seq1 = pF1KB8141.tfa, 408 bp
seq2 = pF1KB8141/gi568815581r_75678598.tfa (gi568815581r:75678598_75879174), 200577 bp

>pF1KB8141 408
>gi568815581r:75678598_75879174 (Chr17)

(complement)

1-128  (100001-100128)   100% ->
129-282  (100212-100365)   100% ->
283-408  (100452-100577)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCGAACCAAGCAGACTGCTCGTAAGTCCACCGGTGGGAAAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCGAACCAAGCAGACTGCTCGTAAGTCCACCGGTGGGAAAGCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCAAACAGCTGGCCACGAAAGCCGCCAGGAAAAGCGCTCCCTCTACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGCAAACAGCTGGCCACGAAAGCCGCCAGGAAAAGCGCTCCCTCTACCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGGGGTGAAGAAGCCTCATCGCTACAG         GCCCGGGACCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100101 GCGGGGTGAAGAAGCCTCATCGCTACAGGTA...CAGGCCCGGGACCGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCGCTTCGAGAGATTCGTCGTTATCAGAAGTCGACCGAGCTGCTCATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100225 GCGCTTCGAGAGATTCGTCGTTATCAGAAGTCGACCGAGCTGCTCATCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAGCTGCCCTTCCAGAGGTTGGTGAGGGAGATCGCGCAGGATTTCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100275 GAAGCTGCCCTTCCAGAGGTTGGTGAGGGAGATCGCGCAGGATTTCAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCGACCTGAGGTTTCAGAGCGCAGCCATCGGTGCGCTGCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100325 CCGACCTGAGGTTTCAGAGCGCAGCCATCGGTGCGCTGCAGGTA...CAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGGCTAGCGAAGCGTACCTGGTGGGTCTGTTCGAAGATACCAACCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100452 GAGGCTAGCGAAGCGTACCTGGTGGGTCTGTTCGAAGATACCAACCTGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGCCATCCACGCTAAGAGAGTCACCATCATGCCCAAAGACATCCAGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100502 TGCCATCCACGCTAAGAGAGTCACCATCATGCCCAAAGACATCCAGTTGG

    400     .    :    .    :    .
    383 CTCGCCGGATACGGGGAGAGAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||
 100552 CTCGCCGGATACGGGGAGAGAGAGCT