seq1 = pF1KB8119.tfa, 660 bp
seq2 = pF1KB8119/gi568815597r_167446100.tfa (gi568815597r:167446100_167653741), 207642 bp

>pF1KB8119 660
>gi568815597r:167446100_167653741 (Chr1)

(complement)

1-354  (100001-100354)   100% ->
355-474  (105621-105740)   100% ->
475-660  (107457-107642)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGGGCTATCCCGCGGGTCCGCGCGCGCACTGCTCGCCGCCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGGGCTATCCCGCGGGTCCGCGCGCGCACTGCTCGCCGCCCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGTCGACGCTGTTGGCGCTGCTCGTGTCGCCCGCGCGGGGTCGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGTCGACGCTGTTGGCGCTGCTCGTGTCGCCCGCGCGGGGTCGCGGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCGGGACCACGGGGACTGGGACGAGGCCTCCCGGCTGCCGCCGCTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCGGGACCACGGGGACTGGGACGAGGCCTCCCGGCTGCCGCCGCTACCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCCGCGAGGACGCGGCGCGCGTGGCCCGCTTCGTGACGCACGTCTCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCCGCGAGGACGCGGCGCGCGTGGCCCGCTTCGTGACGCACGTCTCCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTGGGGCGCTCTGGCCACCATCTCCACGCTGGAGGCGGTGCGCGGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTGGGGCGCTCTGGCCACCATCTCCACGCTGGAGGCGGTGCGCGGCCGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCTTCGCCGACGTCCTCTCGCTCAGCGACGGGCCCCCGGGCGCGGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCTTCGCCGACGTCCTCTCGCTCAGCGACGGGCCCCCGGGCGCGGGCAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCGTGCCCTATTTCTACCTGAGCCCGCTGCAGCTCTCCGTGAGCAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCGTGCCCTATTTCTACCTGAGCCCGCTGCAGCTCTCCGTGAGCAACCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCAG         GAGAATCCATATGCTACACTGACCATGACTTTGGCAC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCAGGTG...TAGGAGAATCCATATGCTACACTGACCATGACTTTGGCAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGACCAACTTCTGCAAGAAACATGGATTTGATCCACAAAGTCCCCTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105658 AGACCAACTTCTGCAAGAAACATGGATTTGATCCACAAAGTCCCCTTTGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GTTCACATAATGCTGTCAGGAACTGTGACCAAG         GTGAATGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 105708 GTTCACATAATGCTGTCAGGAACTGTGACCAAGGTA...TAGGTGAATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AACAGAAATGGATATTGCAAAGCATTCGTTATTCATTCGACACCCTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107465 AACAGAAATGGATATTGCAAAGCATTCGTTATTCATTCGACACCCTGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGAAAACCTGGCCTTCCAGCCATAATTGGTTCTTTGCTAAGTTGAATATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107515 TGAAAACCTGGCCTTCCAGCCATAATTGGTTCTTTGCTAAGTTGAATATA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ACCAATATCTGGGTCCTGGACTACTTTGGTGGACCAAAAATCGTGACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107565 ACCAATATCTGGGTCCTGGACTACTTTGGTGGACCAAAAATCGTGACACC

    650     .    :    .    :    .
    633 AGAAGAATATTATAATGTCACAGTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||
 107615 AGAAGAATATTATAATGTCACAGTTCAG