seq1 = pF1KB8007.tfa, 2766 bp
seq2 = pF1KB8007/gi568815590f_86274051.tfa (gi568815590f:86274051_86566890), 292840 bp

>pF1KB8007 2766
>gi568815590f:86274051_86566890 (Chr8)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-209  (106676-106814)   100% ->
210-334  (107455-107579)   100% ->
335-472  (124292-124429)   100% ->
473-539  (124522-124588)   100% ->
540-724  (127969-128153)   100% ->
725-1061  (137488-137824)   100% ->
1062-1157  (151173-151268)   100% ->
1158-1332  (153593-153767)   99% ->
1333-1387  (156647-156701)   100% ->
1388-1472  (157356-157440)   100% ->
1473-1601  (157565-157693)   100% ->
1602-1677  (161402-161477)   100% ->
1678-1749  (161583-161654)   100% ->
1750-1838  (164535-164623)   100% ->
1839-1998  (168569-168728)   100% ->
1999-2132  (174098-174231)   100% ->
2133-2273  (174323-174463)   100% ->
2274-2394  (178509-178629)   100% ->
2395-2499  (183871-183975)   100% ->
2500-2596  (187174-187270)   100% ->
2597-2669  (187724-187796)   100% ->
2670-2766  (192744-192840)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCACTGCTTCACCAAGGTCTGATACTAGTAATAACCACAGTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCACTGCTTCACCAAGGTCTGATACTAGTAATAACCACAGTGGAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTGCAGTTACAGGTAACTG         TTTCTAGTGCCAAACTTAAAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 GTTGCAGTTACAGGTAACTGGTA...TAGTTTCTAGTGCCAAACTTAAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GAAAAAAGAACTGGTTCGGAACAGCAATATATACAGAAGTAGTTGTAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106697 GAAAAAAGAACTGGTTCGGAACAGCAATATATACAGAAGTAGTTGTAGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGAGAAATTACGAAAACAGCAAAATCCAGTAGTTCTTCTAATCCAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106747 GGAGAAATTACGAAAACAGCAAAATCCAGTAGTTCTTCTAATCCAAAATG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGATGAACAGCTAACTGT         AAATGTTACGCCACAGACTACAT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 106797 GGATGAACAGCTAACTGTGTA...CAGAAATGTTACGCCACAGACTACAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGGAATTTCAAGTTTGGAGCCATCGCACTTTAAAAGCAGATGCTTTATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107478 TGGAATTTCAAGTTTGGAGCCATCGCACTTTAAAAGCAGATGCTTTATTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGAAAAGCAACGATAGATTTGAAACAAGCTCTGTTGATACACAATAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107528 GGAAAAGCAACGATAGATTTGAAACAAGCTCTGTTGATACACAATAGAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AT         TGGAAAGAGTGAAAGAACAATTAAAACTTTCCTTGGAAA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107578 ATGTA...TAGTGGAAAGAGTGAAAGAACAATTAAAACTTTCCTTGGAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACAAGAATGGCATAGCACAAACTGGTGAATTGACAGTTGTGCTTGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124331 ACAAGAATGGCATAGCACAAACTGGTGAATTGACAGTTGTGCTTGATGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTGGTGATTGAGCAAGAAAATATAACAAACTGCAGCTCATCTCCAACCA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 124381 TTGGTGATTGAGCAAGAAAATATAACAAACTGCAGCTCATCTCCAACCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    473         TAGAAATACAGGAAAATGGTGATGCCTTACATGAAAATGGAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124431 TA...CAGTAGAAATACAGGAAAATGGTGATGCCTTACATGAAAATGGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGCCTTCAGCAAGGACAACTGCCAG         GTTGGCTGTTGAAGGC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 124564 AGCCTTCAGCAAGGACAACTGCCAGGTA...AAGGTTGGCTGTTGAAGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ACGAATGGAATAGATAATCATGTACCTACAAGCACTCTAGTCCAAAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127985 ACGAATGGAATAGATAATCATGTACCTACAAGCACTCTAGTCCAAAACTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ATGCTGCTCGTATGTAGTTAATGGAGACAACACACCTTCATCTCCGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128035 ATGCTGCTCGTATGTAGTTAATGGAGACAACACACCTTCATCTCCGTCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGGTTGCTGCCAGACCCAAAAATACACCAGCTCCAAAACCACTCGCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128085 AGGTTGCTGCCAGACCCAAAAATACACCAGCTCCAAAACCACTCGCATCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GAGCCTGCCGATGACACTG         TTAATGGAGAATCATCCTCATT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 128135 GAGCCTGCCGATGACACTGGTA...CAGTTAATGGAGAATCATCCTCATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGCACCAACTGATAATGCGTCTGTCACGGGTACTCCAGTAGTGTCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137510 