Result of SIM4 for
pF1KB8028
seq1 = pF1KB8028.tfa, 3312 bp
seq2 = pF1KB8028/gi568815596f_204446000.tfa (gi568815596f:204446000_205715810), 1269811 bp
>pF1KB8028 3312
>gi568815596f:204446000_205715810 (Chr2)
1-121 (100001-100121) 100% ==
221-394 (519151-519324) 100% ->
395-504 (601582-601691) 100% ->
505-593 (658427-658515) 100% ->
594-680 (667492-667578) 100% ->
681-806 (672922-673047) 100% ->
807-1165 (675592-675950) 100% ->
1166-1305 (678328-678467) 100% ->
1306-1434 (679610-679738) 100% ->
1435-1620 (712723-712908) 100% ->
1621-1791 (726212-726382) 100% ->
1792-1924 (730446-730578) 100% ->
1925-2024 (739765-739864) 100% ->
2025-2140 (747206-747321) 100% ->
2141-2185 (799779-799823) 100% ->
2186-2392 (854531-854737) 100% ->
2393-2630 (855465-855702) 100% ==
2740-2879 (1053895-1054034) 100% ==
2954-3312 (1169453-1169811) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGAAAGTGACCGTGTGCTTCGGCAGGACGGGCATCGTGGTGCCCTGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGAAAGTGACCGTGTGCTTCGGCAGGACGGGCATCGTGGTGCCCTGCAA
50 . : . : . : . : . :
51 GGAGGGCCAGCTGCGCGTCGGCGAGCTCACCCAGCAGGCGCTGCAGCGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GGAGGGCCAGCTGCGCGTCGGCGAGCTCACCCAGCAGGCGCTGCAGCGGT
100 . : . :
101 ACCTGAAGACCCGGGAGAAGG
|||||||||||||||||||||
100101 ACCTGAAGACCCGGGAGAAGG
0 . : . : . : . : . :
221 AGCTGATTGCTGTGTTTGAAGAACAAGAACCACTCCACAAGATTGAGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
519151 AGCTGATTGCTGTGTTTGAAGAACAAGAACCACTCCACAAGATTGAGAGC
50 . : . : . : . : . :
271 CCCAGTGGAAACCCTGCAGATCGGCAGAGCCCAGATGCTTTTGAGACAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
519201 CCCAGTGGAAACCCTGCAGATCGGCAGAGCCCAGATGCTTTTGAGACAGA
100 . : . : . : . : . :
321 AGTGGCCGCCCAACTGGCCGCATTTAAGCCAATTGGTGGGGAGATTGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
519251 AGTGGCCGCCCAACTGGCCGCATTTAAGCCAATTGGTGGGGAGATTGAAG
150 . : . : . : . : . :
371 TAACCCCTTCTGCTCTAAAACTAG GCACTCCACTGCTGGTG
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
519301 TAACCCCTTCTGCTCTAAAACTAGGTA...CAGGCACTCCACTGCTGGTG
200 . : . : . : . : . :
412 AGGAGAAGCAGTGACCCAGTGCCAGGCCCACCTGCTGATACCCAGCCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
601599 AGGAGAAGCAGTGACCCAGTGCCAGGCCCACCTGCTGATACCCAGCCAAG
250 . : . : . : . : . :
462 CGCTTCACACCCTGGTGGCCAGAGTCTGAAACTGGTTGTTCCA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
601649 CGCTTCACACCCTGGTGGCCAGAGTCTGAAACTGGTTGTTCCAGTA...T
300 . : . : . : . : . :
505 GATTCCACGCAGAACTTGGAAGACAGAGAAGTTTTGAATGGTGTACAG
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
658425 AGGATTCCACGCAGAACTTGGAAGACAGAGAAGTTTTGAATGGTGTACAG
350 . : . : . : . : . :
553 ACAGAACTACTAACTTCGCCAAGAACTAAGGACACATTGAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
658475 ACAGAACTACTAACTTCGCCAAGAACTAAGGACACATTGAGGTA...CAG
400 . : . : . : . : . :
594 TGATATGACAAGAACAGTGGAGATTTCTGGGGAAGGAGGCCCATTGGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
667492 TGATATGACAAGAACAGTGGAGATTTCTGGGGAAGGAGGCCCATTGGGAA
450 . : . : . : . : . :
644 TACATGTAGTGCCCTTCTTTTCATCTCTGAGTGGAAG GATT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
667542 TACATGTAGTGCCCTTCTTTTCATCTCTGAGTGGAAGGTA...TAGGATT
500 . : . : . : . : . :
