seq1 = pF1KB8109.tfa, 459 bp
seq2 = pF1KB8109/gi568815585f_21040610.tfa (gi568815585f:21040610_21247339), 206730 bp

>pF1KB8109 459
>gi568815585f:21040610_21247339 (Chr13)

1-72  (100001-100072)   100% ->
73-182  (100277-100386)   100% ->
183-305  (106196-106318)   99% ->
306-459  (106577-106730)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGTGGAGTCGCGCGTTACCCAGGAGGAAATTAAGAAGGAGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGTGGAGTCGCGCGTTACCCAGGAGGAAATTAAGAAGGAGCCAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAACCGATCGACCGCGAGAAG         ACATGCCCACTGTTGCTAC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100051 GAAACCGATCGACCGCGAGAAGGTG...CAGACATGCCCACTGTTGCTAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGGTCTTCACCACCAATAACGGCCGCCACCACCGAATGGACGAGTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100296 GGGTCTTCACCACCAATAACGGCCGCCACCACCGAATGGACGAGTTCTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGGGGAAATGTACCGTCCAGCGAGTTGCAGATCTACACTTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100346 CGGGGAAATGTACCGTCCAGCGAGTTGCAGATCTACACTTGGTG...CAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GATGGATGCAACTTTGAAAGAACTGACAAGCTTAGTAAAAGAAGTCTACC
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106196 GATGGATGCAACCTTGAAAGAACTGACAAGCTTAGTAAAAGAAGTCTACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAGAAGCTAGAAAGAAGGGCACTCACTTCAATTTTGCAATCGTTTTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106246 CAGAAGCTAGAAAGAAGGGCACTCACTTCAATTTTGCAATCGTTTTTACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GATGTTAAAAGACCTGGCTATCG         AGTTAAGGAGATTGGCAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 106296 GATGTTAAAAGACCTGGCTATCGGTA...CAGAGTTAAGGAGATTGGCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CACCATGTCTGGCAGAAAGGGGACTGATGATTCCATGACCCTGCAGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106595 CACCATGTCTGGCAGAAAGGGGACTGATGATTCCATGACCCTGCAGTCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGAAGTTCCAGATAGGAGATTACTTGGACATAGCAATTACCCCTCCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106645 AGAAGTTCCAGATAGGAGATTACTTGGACATAGCAATTACCCCTCCAAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .
    424 CGGGCACCACCTCCTTCAGGGCGCATGAGACCATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106695 CGGGCACCACCTCCTTCAGGGCGCATGAGACCATAT