TGCACCAACTGATAATGCGTCTGTCACGGGTACTCCAGTAGTGTCTGAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AAAATGCCTTGTCTCCAAATTGCACTAGTACTACTGTTGAAGATCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137560 AAAATGCCTTGTCTCCAAATTGCACTAGTACTACTGTTGAAGATCCTCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GTTCAAGAAATACTGACTTCCTCAGAAAACAATGAATGTATTCCTTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137610 GTTCAAGAAATACTGACTTCCTCAGAAAACAATGAATGTATTCCTTCTAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CAGTGCAGAATTGGAATCTGAAGCTAGAAGTATATTAGAGCCTGACACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137660 CAGTGCAGAATTGGAATCTGAAGCTAGAAGTATATTAGAGCCTGACACCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CTAATTCTAGAAGTAGTTCTGCTTTTGAAGCAGCCAAATCAAGACAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137710 CTAATTCTAGAAGTAGTTCTGCTTTTGAAGCAGCCAAATCAAGACAGCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GATGGGTGTATGGATCCTGTACGGCAGCAGTCTGGGAATGCCAACACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137760 GATGGGTGTATGGATCCTGTACGGCAGCAGTCTGGGAATGCCAACACAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 AACCTTGCCATCAGG         GTGGGAACAAAGAAAAGATCCTCATG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 137810 AACCTTGCCATCAGGGTA...AAGGTGGGAACAAAGAAAAGATCCTCATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GTAGAACCTATTATGTGGATCATAATACTCGAACTACCACATGGGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151199 GTAGAACCTATTATGTGGATCATAATACTCGAACTACCACATGGGAGAGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CCACAACCTTTACCTCCAGG         TTGGGAAAGAAGAGTTGATGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 151249 CCACAACCTTTACCTCCAGGGTA...TAGTTGGGAAAGAAGAGTTGATGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TCGTAGAAGAGTTTATTATGTGGATCATAACACTAGAACAACAACGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 153614 TCGTAGAAGAGTTTATTATGTGGATCATAACACCAGAACAACAACGTGGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AGCGGCCTACCATGGAATCTGTCCGAAATTTTGAACAGTGGCAATCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153664 AGCGGCCTACCATGGAATCTGTCCGAAATTTTGAACAGTGGCAATCTCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CGGAACCAATTGCAGGGAGCTATGCAACAGTTTAACCAACGATACCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153714 CGGAACCAATTGCAGGGAGCTATGCAACAGTTTAACCAACGATACCTCTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TTCG         GCTTCAATGTTAGCTGCAGAAAATGACCCTTATGGAC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153764 TTCGGTA...CAGGCTTCAATGTTAGCTGCAGAAAATGACCCTTATGGAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CTTTGCCACCAGGCTGGG         AAAAAAGAGTGGATTCAACAGAC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 156684 CTTTGCCACCAGGCTGGGGTA...CAGAAAAAAGAGTGGATTCAACAGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 AGGGTTTACTTTGTGAATCATAACACAAAAACAACCCAGTGGGAAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157379 AGGGTTTACTTTGTGAATCATAACACAAAAACAACCCAGTGGGAAGATCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 AAGAACTCAAGG         CTTACAGAATGAAGAACCCCTGCCAGAAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 157429 AAGAACTCAAGGGTA...TAGCTTACAGAATGAAGAACCCCTGCCAGAAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 GCTGGGAAATTAGATATACTCGTGAAGGTGTAAGGTACTTTGTTGATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157594 GCTGGGAAATTAGATATACTCGTGAAGGTGTAAGGTACTTTGTTGATCAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 AACACAAGAACAACAACATTCAAAGATCCTCGCAATGGGAAGTCATCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157644 AACACAAGAACAACAACATTCAAAGATCCTCGCAATGGGAAGTCATCTGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602          AACTAAAGGTGGTCCACAAATTGCTTATGAACGCGGCTTTA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157694 GTG...TAGAACTAAAGGTGGTCCACAAATTGCTTATGAACGCGGCTTTA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 GGTGGAAGCTTGCTCACTTCCGTTATTTGTGCCAG         TCTAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 161443 GGTGGAAGCTTGCTCACTTCCGTTATTTGTGCCAGGTA...TAGTCTAAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 GCACTACCTAGTCATGTAAAGATCAATGTGTCCCGGCAGACATTGTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161589 GCACTACCTAGTCATGTAAAGATCAATGTGTCCCGGCAGACATTGTTTGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 AGATTCCTTCCAACAG         ATTATGGCATTAAAACCCTATGACT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 161639 AGATTCCTTCCAACAGGTA...TAGATTATGGCATTAAAACCCTATGACT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 