seq1 = pF1KB8129.tfa, 1023 bp
seq2 = pF1KB8129/gi568815587r_6377116.tfa (gi568815587r:6377116_6580421), 203306 bp

>pF1KB8129 1023
>gi568815587r:6377116_6580421 (Chr11)

(complement)

1-99  (100001-100099)   100% ->
100-196  (100354-100450)   100% ->
197-315  (101164-101282)   100% ->
316-537  (101463-101684)   100% ->
538-695  (102224-102381)   100% ->
696-870  (102530-102704)   100% ->
871-1023  (103154-103306)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGGACGGGATCCTAGGGAAGGCAGCCACAATGGAGATCCCTATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACGGACGGGATCCTAGGGAAGGCAGCCACAATGGAGATCCCTATCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGGAACGGCGAAGCCAGGCAGCTTCCTGAAGATGATGGGCTGGAGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100051 CGGGAACGGCGAAGCCAGGCAGCTTCCTGAAGATGATGGGCTGGAGCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100         GACCTCCAGCAGGTGATGGTGTCAGGACCCAACCTCAATGAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TG...TAGGACCTCCAGCAGGTGATGGTGTCAGGACCCAACCTCAATGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCAGCATTGTGTCTGGTGGCTATGGGGGCTCTGGTGATGGACTCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100396 ACCAGCATTGTGTCTGGTGGCTATGGGGGCTCTGGTGATGGACTCATCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CACAG         GGTCTGGCCGCCATCCATCTCACAGCACCACTCCTT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100446 CACAGGTA...TAGGGTCTGGCCGCCATCCATCTCACAGCACCACTCCTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGGCCCTGGAGATGAGGTGGCTCGGGGCATTGCTGGAGAAAAGTTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101200 CTGGCCCTGGAGATGAGGTGGCTCGGGGCATTGCTGGAGAAAAGTTTGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATCGTCAAGAAATGGGGCATCAACACCTATAAG         TGCACAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101250 ATCGTCAAGAAATGGGGCATCAACACCTATAAGGTA...CAGTGCACAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCAACTGTTATCAGAACGATTTGGTCGAGGCTCACGGACTGTGGACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101471 GCAACTGTTATCAGAACGATTTGGTCGAGGCTCACGGACTGTGGACCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGCTAGAGCTGCAGATTGAGTTGCTGCGTGAGACGAAGCGCAAGTATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101521 AGCTAGAGCTGCAGATTGAGTTGCTGCGTGAGACGAAGCGCAAGTATGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGTGTCCTGCAGCTGGGCCGGGCACTGACAGCCCACCTCTACAGCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101571 AGTGTCCTGCAGCTGGGCCGGGCACTGACAGCCCACCTCTACAGCCTGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCAGACCCAGCATGCACTGGGTGATGCCTTTGCTGACCTCAGCCAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101621 GCAGACCCAGCATGCACTGGGTGATGCCTTTGCTGACCTCAGCCAGAAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCCCAGAGCTTCAG         GAGGAATTTGGCTACAATGCAGAGACA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 101671 CCCCAGAGCTTCAGGTG...CAGGAGGAATTTGGCTACAATGCAGAGACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CAGAAACTACTATGCAAGAATGGGGAAACGCTGCTAGGAGCCGTGAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102251 CAGAAACTACTATGCAAGAATGGGGAAACGCTGCTAGGAGCCGTGAACTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CTTTGTCTCTAGCATCAACACATTGGTCACCAAGACCATGGAAGACACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102301 CTTTGTCTCTAGCATCAACACATTGGTCACCAAGACCATGGAAGACACGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCATGACTGTGAAACAGTATGAGGCTGCCAG         GCTGGAATAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 102351 TCATGACTGTGAAACAGTATGAGGCTGCCAGGTG...CAGGCTGGAATAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GATGCCTACCGAACAGACTTAGAGGAGCTGAGTCTAGGCCCCCGGGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102540 GATGCCTACCGAACAGACTTAGAGGAGCTGAGTCTAGGCCCCCGGGATGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AGGGACACGTGGTCGACTTGAGAGTGCCCAGGCCACTTTCCAGGCCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102590 AGGGACACGTGGTCGACTTGAGAGTGCCCAGGCCACTTTCCAGGCCCATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GGGACAAGTATGAGAAGCTGCGGGGAGATGTGGCCATCAAGCTCAAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102640 GGGACAAGTATGAGAAGCTGCGGGGAGATGTGGCCATCAAGCTCAAGTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTGGAAGAAAACAAG         ATCAAGGTGATGCACAAGCAGCTGCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 102690 CTGGAAGAAAACAAGGTG...CAGATCAAGGTGATGCACAAGCAGCTGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GCTCTTCCACAATGCTGTGTCCGCCTACTTTGCTGGGAACCAGAAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103180 GCTCTTCCACAATGCTGTGTCCGCCTACTTTGCTGGGAACCAGAAACAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TGGAGCAGACCCTGCAGCAGTTCAACATCAAGCTGCGGCCTCCAGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103230 TGGAGCAGACCCTGCAGCAGTTCAACATCAAGCTGCGGCCTCCAGGAGCT

   1050     .    :    .    :    .
    997 GAGAAACCCTCCTGGCTAGAGGAGCAG
        |||||||||||||||||||||||||||
 103280 GAGAAACCCTCCTGGCTAGAGGAGCAG