seq1 = pF1KB8154.tfa, 1707 bp
seq2 = pF1KB8154/gi568815579f_56313957.tfa (gi568815579f:56313957_56524288), 210332 bp

>pF1KB8154 1707
>gi568815579f:56313957_56524288 (Chr19)

1-136  (99996-100129)   97% ->
137-232  (100389-100484)   100% ->
233-1707  (108935-110409)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCAAGGATTTGGTGACATTTGGGGATGTGGCTGTAAATTTCTCTCA
        || |-||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99996 ATTT CA GGATTTGGTGACATTTGGGGATGTGGCTGTAAATTTCTCTCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAGGAATGGGAATGGCTGAACCCTGCTCAGAGGAATTTGTACAGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100044 AGAGGAATGGGAATGGCTGAACCCTGCTCAGAGGAATTTGTACAGGAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGATGTTGGAGAACTACAGGAGCTTGGTATCATTGG         GAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100094 TGATGTTGGAGAACTACAGGAGCTTGGTATCATTGGGTA...CAGGAGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCTGTTTCTAAGCCAGATGTGATCTCATTATTGGAGCAAGGAAAAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100394 TCTGTTTCTAAGCCAGATGTGATCTCATTATTGGAGCAAGGAAAAGAGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTGGATGGTGAAGAAGGAGGGAACAAGAGGCCCATGCCCTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100444 CTGGATGGTGAAGAAGGAGGGAACAAGAGGCCCATGCCCTGGTG...TAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATTGGGAGTATGTATTTAAAAACAGTGAATTTTCATCAAAGCAAGAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108935 ATTGGGAGTATGTATTTAAAAACAGTGAATTTTCATCAAAGCAAGAGACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TATGAAGAATCATCCAAAGTTGTGACAGTGGGAGCAAGACATCTTAGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108985 TATGAAGAATCATCCAAAGTTGTGACAGTGGGAGCAAGACATCTTAGTTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TAGCCTTGACTATCCCAGTTTGAGAGAAGACTGTCAAAGTGAGGACTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109035 TAGCCTTGACTATCCCAGTTTGAGAGAAGACTGTCAAAGTGAGGACTGGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATAAGAACCAGCTGGGAAGTCAAGAGGTACATCTTAGTCAATTAATCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109085 ATAAGAACCAGCTGGGAAGTCAAGAGGTACATCTTAGTCAATTAATCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ACTCATAAAGAAATCCTTCCAGAAGTTCAAAATAAAGAATATAACAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109135 ACTCATAAAGAAATCCTTCCAGAAGTTCAAAATAAAGAATATAACAAATC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TTGGCAAACATTCCACCAGGATACAATCTTTGATATACAACAGAGTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109185 TTGGCAAACATTCCACCAGGATACAATCTTTGATATACAACAGAGTTTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCACCAAAGAAAAAGCACATAAGCATGAACCACAAAAGAAAAGTTACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109235 CCACCAAAGAAAAAGCACATAAGCATGAACCACAAAAGAAAAGTTACCGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AAAAAATCTGTTGAAATGAAACATAGGAAAGTCTATGTAGAAAAGAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109285 AAAAAATCTGTTGAAATGAAACATAGGAAAGTCTATGTAGAAAAGAAACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TTTGAAATGTAATGATTGTGAGAAAGTCTTCAACCAGAGCTCATCCCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109335 TTTGAAATGTAATGATTGTGAGAAAGTCTTCAACCAGAGCTCATCCCTTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CTCTTCATCAGAGAATTCATACTGGAGAGAAACCCTATGCATGTGTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109385 CTCTTCATCAGAGAATTCATACTGGAGAGAAACCCTATGCATGTGTTGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TGTGGGAAAACGTTCAGCCAGAGTGCAAACTTGGCGCAACATAAGAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109435 TGTGGGAAAACGTTCAGCCAGAGTGCAAACTTGGCGCAACATAAGAGAAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 ACATACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTAAAGAATGTAGGAAAGCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109485 ACATACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTAAAGAATGTAGGAAAGCCTTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 GCCAGAATGCACACCTGGCCCAACATCAGAGAGTTCATACTGGAGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109535 GCCAGAATGCACACCTGGCCCAACATCAGAGAGTTCATACTGGAGAGAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 CCTTATCAGTGTAAAGAATGTAAAAAAGCCTTCAGCCAGATTGCACACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109585 CCTTATCAGTGTAAAGAATGTAAAAAAGCCTTCAGCCAGATTGCACACCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GACTCAGCATCAGAGAGTTCATACTGGAGAGAGACCTTTCGAATGTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109635 GACTCAGCATCAGAGAGTTCATACTGGAGAGAGACCTTTCGAATGTATTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 AATGTGGAAAGGCCTTTAGTAATGGTTCATTTCTTGCTCAGCATCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109685 AATGTGGAAAGGCCTTTAGTAATGGTTCATTTCTTGCTCAGCATCAGAGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 ATTCATACAGGAGAGAAACCTTATGTGTGTAATGTGTGTGGGAAAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109735 ATTCATACAGGAGAGAAACCTTATGTGTGTAATGTGTGTGGGAAAGCCTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 TAGCCATCGTGGATACCTAATTGTACATCAGAGAATTCATACTGGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109785 TAGCCATCGTGGATACCTAATTGTACATCAGAGAATTCATACTGGAGAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 GACCCTACGAATGTAAGGAATGTAGGAAAGCCTTCAGCCAGTATGCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109835 GACCCTACGAATGTAAGGAATGTAGGAAAGCCTTCAGCCAGTATGCACAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 CTTGCTCAACATCAGAGAGTTCATACTGGAGAAAAACCTTATGAATGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109885 CTTGCTCAACATCAGAGAGTTCATACTGGAGAAAAACCTTATGAATGTAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 AGTATGTAGGAAAGCCTTCAGCCAAATTGCATACCTTGATCAACATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109935 AGTATGTAGGAAAGCCTTCAGCCAAATTGCATACCTTGATCAACATCAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 GGGTTCATACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTATTGAATGTGGGAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109985 GGGTTCATACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTATTGAATGTGGGAAGGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 TTTAGCAATAGTTCATCACTTGCACAACATCAGAGAAGTCATACTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110035 TTTAGCAATAGTTCATCACTTGCACAACATCAGAGAAGTCATACTGGAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 AAAACCCTATATGTGTAAGGAATGTAGGAAAACATTTAGCCAGAATGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110085 AAAACCCTATATGTGTAAGGAATGTAGGAAAACATTTAGCCAGAATGCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 GCCTTGCTCAACATCAGAGAATTCATACTGGAGAGAAACCTTATGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110135 GCCTTGCTCAACATCAGAGAATTCATACTGGAGAGAAACCTTATGAATGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 AATGTTTGTGGGAAAGCATTTAGCTATAGTGGATCTCTTACTCTACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110185 AATGTTTGTGGGAAAGCATTTAGCTATAGTGGATCTCTTACTCTACATCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 GAGAATTCATACTGGAGAAAGACCCTATGAATGTAAAGATTGCAGGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110235 GAGAATTCATACTGGAGAAAGACCCTATGAATGTAAAGATTGCAGGAAAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 CTTTCAGGCAGCGTGCACATCTTGCTCATCATGAGAGAATTCATACTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110285 CTTTCAGGCAGCGTGCACATCTTGCTCATCATGAGAGAATTCATACTATG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 GAGTCATTCTTGACTCTTTCCTCTCCCTCACCCTCCACATCAAATCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110335 GAGTCATTCTTGACTCTTTCCTCTCCCTCACCCTCCACATCAAATCAGTT

   1700     .    :    .    :    .
   1683 GCCAAGACCTGTAGGTTTCATCTCC
        |||||||||||||||||||||||||
 110385 GCCAAGACCTGTAGGTTTCATCTCC