685 CTAGGACTCTTCATCCGAGGCATTGAAGACAACAGCAGGTCCAAGCGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
672926 CTAGGACTCTTCATCCGAGGCATTGAAGACAACAGCAGGTCCAAGCGGGA
550 . : . : . : . : . :
735 GGGACTATTTCACGAAAATGAATGTATTGTAAAAATCAACAATGTGGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
672976 GGGACTATTTCACGAAAATGAATGTATTGTAAAAATCAACAATGTGGATC
600 . : . : . : . : . :
785 TCGTAGACAAAACCTTTGCTCA GGCTCAAGATGTCTTCCGC
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
673026 TCGTAGACAAAACCTTTGCTCAGTA...CAGGGCTCAAGATGTCTTCCGC
650 . : . : . : . : . :
826 CAGGCAATGAAATCTCCAAGTGTGCTCCTCCACGTGCTTCCTCCACAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
675611 CAGGCAATGAAATCTCCAAGTGTGCTCCTCCACGTGCTTCCTCCACAAAA
700 . : . : . : . : . :
876 CCGTGAACAGTATGAAAAGTCAGTCATTGGCTCTCTTAACATTTTTGGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
675661 CCGTGAACAGTATGAAAAGTCAGTCATTGGCTCTCTTAACATTTTTGGTA
750 . : . : . : . : . :
926 ATAATGATGGCGTTTTGAAAACCAAAGTGCCGCCTCCTGTCCATGGAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
675711 ATAATGATGGCGTTTTGAAAACCAAAGTGCCGCCTCCTGTCCATGGAAAA
800 . : . : . : . : . :
976 TCGGGACTAAAGACAGCAAATCTCACAGGAACCGATAGTCCTGAAACAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
675761 TCGGGACTAAAGACAGCAAATCTCACAGGAACCGATAGTCCTGAAACAGA
850 . : . : . : . : . :
1026 TGCATCAGCTTCCCTGCAACAAAACAAGAGTCCCCGAGTACCAAGGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
675811 TGCATCAGCTTCCCTGCAACAAAACAAGAGTCCCCGAGTACCAAGGCTGG
900 . : . : . : . : . :
1076 GAGGAAAACCATCCTCTCCCTCACTCTCGCCTCTCATGGGATTTGGCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
675861 GAGGAAAACCATCCTCTCCCTCACTCTCGCCTCTCATGGGATTTGGCAGC
950 . : . : . : . : . :
1126 AATAAAAATGCAAAGAAAATTAAGATTGACCTAAAGAAAG G
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
675911 AATAAAAATGCAAAGAAAATTAAGATTGACCTAAAGAAAGGTA...TAGG
1000 . : . : . : . : . :
1167 CCCTGAAGGACTTGGTTTCACTGTGGTTACCAGAGACTCTTCCATACATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
678329 CCCTGAAGGACTTGGTTTCACTGTGGTTACCAGAGACTCTTCCATACATG
1050 . : . : . : . : . :
1217 GTCCCGGTCCCATTTTTGTAAAAAACATTTTACCAAAGGGAGCAGCAATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
678379 GTCCCGGTCCCATTTTTGTAAAAAACATTTTACCAAAGGGAGCAGCAATA
1100 . : . : . : . : . :
1267 AAAGATGGCCGCCTACAATCAGGGGACAGAATTTTGGAG GT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
678429 AAAGATGGCCGCCTACAATCAGGGGACAGAATTTTGGAGGTA...TAGGT
1150 . : . : . : . : . :
1308 AAATGGGAGAGATGTCACCGGACGAACCCAGGAAGAGCTTGTGGCCATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
679612 AAATGGGAGAGATGTCACCGGACGAACCCAGGAAGAGCTTGTGGCCATGC
1200 . : . : . : . : . :
1358 TCAGGAGCACCAAGCAGGGGGAGACAGCATCGCTGGTCATTGCCCGCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
679662 TCAGGAGCACCAAGCAGGGGGAGACAGCATCGCTGGTCATTGCCCGCCAA
1250 . : . : . : . : . :
1408 GAAGGACATTTTCTGCCCCGAGAGTTG AAAGGAGAACCTGA
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
679712 GAAGGACATTTTCTGCCCCGAGAGTTGGTA...CAGAAAGGAGAACCTGA
1300 . : . : . : . : . :
1449 CTGCTGTGCACTCTCTCTGGAGACAAGCGAGCAGCTCACCTTTGAGATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
712737 CTGCTGTGCACTCTCTCTGGAGACAAGCGAGCAGCTCACCTTTGAGATCC
1350 . : . : . : . : . :
