seq1 = pF1KB8117.tfa, 1473 bp
seq2 = pF1KB8117/gi568815581r_74762820.tfa (gi568815581r:74762820_74972944), 210125 bp

>pF1KB8117 1473
>gi568815581r:74762820_74972944 (Chr17)

(complement)

1-79  (100001-100079)   100% ->
80-177  (100812-100909)   100% ->
178-270  (106069-106161)   100% ->
271-393  (106377-106499)   99% ->
394-507  (106701-106814)   100% ->
508-609  (107125-107226)   100% ->
610-717  (108014-108121)   100% ->
718-802  (108381-108465)   100% ->
803-1002  (108598-108797)   100% ->
1003-1174  (108878-109049)   100% ->
1175-1345  (109699-109869)   100% ->
1346-1473  (109998-110125)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTTCGCGCTGCTGGCGCTGGTGGGGCTGGTCGGCGTGGCCTCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTTCGCGCTGCTGGCGCTGGTGGGGCTGGTCGGCGTGGCCTCGGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGCTGCCTCCCGCCGGGAGCACCCCGA         GCTTCTGCCACC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100051 CCGGCTGCCTCCCGCCGGGAGCACCCCGAGTA...CAGGCTTCTGCCACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATTTCTCCACACAGGAGAAGACCCCCCAGATCTGTGTGGTGGGCAGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100824 ATTTCTCCACACAGGAGAAGACCCCCCAGATCTGTGTGGTGGGCAGTGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCAGCTGGCTTCTACACGGCCCAACACCTGCTAAAG         CACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100874 CCAGCTGGCTTCTACACGGCCCAACACCTGCTAAAGGTA...CAGCACCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCAGGCCCACGTGGACATCTACGAGAAACAGCCTGTGCCCTTTGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106074 CCAGGCCCACGTGGACATCTACGAGAAACAGCCTGTGCCCTTTGGCCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGCGCTTTGGTGTGGCGCCTGATCACCCCGAGGTGAAG         AAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 106124 TGCGCTTTGGTGTGGCGCCTGATCACCCCGAGGTGAAGGTG...CAGAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GTCATCAACACATTTACCCAGACGGCCCATTCTGGCCGCTGTGCCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106380 GTCATCAACACATTTACCCAGACGGCCCATTCTGGCCGCTGTGCCTTCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGGCAACGTGGAGGTGGGCAGGGACGTGACGGTGCCGGAGCTGCGGGAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 106430 GGGCAACGTGGAGGTGGGCAGGGACGTGACGGTGCCGGAGCTGCAGGAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCTACCACGCTGTGGTGCTG         AGCTACGGGGCAGAGGACCAT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 106480 CCTACCACGCTGTGGTGCTGGTG...CAGAGCTACGGGGCAGAGGACCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CGGGCCCTGGAAATTCCTGGTGAGGAGCTGCCAGGTGTGTGCTCCGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106722 CGGGCCCTGGAAATTCCTGGTGAGGAGCTGCCAGGTGTGTGCTCCGCCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGCCTTCGTGGGCTGGTACAACGGGCTTCCTGAGAACCAGGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 106772 GGCCTTCGTGGGCTGGTACAACGGGCTTCCTGAGAACCAGGAGGTG...C

