% ->
557-690  (101855-101988)   100% ->
691-738  (102124-102171)   100% ->
739-824  (103039-103124)   100% ->
825-948  (103985-104108)   100% ->
949-1019  (104299-104369)   100% ->
1020-1131  (105102-105213)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGAGGCCAGCGGAGCCTGCTGCTGGGCCCGGCCCGCCTCTGCCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGAGGCCAGCGGAGCCTGCTGCTGGGCCCGGCCCGCCTCTGCCTCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCCTTCTGCTGCTGGGTTACAGGCGCCGCTGTCCACCTCTACTCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTCCTTCTGCTGCTGGGTTACAGGCGCCGCTGTCCACCTCTACTCCGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTCTAGTACAGCGCTGGCGCTACGGCAAGGTCTGCCTGCGCTCCCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTCTAGTACAGCGCTGGCGCTACGGCAAGGTCTGCCTGCGCTCCCTGCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TACAACTCCTTTGGGGGCAGTGACACCGCTGTTGATGCTGCCTTTGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TACAACTCCTTTGGGGGCAGTGACACCGCTGTTGATGCTGCCTTTGAGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGTCTACTGGCTGGTAGACAACGTGATCCGCTGGTTTGGAGTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100201 TGTCTACTGGCTGGTAGACAACGTGATCCGCTGGTTTGGAGTGGTG...C

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    244   GTGTTCGTGGTCCTGGTGATCGTGCTGACAGGCTCCATTGTAGCTATC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100413 AGGTGTTCGTGGTCCTGGTGATCGTGCTGACAGGCTCCATTGTAGCTATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCCTACCTGTGTGTCCTGCCTCTCATCCTCCGAACCTACTCAGTGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100463 GCCTACCTGTGTGTCCTGCCTCTCATCCTCCGAACCTACTCAGTGCCACG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 ACTCTGCTGGCATTTCTTCTATAGCCACTGGAATCTGATCCTGATTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100513 ACTCTGCTGGCATTTCTTCTATAGCCACTGGAATCTGATCCTGATTGTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCCACTACTACCAGGCCATCACCACTCCGCCTGGGTACCCACCCCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100563 TCCACTACTACCAGGCCATCACCACTCCGCCTGGGTACCCACCCCAGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    439       GGCAGGAATGATATCGCCACCGTCTCCATCTGTAAGAAGTGCAT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100613 ...CAGGGCAGGAATGATATCGCCACCGTCTCCATCTGTAAGAAGTGCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TTACCCCAAGCCAGCCCGAACACACCACTGCAGCATCTGCAACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100784 TTACCCCAAGCCAGCCCGAACACACCACTGCAGCATCTGCAACAGGTG..

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    528     GTGTGTGCTGAAGATGGATCACCACTGCC         CCTGGCTA
        .>>>|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100834 .CAGGTGTGTGCTGAAGATGGATCACCACTGCCGTA...CAGCCTGGCTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AACAATTGTGTGGGCCACTATAACCATCGGTACTTCTTCTCTTTCTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101863 AACAATTGTGTGGGCCACTATAACCATCGGTACTTCTTCTCTTTCTGCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TTTCATGACTCTGGGCTGTGTCTACTGCAGCTATGGAAGTTGGGACCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101913 TTTCATGACTCTGGGCTGTGTCTACTGCAGCTATGGAAGTTGGGACCTTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCCGGGAGGCTTATGCTGCCATTGAG         AAAATGAAACAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 101963 TCCGGGAGGCTTATGCTGCCATTGAGGTG...TAGAAAATGAAACAGCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GACAAGAACAAACTACAGGCGGTTGCCAACCAG         ACTTATCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 102139 GACAAGAACAAACTACAGGCGGTTGCCAACCAGGTG...TAGACTTATCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CCAGACCCCACCACCCACCTTCTCCTTTCGAGAAAGGATGACTCACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103047 CCAGACCCCACCACCCACCTTCTCCTTTCGAGAAAGGATGACTCACAAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GTCTTGTCTACCTCTGGTTCCTGTGCAG         TTCTGTGGCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 103097 GTCTTGTCTACCTCTGGTTCCTGTGCAGGTA...TAGTTCTGTGGCACTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GCCCTGGGTGCCCTAACTGTATGGCATGCTGTTCTCATCAGTCGAGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103998 GCCCTGGGTGCCCTAACTGTATGGCATGCTGTTCTCATCAGTCGAGGTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GACTAGCATCGAAAGGCACATCAACAAGAAGGAGAGACGTCGGCTACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104048 GACTAGCATCGAAAGGCACATCAACAAGAAGGAGAGACGTCGGCTACAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCAAGGGCAGA         GTATTTAGGAATCCTTACAACTACGGCTGC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 104098 CCAAGGGCAGAGTG...CAGGTATTTAGGAATCCTTACAACTACGGCTGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 TTGGACAACTGGAAGGTATTCCTGGGTGTGGATACAGGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 104329 TTGGACAACTGGAAGGTATTCCTGGGTGTGGATACAGGAAGGTA...TAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GCACTGGCTTACTCGGGTGCTCTTACCTTCTAGTCACTTGCCCCATGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105102 GCACTGGCTTACTCGGGTGCTCTTACCTTCTAGTCACTTGCCCCATGGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 ATGGAATGAGCTGGGAGCCCCCTCCCTGGGTGACTGCTCACTCAGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105152 ATGGAATGAGCTGGGAGCCCCCTCCCTGGGTGACTGCTCACTCAGCCTCT

   1200     .    :
   1120 GTGATGGCAGTG
        ||||||||||||
 105202 GTGATGGCAGTG