seq1 = pF1KB8009.tfa, 1149 bp
seq2 = pF1KB8009/gi568815584r_50535186.tfa (gi568815584r:50535186_50767967), 232782 bp

>pF1KB8009 1149
>gi568815584r:50535186_50767967 (Chr14)

(complement)

1-94  (100001-100094)   100% ->
95-535  (102349-102789)   100% ->
536-806  (122954-123224)   100% ->
807-950  (127075-127218)   100% ->
951-1149  (132584-132782)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGTCCCGAAAGAAAACCAAAAACGAAGTGTCCAAGCCGGCCGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGTCCCGAAAGAAAACCAAAAACGAAGTGTCCAAGCCGGCCGAGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGGGGAAGTACGTGAAGAAGGAGACGTCGCCTCTGCTTCGGA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100051 GCAGGGGAAGTACGTGAAGAAGGAGACGTCGCCTCTGCTTCGGAGTG...

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     95    ATCTTATGCCTTCATTCATCCGGCATGGTCCAACAATTCCAAGACGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102346 TAGATCTTATGCCTTCATTCATCCGGCATGGTCCAACAATTCCAAGACGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACTGATATCTGTCTTCCAGATTCAAGCCCTAATGCCTTTTCAACTTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102396 ACTGATATCTGTCTTCCAGATTCAAGCCCTAATGCCTTTTCAACTTCTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGATGTAGTTTCAAGAAACCAGAGTTTCCTTAGAACTCCAATTCAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102446 AGATGTAGTTTCAAGAAACCAGAGTTTCCTTAGAACTCCAATTCAAAGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CACCTCATGAAATAATGAGAAGAGAAAGCAACAGATTATCTGCACCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102496 CACCTCATGAAATAATGAGAAGAGAAAGCAACAGATTATCTGCACCTTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TATCTTGCCAGAAGTCTAGCAGATGTCCCTAGAGAGTATGGTTCTTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102546 TATCTTGCCAGAAGTCTAGCAGATGTCCCTAGAGAGTATGGTTCTTCTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GTCATTTGTAACGGAAGTTAGTTTTGCTGTTGAAAATGGAGACTCTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102596 GTCATTTGTAACGGAAGTTAGTTTTGCTGTTGAAAATGGAGACTCTGGTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCCGATATTATTATTCAGACAATTTTTTTGATGGTCAGAGAAAGCGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102646 CCCGATATTATTATTCAGACAATTTTTTTGATGGTCAGAGAAAGCGGCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CTTGGAGATCGTGCACATGAAGACTACAGATATTATGAATACAACCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102696 CTTGGAGATCGTGCACATGAAGACTACAGATATTATGAATACAACCATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TCTCTTCCAAAGAATGCCACAGAATCAGGGGAGGCATGCTTCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 102746 TCTCTTCCAAAGAATGCCACAGAATCAGGGGAGGCATGCTTCAGGTA...

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    536    GTATTGGGAGAGTTGCTGCTACATCTTTAGGAAATTTGACTAACCAT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122951 TAGGTATTGGGAGAGTTGCTGCTACATCTTTAGGAAATTTGACTAACCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GGTTCTGAAGATTTACCCCTTCCTCCTGGCTGGTCTGTGGACTGGACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123001 GGTTCTGAAGATTTACCCCTTCCTCCTGGCTGGTCTGTGGACTGGACAAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GAGAGGGAGAAAATATTATATAGATCATAACACAAATACAACTCACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123051 GAGAGGGAGAAAATATTATATAGATCATAACACAAATACAACTCACTGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GCCATCCTCTTGAGCGAGAAGGACTTCCTCCTGGATGGGAACGAGTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123101 GCCATCCTCTTGAGCGAGAAGGACTTCCTCCTGGATGGGAACGAGTTGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TCATCCGAATTTGGAACCTATTATGTAGATCACACAAATAAGAAGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123151 TCATCCGAATTTGGAACCTATTATGTAGATCACACAAATAAGAAGGCCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 ATACAGGCATCCCTGTGCTCCTAG         TGTACCTCGGTATGATC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 123201 ATACAGGCATCCCTGTGCTCCTAGGTA...TAGTGTACCTCGGTATGATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 AACCACCTCCTGTCACATACCAGCCACAGCAAACTGAAAGAAATCAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127092 AACCACCTCCTGTCACATACCAGCCACAGCAAACTGAAAGAAATCAGTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CTTCTGGTACCTGCAAATCCATATCATACTGCAGAAATTCCTGACTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127142 CTTCTGGTACCTGCAAATCCATATCATACTGCAGAAATTCCTGACTGGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TCAGGTTTACGCACGAGCCCCTGTGAA         ATATGACCACATTC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 127192 TCAGGTTTACGCACGAGCCCCTGTGAAGTA...CAGATATGACCACATTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TGAAGTGGGAACTCTTCCAGCTGGCTGACCTGGATACATACCAGGGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132598 TGAAGTGGGAACTCTTCCAGCTGGCTGACCTGGATACATACCAGGGAATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CTAAAGTTGCTCTTCATGAAAGAATTGGAGCAGATTGTTAAAATGTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132648 CTAAAGTTGCTCTTCATGAAAGAATTGGAGCAGATTGTTAAAATGTATGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 AGCATACAGACAAGCCCTTCTTACAGAGTTGGAAAACCGAAAGCAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132698 AGCATACAGACAAGCCCTTCTTACAGAGTTGGAAAACCGAAAGCAGAGAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .
   1115 AGCAGTGGTATGCCCAACAACATGGAAAAAATTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132748 AGCAGTGGTATGCCCAACAACATGGAAAAAATTTT