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seq2 = pF1KB8135/gi568815587r_544553.tfa (gi568815587r:544553_794843), 250291 bp

>pF1KB8135 1491
>gi568815587r:544553_794843 (Chr11)

(complement)

1-87  (100001-100089)   96% ->
88-183  (103248-103343)   100% ->
184-313  (106384-106513)   100% ->
314-460  (106787-106933)   100% ->
461-600  (107847-107986)   100% ->
601-666  (109881-109946)   100% ->
667-793  (113755-113881)   100% ->
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923-1051  (116022-116150)   100% ->
1052-1299  (120061-120308)   100% ->
1300-1389  (140793-140882)   100% ->
1390-1491  (150190-150291)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGGAGCCCGGGCACATGGACATGGGCGCCGAGGCCCTGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGGAGCCCGGGCACATGGACATGGGCGCCGAGGCCCTGCCCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCGACGAGGCCGCCGCTGCCGCAGCCTTCGCAG  AG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||--| >>>...>>>||
 100051 CCCCGACGAGGCCGCCGCTGCCGCAGCCTTCGCAGGCAAGTG...GAGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     90 GACCACAGTGACAGTGGCCAACGTGGGGGCTGCTGCAGACAATGTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103250 GACCACAGTGACAGTGGCCAACGTGGGGGCTGCTGCAGACAATGTCTTCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    140 CCACGTCTGTGGCGAACGCGGCATCCATCTCAGGACATGTTCTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 103300 CCACGTCTGTGGCGAACGCGGCATCCATCTCAGGACATGTTCTGGTA...

