seq1 = pF1KB8024.tfa, 615 bp
seq2 = pF1KB8024/gi568815596r_64988496.tfa (gi568815596r:64988496_65204806), 216311 bp

>pF1KB8024 615
>gi568815596r:64988496_65204806 (Chr2)

(complement)

1-23  (74892-74914)   100% ->
24-96  (100001-100073)   100% ->
97-192  (106741-106836)   100% ->
193-288  (113729-113824)   100% ->
289-420  (115737-115868)   100% ->
421-615  (116117-116311)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCAGCATGAATCCCGAATA         TGATTATTTATTCAAGTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
  74892 ATGTCCAGCATGAATCCCGAATAGTG...CAGTGATTATTTATTCAAGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 ACTTCTGATTGGCGACTCAGGGGTTGGAAAGTCTTGCCTTCTTCTTAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100019 ACTTCTGATTGGCGACTCAGGGGTTGGAAAGTCTTGCCTTCTTCTTAGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGCA         GATGATACATATACAGAAAGCTACATCAGCACAATT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100069 TTGCAGTA...CAGGATGATACATATACAGAAAGCTACATCAGCACAATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GGTGTGGATTTCAAAATAAGAACTATAGAGTTAGACGGGAAAACAATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106777 GGTGTGGATTTCAAAATAAGAACTATAGAGTTAGACGGGAAAACAATCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCTTCAAATA         TGGGACACAGCAGGCCAGGAAAGATTTCGAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 106827 GCTTCAAATAGTA...TAGTGGGACACAGCAGGCCAGGAAAGATTTCGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 CAATCACCTCCAGTTATTACAGAGGAGCCCATGGCATCATAGTTGTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113760 CAATCACCTCCAGTTATTACAGAGGAGCCCATGGCATCATAGTTGTGTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GATGTGACAGATCAG         GAGTCCTTCAATAATGTTAAACAGTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 113810 GATGTGACAGATCAGGTA...TAGGAGTCCTTCAATAATGTTAAACAGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GCTGCAGGAAATAGATCGTTATGCCAGTGAAAATGTCAACAAATTGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115763 GCTGCAGGAAATAGATCGTTATGCCAGTGAAAATGTCAACAAATTGTTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TAGGGAACAAATGTGATCTGACCACAAAGAAAGTAGTAGACTACACAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115813 TAGGGAACAAATGTGATCTGACCACAAAGAAAGTAGTAGACTACACAACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCGAAG         GAATTTGCTGATTCCCTTGGAATTCCGTTTTTGGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115863 GCGAAGGTA...TAGGAATTTGCTGATTCCCTTGGAATTCCGTTTTTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 AACCAGTGCTAAGAATGCAACGAATGTAGAACAGTCTTTCATGACGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116152 AACCAGTGCTAAGAATGCAACGAATGTAGAACAGTCTTTCATGACGATGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CAGCTGAGATTAAAAAGCGAATGGGTCCCGGAGCAACAGCTGGTGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116202 CAGCTGAGATTAAAAAGCGAATGGGTCCCGGAGCAACAGCTGGTGGTGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAGAAGTCCAATGTTAAAATTCAGAGCACTCCAGTCAAGCAGTCAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116252 GAGAAGTCCAATGTTAAAATTCAGAGCACTCCAGTCAAGCAGTCAGGTGG

    650     .    :
    606 AGGTTGCTGC
        ||||||||||
 116302 AGGTTGCTGC