1499 CCCTGAATGATTCAGGTTCTGCTGGCCTCGGGGTGAGCTTAAAAGGGAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
712787 CCCTGAATGATTCAGGTTCTGCTGGCCTCGGGGTGAGCTTAAAAGGGAAC
1400 . : . : . : . : . :
1549 AAATCCAGAGAAACTGGAACAGACTTGGGGATTTTTATCAAATCCATCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
712837 AAATCCAGAGAAACTGGAACAGACTTGGGGATTTTTATCAAATCCATCAT
1450 . : . : . : . : . :
1599 TCATGGAGGCGCTGCTTTTAAG GATGGTCGTCTGCGAATGA
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
712887 TCATGGAGGCGCTGCTTTTAAGGTG...TAGGATGGTCGTCTGCGAATGA
1500 . : . : . : . : . :
1640 ATGACCAGCTGATTGCAGTTAATGGGGAATCTCTTTTGGGAAAGTCCAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
726231 ATGACCAGCTGATTGCAGTTAATGGGGAATCTCTTTTGGGAAAGTCCAAC
1550 . : . : . : . : . :
1690 CACGAAGCTATGGAAACACTTAGGCGGTCAATGTCCATGGAGGGAAACAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
726281 CACGAAGCTATGGAAACACTTAGGCGGTCAATGTCCATGGAGGGAAACAT
1600 . : . : . : . : . :
1740 CCGAGGGATGATCCAGTTGGTGATTCTGAGGAGGCCAGAGAGACCAATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
726331 CCGAGGGATGATCCAGTTGGTGATTCTGAGGAGGCCAGAGAGACCAATGG
1650 . : . : . : . : . :
1790 AG GATCCTGCAGAGTGTGGGGCATTTTCCAAGCCATGCTTT
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
726381 AGGTG...TAGGATCCTGCAGAGTGTGGGGCATTTTCCAAGCCATGCTTT
1700 . : . : . : . : . :
1831 GAGAACTGTCAAAATGCTGTAACCACCTCTAGGCGAAATGATAATAGTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
730485 GAGAACTGTCAAAATGCTGTAACCACCTCTAGGCGAAATGATAATAGTAT
1750 . : . : . : . : . :
1881 CCTGCATCCACTTGGCACTTGCAGTCCACAAGACAAACAGAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
730535 CCTGCATCCACTTGGCACTTGCAGTCCACAAGACAAACAGAAAGGTA...
1800 . : . : . : . : . :
1925 GTCTATTGCTGCCCAATGACGGATGGGCCGAGAGTGAAGTTCCACCT
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
739762 TAGGTCTATTGCTGCCCAATGACGGATGGGCCGAGAGTGAAGTTCCACCT
1850 . : . : . : . : . :
1972 TCTCCAACACCACATTCTGCTCTGGGATTGGGCCTCGAAGATTACAGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
739812 TCTCCAACACCACATTCTGCTCTGGGATTGGGCCTCGAAGATTACAGCCA
1900 . : . : . : . : . :
2022 CAG CTCTGGGGTGGATTCAGCAGTATATTTTCCAGATCAGC
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
739862 CAGGTA...CAGCTCTGGGGTGGATTCAGCAGTATATTTTCCAGATCAGC
1950 . : . : . : . : . :
2063 ACATCAACTTCAGATCTGTGACACCGGCCAGGCAGCCTGAATCAATTAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
747244 ACATCAACTTCAGATCTGTGACACCGGCCAGGCAGCCTGAATCAATTAAT
2000 . : . : . : . : . :
2113 TTGAAAGCCTCGAAGAGCATGGACCTTG TGCCAGATGAAAG
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
747294 TTGAAAGCCTCGAAGAGCATGGACCTTGGTA...CAGTGCCAGATGAAAG
2050 . : . : . : . : . :
2154 CAAGGTTCACTCATTGGCTGGACAAAAATCGG AATCTCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
799792 CAAGGTTCACTCATTGGCTGGACAAAAATCGGGTA...CAGAATCTCCAA
2100 . : . : . : . : . :
2195 GCAAAGATTTTGGTCCAACTCTGGGTTTGAAAAAGTCCAGCTCCTTGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
854540 GCAAAGATTTTGGTCCAACTCTGGGTTTGAAAAAGTCCAGCTCCTTGGAG
2150 . : . : . : . : . :
2245 AGTCTGCAGACTGCAGTGGCCGAGGTCAGGAAGAATGACCTTCCCTTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
854590 AGTCTGCAGACTGCAGTGGCCGAGGTCAGGAAGAATGACCTTCCCTTTCA
2200 . : . : . : . : . :
