seq1 = pF1KB8134.tfa, 846 bp
seq2 = pF1KB8134/gi568815579f_49830851.tfa (gi568815579f:49830851_50033089), 202239 bp

>pF1KB8134 846
>gi568815579f:49830851_50033089 (Chr19)

1-178  (100001-100178)   100% ->
179-846  (101572-102239)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCACTCCTGGCGACCCTGGGGCTGGAGCTGGACAGGGCCCTGCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCACTCCTGGCGACCCTGGGGCTGGAGCTGGACAGGGCCCTGCTCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCTAGTGGGCTGGGATGGCTCGTAGACTATGGGAAACTCCCCCCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCTAGTGGGCTGGGATGGCTCGTAGACTATGGGAAACTCCCCCCGGCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGCCCCCCTGGCTCCCTATGAGGTCCTTGGGGGAGCCCTGGAGGGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGCCCCCCTGGCTCCCTATGAGGTCCTTGGGGGAGCCCTGGAGGGCGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTTCCAGTGGGGGGAGAGCCCCTGGCAG         GTGATGGCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100151 CTTCCAGTGGGGGGAGAGCCCCTGGCAGGTA...CAGGTGATGGCTTCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGACTGGATGACTGAGCGAGTTGATTTCACAGCTCTCCTCCCTCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101585 TGACTGGATGACTGAGCGAGTTGATTTCACAGCTCTCCTCCCTCTGGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTCCCTTACCCCCCGGCACCCTCCCCCAACCTTCCCCAACCCCACCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101635 CTCCCTTACCCCCCGGCACCCTCCCCCAACCTTCCCCAACCCCACCTGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGGAAGCTATGGCCTCCCTCCTCAAGAAGGAGCTGGAACAGATGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101685 CTGGAAGCTATGGCCTCCCTCCTCAAGAAGGAGCTGGAACAGATGGAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTTCTTCCTAGATGCCCCGCCCCTCCCACCACCCTCCCCGCCGCCACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101735 CTTCTTCCTAGATGCCCCGCCCCTCCCACCACCCTCCCCGCCGCCACTAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CACCACCACCACTACCACCAGCCCCCTCCCTCCCCCTGTCCCTCCCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101785 CACCACCACCACTACCACCAGCCCCCTCCCTCCCCCTGTCCCTCCCCTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTTGACCTCCCCCAGCCCCCTGTCTTGGATACTCTGGACTTGCTGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101835 TTTGACCTCCCCCAGCCCCCTGTCTTGGATACTCTGGACTTGCTGGCCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CTACTGCCGCAACGAGGCCGGGCAGGAGGAAGTGGGGATGCCGCCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101885 CTACTGCCGCAACGAGGCCGGGCAGGAGGAAGTGGGGATGCCGCCTCTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CCCCGCCACAGCAGCCCCCTCCTCCTTCTCCACCTCAACCTTCTCGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101935 CCCCGCCACAGCAGCCCCCTCCTCCTTCTCCACCTCAACCTTCTCGCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCCCCCTACCCACATCCTGCCACCACCCGAGGGGACCGCAAGCAAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101985 GCCCCCTACCCACATCCTGCCACCACCCGAGGGGACCGCAAGCAAAAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GAGAGACCAGAACAAGTCGGCGGCTCTGAGGTACCGCCAGCGGAAGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102035 GAGAGACCAGAACAAGTCGGCGGCTCTGAGGTACCGCCAGCGGAAGCGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CAGAGGGTGAGGCCCTGGAGGGCGAGTGCCAGGGGCTGGAGGCACGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102085 CAGAGGGTGAGGCCCTGGAGGGCGAGTGCCAGGGGCTGGAGGCACGGAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CGCGAGCTGAAGGAACGGGCAGAGTCCGTGGAGCGCGAGATCCAGTACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102135 CGCGAGCTGAAGGAACGGGCAGAGTCCGTGGAGCGCGAGATCCAGTACGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CAAGGACCTGCTCATCGAGGTTTACAAGGCCCGGAGCCAGAGGACCCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102185 CAAGGACCTGCTCATCGAGGTTTACAAGGCCCGGAGCCAGAGGACCCGTA

    850     .
    842 GCTGC
        |||||
 102235 GCTGC