seq1 = pF1KB8126.tfa, 1659 bp
seq2 = pF1KB8126/gi568815580r_45984285.tfa (gi568815580r:45984285_46198231), 213947 bp

>pF1KB8126 1659
>gi568815580r:45984285_46198231 (Chr18)

(complement)

1-60  (100001-100060)   100% ->
61-139  (103101-103179)   100% ->
140-309  (106381-106550)   100% ->
310-483  (108236-108409)   100% ->
484-650  (108500-108666)   100% ->
651-799  (109975-110123)   100% ->
800-951  (110740-110891)   100% ->
952-1176  (111000-111224)   100% ->
1177-1284  (111738-111845)   100% ->
1285-1429  (111975-112119)   100% ->
1430-1580  (113578-113728)   100% ->
1581-1659  (113869-113947)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGTCCGTGCGCGTTGCTGCGGCCGTGGTCCGCGCCCTTCCTCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGTCCGTGCGCGTTGCTGCGGCCGTGGTCCGCGCCCTTCCTCGGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCGGACTG         GTCTCCAGAAATGCTTTGGGTTCATCTTTCA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCGGACTGGTG...TAGGTCTCCAGAAATGCTTTGGGTTCATCTTTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGCTGCAAGGAACTTCCATGCCTCTAACACTCATCTTCAAAAGACTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 103132 TTGCTGCAAGGAACTTCCATGCCTCTAACACTCATCTTCAAAAGACTGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    140        GGACTGCTGAGATGTCCTCTATTCTTGAAGAGCGTATTCTTGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103182 A...TAGGGACTGCTGAGATGTCCTCTATTCTTGAAGAGCGTATTCTTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGCTGATACCTCTGTTGATCTTGAAGAAACTGGGCGTGTCTTAAGTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106424 AGCTGATACCTCTGTTGATCTTGAAGAAACTGGGCGTGTCTTAAGTATTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTGATGGTATTGCCCGCGTACATGGGCTGAGGAATGTTCAAGCAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106474 GTGATGGTATTGCCCGCGTACATGGGCTGAGGAATGTTCAAGCAGAAGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATGGTAGAGTTTTCTTCAGGCTTAAAG         GGTATGTCCTTGAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 106524 ATGGTAGAGTTTTCTTCAGGCTTAAAGGTA...CAGGGTATGTCCTTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTTGGAACCTGACAATGTTGGTGTTGTCGTGTTTGGAAATGATAAACTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108250 CTTGGAACCTGACAATGTTGGTGTTGTCGTGTTTGGAAATGATAAACTAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTAAGGAAGGAGATATAGTGAAGAGGACAGGAGCCATTGTGGACGTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108300 TTAAGGAAGGAGATATAGTGAAGAGGACAGGAGCCATTGTGGACGTTCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTTGGTGAGGAGCTGTTGGGTCGTGTAGTTGATGCCCTTGGTAATGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108350 GTTGGTGAGGAGCTGTTGGGTCGTGTAGTTGATGCCCTTGGTAATGCTAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGATGGAAAG         GGTCCAATTGGTTCCAAGACGCGTAGGCGAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 108400 TGATGGAAAGGTA...CAGGGTCCAATTGGTTCCAAGACGCGTAGGCGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTGGTCTGAAAGCCCCCGGTATCATTCCTCGAATTTCAGTGCGGGAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108531 TTGGTCTGAAAGCCCCCGGTATCATTCCTCGAATTTCAGTGCGGGAACCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATGCAGACTGGCATTAAGGCTGTGGATAGCTTGGTGCCAATTGGTCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108581 ATGCAGACTGGCATTAAGGCTGTGGATAGCTTGGTGCCAATTGGTCGTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TCAGCGTGAACTGATTATTGGTGACCGACAGACTGG         GAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 108631 TCAGCGTGAACTGATTATTGGTGACCGACAGACTGGGTA...AAGGAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCTCAATTGCTATTGACACAATCATTAACCAGAAACGTTTCAATGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109980 CCTCAATTGCTATTGACACAATCATTAACCAGAAACGTTTCAATGATGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TCTGATGAAAAGAAGAAGCTGTACTGTATTTATGTTGCTATTGGTCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110030 TCTGATGAAAAGAAGAAGCTGTACTGTATTTATGTTGCTATTGGTCAAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GAGATCCACTGTTGCCCAGTTGGTGAAGAGACTTACAGATGCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 110080 GAGATCCACTGTTGCCCAGTTGGTGAAGAGACTTACAGATGCAGGTA...