2295 CAGGCCCCGGCCGCACATGGTTCGAGGCCGAGGCTGCAATGAGAGCTTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
854640 CAGGCCCCGGCCGCACATGGTTCGAGGCCGAGGCTGCAATGAGAGCTTTA
2250 . : . : . : . : . :
2345 GAGCAGCCATTGACAAATCCTACGATGGACCTGAAGAAATAGAAGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
854690 GAGCAGCCATTGACAAATCCTACGATGGACCTGAAGAAATAGAAGCTGGT
2300 . : . : . : . : . :
2393 ACGGTCTGTCTGATAAGAGCTCTCACTCTGGCCAAGGAGCTCT
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
854740 A...CAGACGGTCTGTCTGATAAGAGCTCTCACTCTGGCCAAGGAGCTCT
2350 . : . : . : . : . :
2436 GAATTGTGAGTCTGCCCCTCAGGGGAATTCGGAGCTAGAGGACATGGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
855508 GAATTGTGAGTCTGCCCCTCAGGGGAATTCGGAGCTAGAGGACATGGAAA
2400 . : . : . : . : . :
2486 ATAAAGCCAGGAAAGTCAAAAAAACGAAAGAGAAGGAGAAGAAAAAGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
855558 ATAAAGCCAGGAAAGTCAAAAAAACGAAAGAGAAGGAGAAGAAAAAGGAA
2450 . : . : . : . : . :
2536 AAGGGCAAATTGAAAGTCAAGGAGAAAAAGCGCAAAGAGGAGAATGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
855608 AAGGGCAAATTGAAAGTCAAGGAGAAAAAGCGCAAAGAGGAGAATGAAGA
2500 . : . : . : . : .
2586 TCCAGAAAGGAAAATAAAGAAGAAGGGCTTCGGCGCCATGCTGAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
855658 TCCAGAAAGGAAAATAAAGAAGAAGGGCTTCGGCGCCATGCTGAG
0 . : . : . : . : . :
2740 AGTGGCCGTCCTACGGGTGGAAGCACTGACCGTATCCAGAAGTTGCGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1053895 AGTGGCCGTCCTACGGGTGGAAGCACTGACCGTATCCAGAAGTTGCGGAA
50 . : . : . : . : . :
2790 AGAGTATTATCAGGCTCGGAGGGAAGGTTTCCCTTTATATGAAGACGACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1053945 AGAGTATTATCAGGCTCGGAGGGAAGGTTTCCCTTTATATGAAGACGACG
100 . : . : . : . :
2840 AAGGAAGAGCAAGGCCATCTGAGTATGACCTACTCTGGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1053995 AAGGAAGAGCAAGGCCATCTGAGTATGACCTACTCTGGGT
0 . : . : . : . : . :
2954 CCAGGGGAGGACCCGCAGATCCTGTAGACTATCTGCCAGCAGCACCTCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1169453 CCAGGGGAGGACCCGCAGATCCTGTAGACTATCTGCCAGCAGCACCTCGG
50 . : . : . : . : . :
3004 GGGCTCTACAAGGAAAGGGAGCTTCCCTATTATCCAGGGGCTCATCCTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1169503 GGGCTCTACAAGGAAAGGGAGCTTCCCTATTATCCAGGGGCTCATCCTAT
100 . : . : . : . : . :
3054 GCACCCTCCCAAAGGGAGCTATCCCCGCCCCACAGAGCTCAGGGTGGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1169553 GCACCCTCCCAAAGGGAGCTATCCCCGCCCCACAGAGCTCAGGGTGGCAG
150 . : . : . : . : . :
3104 ATCTCCGGTATCCTCAGCACTACCCACCCCCGCCAGCTCCCCAGCACAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1169603 ATCTCCGGTATCCTCAGCACTACCCACCCCCGCCAGCTCCCCAGCACAAA
200 . : . : . : . : . :
3154 GGACCCTTTCGACAAGACGTTCCGCCTTCCCCTCCCCAGCACCAAAGAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1169653 GGACCCTTTCGACAAGACGTTCCGCCTTCCCCTCCCCAGCACCAAAGAAT
250 . : . : . : . : . :
3204 GCCAGCCTATCAGGAAACAGGCAGACCAGGGCCCCGTGGGGGCAGCCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1169703 GCCAGCCTATCAGGAAACAGGCAGACCAGGGCCCCGTGGGGGCAGCCCAG
300 . : . : . : . : . :
3254 ACCAGTACCCTTACCGAACCCAGGATTCCCGGCAGAAGAACCCCATGACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1169753 ACCAGTACCCTTACCGAACCCAGGATTCCCGGCAGAAGAACCCCATGACT
350 .
3304 GCAGCCGTA
|||||||||
1169803 GCAGCCGTA