seq1 = pF1KB8130.tfa, 1341 bp
seq2 = pF1KB8130/gi568815594r_6223305.tfa (gi568815594r:6223305_6481846), 258542 bp

>pF1KB8130 1341
>gi568815594r:6223305_6481846 (Chr4)

(complement)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-168  (100753-100850)   100% ->
169-334  (103275-103440)   100% ->
335-447  (105916-106028)   100% ->
448-625  (109147-109324)   100% ->
626-790  (133837-134001)   100% ->
791-960  (148116-148285)   100% ->
961-1052  (152494-152585)   100% ->
1053-1341  (158254-158542)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCTGTCTTTTTTCTCCAAACACTTGCCCATCCAGGAAGGCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGCTGTCTTTTTTCTCCAAACACTTGCCCATCCAGGAAGGCCAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGGGCATTGAAGACTCCAG         CTGACATCATCTCTACCGTTG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 CTGGGCATTGAAGACTCCAGGTA...CAGCTGACATCATCTCTACCGTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGTTCAACCACACGGGAGAGCTGCTGGCCACAGGTGACAAGGGCGGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100774 AGTTCAACCACACGGGAGAGCTGCTGGCCACAGGTGACAAGGGCGGCCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTCGTCATCTTCCAGCGGGAACCAGAG         AGTAAAAATGCGCC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100824 GTCGTCATCTTCCAGCGGGAACCAGAGGTG...CAGAGTAAAAATGCGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCACAGCCAGGGCGAATACGACGTGTACAGCACTTTCCAGAGCCACGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103289 CCACAGCCAGGGCGAATACGACGTGTACAGCACTTTCCAGAGCCACGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CGGAGTTTGACTATCTCAAGAGCCTGGAGATAGAGGAGAAGATCAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103339 CGGAGTTTGACTATCTCAAGAGCCTGGAGATAGAGGAGAAGATCAACAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATCAAGTGGCTCCCACAGCAGAACGCCGCCCACTCACTCCTGTCCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103389 ATCAAGTGGCTCCCACAGCAGAACGCCGCCCACTCACTCCTGTCCACCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CG         ATAAAACTATCAAATTATGGAAGATTACCGAACGAGATA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103439 CGGTG...AAGATAAAACTATCAAATTATGGAAGATTACCGAACGAGATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAAGGCCCGAAGGATACAACCTGAAGGATGAAGAGGGGAAACTTAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105955 AAAGGCCCGAAGGATACAACCTGAAGGATGAAGAGGGGAAACTTAAGGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTGTCCACGGTGACGTCACTGCAG         GTGCCAGTGCTGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 106005 CTGTCCACGGTGACGTCACTGCAGGTG...CAGGTGCCAGTGCTGAAGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CATGGATCTGATGGTGGAGGTGAGCCCTCGGAGGATCTTTGCCAATGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109164 CATGGATCTGATGGTGGAGGTGAGCCCTCGGAGGATCTTTGCCAATGGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACACCTACCACATCAACTCCATCTCCGTCAACAGTGACTGCGAGACCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109214 ACACCTACCACATCAACTCCATCTCCGTCAACAGTGACTGCGAGACCTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATGTCGGCGGATGACCTGCGCATCAACCTCTGGCACCTGGCCATCACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109264 ATGTCGGCGGATGACCTGCGCATCAACCTCTGGCACCTGGCCATCACCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CAGGAGCTTCA         ACATCGTGGACATCAAGCCGGCCAACATGG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 109314 CAGGAGCTTCAGTA...CAGACATCGTGGACATCAAGCCGGCCAACATGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGGACCTTACGGAGGTGATCACAGCATCTGAGTTCCATCCGCACCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133867 AGGACCTTACGGAGGTGATCACAGCATCTGAGTTCCATCCGCACCACTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AACCTCTTCGTCTACAGCAGCAGCAAGGGCTCCCTGCGGCTCTGCGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133917 AACCTCTTCGTCTACAGCAGCAGCAAGGGCTCCCTGCGGCTCTGCGACAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GCGGGCAGCTGCCCTGTGTGACAAGCATTCCAAGC         TCTTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 133967 GCGGGCAGCTGCCCTGTGTGACAAGCATTCCAAGCGTA...CAGTCTTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AAGAGCCTGAGGACCCCAGTAACCGCTCATTCTTCTCGGAAATCATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148122 AAGAGCCTGAGGACCCCAGTAACCGCTCATTCTTCTCGGAAATCATCTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TCCGTGTCCGACGTGAAGTTCAGCCACAGCGGCCGCTACATGCTCACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148172 TCCGTGTCCGACGTGAAGTTCAGCCACAGCGGCCGCTACATGCTCACCCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GGACTACCTTACAGTCAAGGTCTGGGACCTGAACATGGAGGCAAGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148222 GGACTACCTTACAGTCAAGGTCTGGGACCTGAACATGGAGGCAAGACCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TAGAGACCTACCAG         GTCCATGACTACCTTCGGAGCAAGCTC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 148272 TAGAGACCTACCAGGTG...CAGGTCCATGACTACCTTCGGAGCAAGCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TGTTCCCTGTACGAGAACGACTGCATTTTCGACAAGTTTGAATGTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152521 TGTTCCCTGTACGAGAACGACTGCATTTTCGACAAGTTTGAATGTGCCTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GAACGGGAGCGACAG         CGTCATCATGACCGGGGCCTACAACA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 152571 GAACGGGAGCGACAGGTA...CAGCGTCATCATGACCGGGGCCTACAACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 ACTTCTTCCGCATGTTCGATCGGAACACCAAGCGGGACGTGACCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158280 ACTTCTTCCGCATGTTCGATCGGAACACCAAGCGGGACGTGACCCTGGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GCCTCGAGGGAAAGCAGCAAGCCCCGGGCTGTGCTCAAGCCACGGCGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158330 GCCTCGAGGGAAAGCAGCAAGCCCCGGGCTGTGCTCAAGCCACGGCGCGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GTGCGTGGGGGGCAAGCGCCGGCGTGATGACATCAGTGTGGACAGCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158380 GTGCGTGGGGGGCAAGCGCCGGCGTGATGACATCAGTGTGGACAGCTTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 ACTTCACCAAGAAGATCCTGCACACGGCCTGGCACCCGGCTGAGAACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158430 ACTTCACCAAGAAGATCCTGCACACGGCCTGGCACCCGGCTGAGAACATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 ATTGCCATCGCCGCCACCAACAACCTGTACATCTTCCAGGACAAGGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158480 ATTGCCATCGCCGCCACCAACAACCTGTACATCTTCCAGGACAAGGTAAA

   1400     .    :
   1329 CTCTGACATGCAC
        |||||||||||||
 158530 CTCTGACATGCAC