seq1 = pF1KB7991.tfa, 1326 bp
seq2 = pF1KB7991/gi568815590f_11608313.tfa (gi568815590f:11608313_11858472), 250160 bp

>pF1KB7991 1326
>gi568815590f:11608313_11858472 (Chr8)

1-616  (100001-100616)   100% ->
617-783  (140607-140773)   100% ->
784-909  (141799-141924)   100% ->
910-997  (146734-146821)   100% ->
998-1146  (148623-148771)   100% ->
1147-1326  (149981-150160)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTATCAGAGCTTGGCCATGGCCGCCAACCACGGGCCGCCCCCCGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTATCAGAGCTTGGCCATGGCCGCCAACCACGGGCCGCCCCCCGGTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACGAGGCGGGCGGCCCCGGCGCCTTCATGCACGGCGCGGGCGCCGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTACGAGGCGGGCGGCCCCGGCGCCTTCATGCACGGCGCGGGCGCCGCGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTCGCCAGTCTACGTGCCCACACCGCGGGTGCCCTCCTCCGTGCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTCGCCAGTCTACGTGCCCACACCGCGGGTGCCCTCCTCCGTGCTGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGTCCTACCTCCAGGGCGGAGGCGCGGGCTCTGCGTCCGGAGGCGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGTCCTACCTCCAGGGCGGAGGCGCGGGCTCTGCGTCCGGAGGCGCCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGCGGCAGCTCCGGTGGGGCCGCGTCTGGTGCGGGGCCCGGGACCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGCGGCAGCTCCGGTGGGGCCGCGTCTGGTGCGGGGCCCGGGACCCAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGGCAGCCCGGGATGGAGCCAGGCGGGAGCCGACGGAGCCGCTTACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGGCAGCCCGGGATGGAGCCAGGCGGGAGCCGACGGAGCCGCTTACACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCGCCGCCGGTGTCGCCGCGCTTCTCCTTCCCGGGGACCACCGGGTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCGCCGCCGGTGTCGCCGCGCTTCTCCTTCCCGGGGACCACCGGGTCCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCGGCCGCCGCCGCCGCTGCCGCGGCCCGGGAAGCTGCGGCCTACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCGGCCGCCGCCGCCGCTGCCGCGGCCCGGGAAGCTGCGGCCTACAGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTGGCGGCGGAGCGGCGGGTGCGGGCCTGGCGGGCCGCGAGCAGTACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTGGCGGCGGAGCGGCGGGTGCGGGCCTGGCGGGCCGCGAGCAGTACGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGCGCCGGCTTCGCGGGCTCCTACTCCAGCCCCTACCCGGCTTACATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGCGCCGGCTTCGCGGGCTCCTACTCCAGCCCCTACCCGGCTTACATGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGACGTGGGCGCGTCCTGGGCCGCAGCCGCCGCCGCCTCCGCCGGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CGACGTGGGCGCGTCCTGGGCCGCAGCCGCCGCCGCCTCCGCCGGCCCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCGACAGCCCGGTCCTGCACAGCCTGCCCGGCCGGGCCAACCCGGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCGACAGCCCGGTCCTGCACAGCCTGCCCGGCCGGGCCAACCCGGCCGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CGACACCCCAATCTCG         ATATGTTTGACGACTTCTCAGAAGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100601 CGACACCCCAATCTCGGTG...TAGATATGTTTGACGACTTCTCAGAAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CAGAGAGTGTGTCAACTGTGGGGCTATGTCCACCCCGCTCTGGAGGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140632 CAGAGAGTGTGTCAACTGTGGGGCTATGTCCACCCCGCTCTGGAGGCGAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ATGGGACGGGTCACTATCTGTGCAACGCCTGCGGCCTCTACCACAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140682 ATGGGACGGGTCACTATCTGTGCAACGCCTGCGGCCTCTACCACAAGATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AACGGCATCAACCGGCCGCTCATCAAGCCTCAGCGCCGGCTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 140732 AACGGCATCAACCGGCCGCTCATCAAGCCTCAGCGCCGGCTGGTA...CA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    784  TCCGCCTCCCGCCGAGTGGGCCTCTCCTGTGCCAACTGCCAGACCACCA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141798 GTCCGCCTCCCGCCGAGTGGGCCTCTCCTGTGCCAACTGCCAGACCACCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 CCACCACGCTGTGGCGCCGCAATGCGGAGGGCGAGCCTGTGTGCAATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141848 CCACCACGCTGTGGCGCCGCAATGCGGAGGGCGAGCCTGTGTGCAATGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TGCGGCCTCTACATGAAGCTCCACGGG         GTCCCCAGGCCTCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 141898 TGCGGCCTCTACATGAAGCTCCACGGGGTA...CAGGTCCCCAGGCCTCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TGCAATGCGGAAAGAGGGGATCCAAACCAGAAAACGGAAGCCCAAGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146748 TGCAATGCGGAAAGAGGGGATCCAAACCAGAAAACGGAAGCCCAAGAACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 TGAATAAATCTAAGACACCAGCAG         CTCCTTCAGGCAGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 146798 TGAATAAATCTAAGACACCAGCAGGTG...CAGCTCCTTCAGGCAGTGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 AGCCTTCCTCCCGCCAGCGGTGCTTCCAGCAACTCCAGCAACGCCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148640 AGCCTTCCTCCCGCCAGCGGTGCTTCCAGCAACTCCAGCAACGCCACCAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CAGCAGCAGCGAGGAGATGCGTCCCATCAAGACGGAGCCTGGCCTGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148690 CAGCAGCAGCGAGGAGATGCGTCCCATCAAGACGGAGCCTGGCCTGTCAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 CTCACTACGGGCACAGCAGCTCCGTGTCCCAG         ACGTTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 148740 CTCACTACGGGCACAGCAGCTCCGTGTCCCAGGTA...CAGACGTTCTCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GTCAGTGCGATGTCTGGCCATGGGCCCTCCATCCACCCTGTCCTCTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149990 GTCAGTGCGATGTCTGGCCATGGGCCCTCCATCCACCCTGTCCTCTCGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 CCTGAAGCTCTCCCCACAAGGCTATGCGTCTCCCGTCAGCCAGTCTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150040 CCTGAAGCTCTCCCCACAAGGCTATGCGTCTCCCGTCAGCCAGTCTCCAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 AGACCAGCTCCAAGCAGGACTCTTGGAACAGCCTGGTCTTGGCCGACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150090 AGACCAGCTCCAAGCAGGACTCTTGGAACAGCCTGGTCTTGGCCGACAGT

   1350     .    :    .    :
   1306 CACGGGGACATAATCACTGCG
        |||||||||||||||||||||
 150140 CACGGGGACATAATCACTGCG