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    508   CTGGAGCCAGACCTGAGCTGTGACACAGCCGTGATTCTGGGGCAGGGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107123 AGCTGGAGCCAGACCTGAGCTGTGACACAGCCGTGATTCTGGGGCAGGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AACGTGGCTCTGGACGTGGCCCGCATCCTACTGACCCCACCTGAGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107173 AACGTGGCTCTGGACGTGGCCCGCATCCTACTGACCCCACCTGAGCACCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GGAG         AGAACGGACATCACGAAGGCAGCCCTGGGTGTACTGA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107223 GGAGGTG...CAGAGAACGGACATCACGAAGGCAGCCCTGGGTGTACTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GGCAGAGTCGAGTGAAGACAGTGTGGCTAGTGGGCCGGCGTGGACCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108051 GGCAGAGTCGAGTGAAGACAGTGTGGCTAGTGGGCCGGCGTGGACCCCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CAAGTGGCCTTCACCATTAAG         GAGCTTCGGGAGATGATTCA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 108101 CAAGTGGCCTTCACCATTAAGGTG...AAGGAGCTTCGGGAGATGATTCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GTTACCGGGAGCCCGGCCCATTTTGGATCCTGTGGATTTCTTGGGTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108401 GTTACCGGGAGCCCGGCCCATTTTGGATCCTGTGGATTTCTTGGGTCTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AGGACAAGATCAAGG         AGGTCCCCCGCCCGAGGAAGCGGCTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 108451 AGGACAAGATCAAGGGTG...CAGAGGTCCCCCGCCCGAGGAAGCGGCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 ACGGAACTGCTGCTTCGAACGGCCACAGAGAAGCCAGGGCCGGCGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108624 ACGGAACTGCTGCTTCGAACGGCCACAGAGAAGCCAGGGCCGGCGGAAGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TGCCCGCCAGGCATCGGCCTCCCGTGCCTGGGGCCTCCGCTTTTTCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108674 TGCCCGCCAGGCATCGGCCTCCCGTGCCTGGGGCCTCCGCTTTTTCCGAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GCCCCCAGCAGGTGCTGCCCTCACCAGATGGGCGGCGGGCAGCAGGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108724 GCCCCCAGCAGGTGCTGCCCTCACCAGATGGGCGGCGGGCAGCAGGTGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CGCCTAGCAGTCACTAGACTGGAG         GGTGTCGATGAGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 108774 CGCCTAGCAGTCACTAGACTGGAGGTG...CAGGGTGTCGATGAGGCCAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CCGTGCAGTGCCCACGGGAGACATGGAAGACCTCCCTTGTGGGCTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108895 CCGTGCAGTGCCCACGGGAGACATGGAAGACCTCCCTTGTGGGCTGGTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TCAGCAGCATTGGGTATAAGAGCCGCCCTGTCGACCCAAGCGTGCCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108945 TCAGCAGCATTGGGTATAAGAGCCGCCCTGTCGACCCAAGCGTGCCCTTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GACTCCAAGCTTGGGGTCATCCCCAATGTGGAGGGCCGGGTTATGGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108995 GACTCCAAGCTTGGGGTCATCCCCAATGTGGAGGGCCGGGTTATGGATGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GCCAG         GCCTCTACTGCAGCGGCTGGGTGAAGAGAGGACCTA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109045 GCCAGGTG...CAGGCCTCTACTGCAGCGGCTGGGTGAAGAGAGGACCTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CAGGTGTCATAGCCACAACCATGACTGACAGCTTCCTCACCGGCCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109735 CAGGTGTCATAGCCACAACCATGACTGACAGCTTCCTCACCGGCCAGATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 CTGCTGCAGGACCTGAAGGCTGGGTTGCTCCCCTCTGGCCCCAGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109785 CTGCTGCAGGACCTGAAGGCTGGGTTGCTCCCCTCTGGCCCCAGGCCTGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CTACGCAGCCATCCAGGCCCTGCTCAGCAGCCGAG         GGGTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 109835 CTACGCAGCCATCCAGGCCCTGCTCAGCAGCCGAGGTC...CAGGGGTCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 GGCCAGTCTCTTTCTCAGACTGGGAGAAGCTGGATGCCGAGGAGGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110004 GGCCAGTCTCTTTCTCAGACTGGGAGAAGCTGGATGCCGAGGAGGTGGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 CGGGGCCAGGGCACGGGGAAGCCCAGGGAGAAGCTGGTGGATCCTCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110054 CGGGGCCAGGGCACGGGGAAGCCCAGGGAGAAGCTGGTGGATCCTCAGGA

   1550     .    :    .    :
   1452 GATGCTGCGCCTCCTGGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||
 110104 GATGCTGCGCCTCCTGGGCCAC