TGAGGAGGCGCTTATATGTAATATTTAGAGGAGAAGAAGGACTTGATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164560 TGAGGAGGCGCTTATATGTAATATTTAGAGGAGAAGAAGGACTTGATTAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 GGTGGCCTAGCGAG         AGAATGGTTTTTCTTGCTTTCACATGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 164610 GGTGGCCTAGCGAGGTA...TAGAGAATGGTTTTTCTTGCTTTCACATGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 AGTTTTGAACCCAATGTATTGCTTATTTGAGTATGCGGGCAAGAACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168596 AGTTTTGAACCCAATGTATTGCTTATTTGAGTATGCGGGCAAGAACAACT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 ATTGTCTGCAGATAAATCCAGCATCAACCATTAATCCAGACCATCTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168646 ATTGTCTGCAGATAAATCCAGCATCAACCATTAATCCAGACCATCTTTCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 TACTTCTGTTTCATTGGTCGTTTTATTGCCATG         GCACTATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 168696 TACTTCTGTTTCATTGGTCGTTTTATTGCCATGGTG...CAGGCACTATT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 TCATGGAAAGTTTATCGATACTGGTTTCTCTTTACCATTCTACAAGCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174106 TCATGGAAAGTTTATCGATACTGGTTTCTCTTTACCATTCTACAAGCGTA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 TGTTAAGTAAAAAACTTACTATTAAGGATTTGGAATCTATTGATACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174156 TGTTAAGTAAAAAACTTACTATTAAGGATTTGGAATCTATTGATACTGAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 TTTTATAACTCCCTTATCTGGATAAG         AGATAACAACATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 174206 TTTTATAACTCCCTTATCTGGATAAGGTT...CAGAGATAACAACATTGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 AGAATGTGGCTTAGAAATGTACTTTTCTGTTGACATGGAGATTTTGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174338 AGAATGTGGCTTAGAAATGTACTTTTCTGTTGACATGGAGATTTTGGGAA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 AAGTTACTTCACATGACCTGAAGTTGGGAGGTTCCAATATTCTGGTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174388 AAGTTACTTCACATGACCTGAAGTTGGGAGGTTCCAATATTCTGGTGACT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 GAGGAGAACAAAGATGAATATATTGG         TTTAATGACAGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 174438 GAGGAGAACAAAGATGAATATATTGGGTA...CAGTTTAATGACAGAATG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 GCGTTTTTCTCGAGGAGTACAAGAACAGACCAAAGCTTTCCTTGATGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178524 GCGTTTTTCTCGAGGAGTACAAGAACAGACCAAAGCTTTCCTTGATGGTT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 TTAATGAAGTTGTTCCTCTTCAGTGGCTACAGTACTTCGATGAAAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178574 TTAATGAAGTTGTTCCTCTTCAGTGGCTACAGTACTTCGATGAAAAAGAA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 TTAGAG         GTTATGTTGTGTGGCATGCAGGAGGTTGACTTGGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178624 TTAGAGGTT...CAGGTTATGTTGTGTGGCATGCAGGAGGTTGACTTGGC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 AGATTGGCAGAGAAATACTGTTTATCGACATTATACAAGAAACAGCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183906 AGATTGGCAGAGAAATACTGTTTATCGACATTATACAAGAAACAGCAAGC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2480 AAATCATTTGGTTTTGGCAG         TTTGTGAAAGAGACAGACAAT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 183956 AAATCATTTGGTTTTGGCAGGTA...CAGTTTGTGAAAGAGACAGACAAT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2521 GAAGTAAGAATGCGACTATTGCAGTTCGTCACTGGAACCTGCCGTTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187195 GAAGTAAGAATGCGACTATTGCAGTTCGTCACTGGAACCTGCCGTTTACC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2571 TCTAGGAGGATTTGCTGAGCTCATGG         GAAGTAATGGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 187245 TCTAGGAGGATTTGCTGAGCTCATGGGTA...TAGGAAGTAATGGGCCTC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2612 AAAAGTTTTGCATTGAAAAAGTTGGCAAAGACACTTGGTTACCAAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187739 AAAAGTTTTGCATTGAAAAAGTTGGCAAAGACACTTGGTTACCAAGAAGC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2662 CATACATG         TTTTAATCGCTTGGATCTACCACCATATAAGAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 187789 CATACATGGTA...CAGTTTTAATCGCTTGGATCTACCACCATATAAGAG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2703 TTATGAACAACTAAAGGAAAAACTTCTTTTTGCAATAGAAGAGACAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192777 TTATGAACAACTAAAGGAAAAACTTCTTTTTGCAATAGAAGAGACAGAGG

   2950     .    :
   2753 GATTTGGACAAGAA
        ||||||||||||||
 192827 GATTTGGACAAGAA