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    800    ATGCCATGAAGTACACCATTGTGGTGTCGGCTACGGCCTCGGATGCT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110737 CAGATGCCATGAAGTACACCATTGTGGTGTCGGCTACGGCCTCGGATGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GCCCCACTTCAGTACCTGGCTCCTTACTCTGGCTGTTCCATGGGAGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110787 GCCCCACTTCAGTACCTGGCTCCTTACTCTGGCTGTTCCATGGGAGAGTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TTTTAGAGACAATGGCAAACATGCTTTGATCATCTATGACGACTTATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110837 TTTTAGAGACAATGGCAAACATGCTTTGATCATCTATGACGACTTATCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AACAG         GCTGTTGCTTACCGTCAGATGTCTCTGTTGCTCCGC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110887 AACAGGTC...TAGGCTGTTGCTTACCGTCAGATGTCTCTGTTGCTCCGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CGACCCCCTGGTCGTGAGGCCTATCCTGGTGATGTGTTCTACCTACACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111036 CGACCCCCTGGTCGTGAGGCCTATCCTGGTGATGTGTTCTACCTACACTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CCGGTTGCTGGAGAGAGCAGCCAAAATGAACGATGCTTTTGGTGGTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111086 CCGGTTGCTGGAGAGAGCAGCCAAAATGAACGATGCTTTTGGTGGTGGCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CCTTGACTGCTTTGCCAGTCATAGAAACACAGGCTGGTGATGTGTCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111136 CCTTGACTGCTTTGCCAGTCATAGAAACACAGGCTGGTGATGTGTCTGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 TACATTCCAACAAATGTCATTTCCATCACTGACGGACAG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 111186 TACATTCCAACAAATGTCATTTCCATCACTGACGGACAGGTA...TAGAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CTTCTTGGAAACAGAATTGTTCTACAAAGGTATCCGCCCTGCAATTAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111740 CTTCTTGGAAACAGAATTGTTCTACAAAGGTATCCGCCCTGCAATTAACG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TTGGTCTGTCTGTATCTCGTGTCGGATCCGCTGCCCAAACCAGGGCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111790 TTGGTCTGTCTGTATCTCGTGTCGGATCCGCTGCCCAAACCAGGGCTATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 AAGCAG         GTAGCAGGTACCATGAAGCTGGAATTGGCTCAGTA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111840 AAGCAGGTA...CAGGTAGCAGGTACCATGAAGCTGGAATTGGCTCAGTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TCGTGAGGTTGCTGCTTTTGCCCAGTTCGGTTCTGACCTCGATGCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112010 TCGTGAGGTTGCTGCTTTTGCCCAGTTCGGTTCTGACCTCGATGCTGCCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CTCAACAACTTTTGAGTCGTGGCGTGCGTCTAACTGAGTTGCTGAAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112060 CTCAACAACTTTTGAGTCGTGGCGTGCGTCTAACTGAGTTGCTGAAGCAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GGACAGTATT         CTCCCATGGCTATTGAAGAACAAGTGGCTGT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 112110 GGACAGTATTGTA...CAGCTCCCATGGCTATTGAAGAACAAGTGGCTGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 TATCTATGCGGGTGTAAGGGGATATCTTGATAAACTGGAGCCCAGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113609 TATCTATGCGGGTGTAAGGGGATATCTTGATAAACTGGAGCCCAGCAAGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TTACAAAGTTTGAGAATGCTTTCTTGTCTCATGTCGTCAGCCAGCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113659 TTACAAAGTTTGAGAATGCTTTCTTGTCTCATGTCGTCAGCCAGCACCAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 GCCTTGTTGGGCACTATCAG         GGCTGATGGAAAGATCTCAGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 113709 GCCTTGTTGGGCACTATCAGGTA...TAGGGCTGATGGAAAGATCTCAGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 ACAATCAGATGCAAAGCTGAAAGAGATTGTAACAAATTTCTTGGCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113890 ACAATCAGATGCAAAGCTGAAAGAGATTGTAACAAATTTCTTGGCTGGAT

   1750     .
   1652 TTGAAGCT
        ||||||||
 113940 TTGAAGCT