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    184    TCTGGTAGGACGGCCCTTCAGATCGGGGACAGCCTGAACACCGAAAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106381 TAGTCTGGTAGGACGGCCCTTCAGATCGGGGACAGCCTGAACACCGAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    231 AGCGACACTGATTGTCGTCCACACAGATGGGAGCATCGTGGAGACCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106431 AGCGACACTGATTGTCGTCCACACAGATGGGAGCATCGTGGAGACCACCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    281 GGCTGAAAGGCCCGGCAGCTCCCCTCACCCCAG         GTCCTCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 106481 GGCTGAAAGGCCCGGCAGCTCCCCTCACCCCAGGTA...AAGGTCCTCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    322 TCTCCTCCAACCCCTCTGGCTCCCGGCCAAGAAAAAGGTGGAACTAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106795 TCTCCTCCAACCCCTCTGGCTCCCGGCCAAGAAAAAGGTGGAACTAAATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    372 CAACTGGGACCCTTCTGTGTACGACAGTGAGCTGCCCGTACGGTGCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106845 CAACTGGGACCCTTCTGTGTACGACAGTGAGCTGCCCGTACGGTGCCGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    422 ACATCAGCGGCACTCTGTACAAGAACAGGCTCGGCTCAG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 106895 ACATCAGCGGCACTCTGTACAAGAACAGGCTCGGCTCAGGTG...CAGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    463 GGCCGGGGACGGTGCATCAAGCAGGGGGAGAACTGGTACAGTCCCACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107849 GGCCGGGGACGGTGCATCAAGCAGGGGGAGAACTGGTACAGTCCCACCGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    513 GTTTGAGGCCATGGCAGGAAGAGCCAGCAGTAAGGACTGGAAAAGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107899 GTTTGAGGCCATGGCAGGAAGAGCCAGCAGTAAGGACTGGAAAAGAAGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    563 TTCGCTACGCGGGCCGACCCTTGCAGTGCCTCATCCAG         GAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 107949 TTCGCTACGCGGGCCGACCCTTGCAGTGCCTCATCCAGGTA...CAGGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    604 GGGATCTTAAACCCTCACGCTGCCTCTTGCACCTGTGCTGCCTGCTGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109884 GGGATCTTAAACCCTCACGCTGCCTCTTGCACCTGTGCTGCCTGCTGCGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    654 CGACATGACCTTA         AGTGGCCCAGTCAGGCTTTTTGTGCCTT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 109934 CGACATGACCTTAGTA...CAGAGTGGCCCAGTCAGGCTTTTTGTGCCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    695 ACAAAAGGCGCAAGAAGGAGAATGAACTGCCCACAACTCCCGTGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113783 ACAAAAGGCGCAAGAAGGAGAATGAACTGCCCACAACTCCCGTGAAGAAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    745 GACTCCCCCAAGAACATCACATTGCTTCCAGCCACCGCGGCTACCACCT 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 113833 GACTCCCCCAAGAACATCACATTGCTTCCAGCCACCGCGGCTACCACCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    794         TCACCGTGACCCCCTCGGGACAGATCACGACCTCGGGGGCAC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113883 TG...CAGTCACCGTGACCCCCTCGGGACAGATCACGACCTCGGGGGCAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    836 TGACCTTTGACCGAGCGTCCACGGTAGAGGCCACTGCTGTCATATCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115070 TGACCTTTGACCGAGCGTCCACGGTAGAGGCCACTGCTGTCATATCAGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    886 AGTCCGGCCCAGGGCGACGTCTTCGCAGGGGCCACAG         TCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 115120 AGTCCGGCCCAGGGCGACGTCTTCGCAGGGGCCACAGGTG...CAGTCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    927 AGAGGCCAGCGTGCAGCCCCCATGCAGGGCCAGCCACCCTGAGCCTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116026 AGAGGCCAGCGTGCAGCCCCCATGCAGGGCCAGCCACCCTGAGCCTCACT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    977 ACCCCGGCTATCAGGACAGCTGCCAGATCGCACCGTTTCCAGAAGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116076 ACCCCGGCTATCAGGACAGCTGCCAGATCGCACCGTTTCCAGAAGCTGCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1027 TTGCCAACGTCACATCCCAAAATAG         TGTTGACATCCCTGCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 116126 TTGCCAACGTCACATCCCAAAATAGGTA...TAGTGTTGACATCCCTGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1068 TGCGCTGGCGGTCCCACCCCCGACTCCCACCAAAGCGGCACCTCCCGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120077 TGCGCTGGCGGTCCCACCCCCGACTCCCACCAAAGCGGCACCTCCCGCGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1118 TGGTCAATGGGCTGGAGCTGTCAGAGCCGCGGAGCTGGCTGTACCTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120127 TGGTCAATGGGCTGGAGCTGTCAGAGCCGCGGAGCTGGCTGTACCTAGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1168 GAGATGGTCAACTCCTTGCTCAACACAGCGCAGCAGCTGAAGACGCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120177 GAGATGGTCAACTCCTTGCTCAACACAGCGCAGCAGCTGAAGACGCTGTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1218 TGAGCAAGCCAAGCATGCCAGCACCTACCGAGAAGCTGCCACAAACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120227 TGAGCAAGCCAAGCATGCCAGCACCTACCGAGAAGCTGCCACAAACCAGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1268 CCAAGATCCACGCTGACGCAGAGCGGAAGGAG         CAGTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 120277 CCAAGATCCACGCTGACGCAGAGCGGAAGGAGGTA...CAGCAGTCCTGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1309 GTTAACTGCGGCCGGGAGGCTATGAGCGAGTGCACCGGCTGCCACAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140802 GTTAACTGCGGCCGGGAGGCTATGAGCGAGTGCACCGGCTGCCACAAGGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1359 CAACTACTGCTCCACCTTCTGCCAACGCAAG         GACTGGAAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 140852 CAACTACTGCTCCACCTTCTGCCAACGCAAGGTA...CAGGACTGGAAGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1400 ATCACCAGCACATATGCGGCCAGTCAGCAGCTGTCACCGTCCAGGCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150200 ATCACCAGCACATATGCGGCCAGTCAGCAGCTGTCACCGTCCAGGCAGAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :
   1450 GAAGTCCACGTGGCTGAAAGCGTGATGGAGAAGGTGACCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150250 GAAGTCCACGTGGCTGAAAGCGTGATGGAGAAGGTGACCGTG