seq1 = pF1KB8121.tfa, 960 bp
seq2 = pF1KB8121/gi568815580r_32312217.tfa (gi568815580r:32312217_32513176), 200960 bp

>pF1KB8121 960
>gi568815580r:32312217_32513176 (Chr18)

(complement)

1-960  (100001-100960)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTAAGTCAGAGTCTCCTAAAGAGCCCGAACAGCTGAGGAAGCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTAAGTCAGAGTCTCCTAAAGAGCCCGAACAGCTGAGGAAGCTCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATTGGAGGGTTGAGCTTTGAAACAACTGATGAGAGCCTGAGGAGCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATTGGAGGGTTGAGCTTTGAAACAACTGATGAGAGCCTGAGGAGCCATT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGAGCAATGGGGAACGCTCACGGACTGTGTGGTAATGAGAGATCCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTGAGCAATGGGGAACGCTCACGGACTGTGTGGTAATGAGAGATCCAAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCAAGCGCTCCAGGGGCTTTGGGTTTGTCACATATGCCACTGTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACCAAGCGCTCCAGGGGCTTTGGGTTTGTCACATATGCCACTGTGGAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGTGGATGCAGCTATGAATGCAAGGCCACACAAGGTGGATGGAAGAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGTGGATGCAGCTATGAATGCAAGGCCACACAAGGTGGATGGAAGAGTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGAACCAAAGAGAGCTGTCTCCAGAGAAGATTCTCAAAGACCAGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGAACCAAAGAGAGCTGTCTCCAGAGAAGATTCTCAAAGACCAGGTGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CACTTAACTGTGAAAAAGATATTTGTTGGTGGCATTAAAGAAGACACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CACTTAACTGTGAAAAAGATATTTGTTGGTGGCATTAAAGAAGACACTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGAACATCACCTAAGAGATTATTTTGAACAGTATGGAAAAATTGAAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGAACATCACCTAAGAGATTATTTTGAACAGTATGGAAAAATTGAAGTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTGAAATCATGACTGACCGAGGCAGTGGCAAGAAAAGGGGCTTTGCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTGAAATCATGACTGACCGAGGCAGTGGCAAGAAAAGGGGCTTTGCCTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTAACCTTTGACGACCATGACTCCGTGGATAAGATTGTCATTCAGAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTAACCTTTGACGACCATGACTCCGTGGATAAGATTGTCATTCAGAAATA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCATACTGTGAATGGCCACAACTGTGAAGTTAGAAAAGCCCTGTCAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCATACTGTGAATGGCCACAACTGTGAAGTTAGAAAAGCCCTGTCAAAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AAGAGATGGCTAGTGCTTCATCCAGCCAAAGAGGTCGAAGTGGTTCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AAGAGATGGCTAGTGCTTCATCCAGCCAAAGAGGTCGAAGTGGTTCTGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AACTTTGGTGGTGGTCGTGGAGGTGGTTTCGGTGGGAATGACAACTTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AACTTTGGTGGTGGTCGTGGAGGTGGTTTCGGTGGGAATGACAACTTCGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TCGTGGAGGAAACTTCAGTGGTCGTGGTGGCTTTGGTGGCAGCCGTGGTG
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100651 TCATGGAGGAAACTTCAGTGGTCGTGGTGGCTTTGGTGGCAGCCGTGCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GTGGTGGATATGGTGGCAGTGGGGATGGCTATAATGGATTTGGTAATGAT
        ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 100701 GTGGTAGATATGGTGGCAGTGGGGATGGCTCTAATGGATTTGGTAATGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGAAGCAATTTTGGAGGTGGTGGAAGCTACAATGATTTTGGGAATTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100751 GGAAGCAATTTTGGAGGTGGTGGAAGCTACAATGATTTTGGCAATTACAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAATCAGTCTTCAAATTTTGGACCCATGAAGGGAGGAAATTTTGGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAATCAGTCTTCAAATTTTGGACCCATGAAGGGAGGAAATTTTGGAGGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GAAGCTCTGGCCCCTATGGCGGTGGAGGCCAATACTTTGCAAAACCACGA
        ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 100851 GAAACTCTGGCCCCTATGGCGGTGGAGGCCAGTACTTTGCAAAACCACGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AACCAAGGTGGCTATGGCGGTTCCAGCAGCAGCAGTAGCTATGGCAGTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
 100901 AACCAAGGTGGCTATGGCGGTTCCAGCAGCAGCAGTAGCTGTGTCAGTGG

    950     .    :
    951 CAGAAGATTT
        ||||||||||
 100951 CAGAAGATTT