seq1 = pF1KB7977.tfa, 915 bp
seq2 = pF1KB7977/gi568815586f_7689615.tfa (gi568815586f:7689615_7998900), 309286 bp

>pF1KB7977 915
>gi568815586f:7689615_7998900 (Chr12)

1-151  (100001-100151)   100% ->
152-414  (103336-103598)   100% ->
415-501  (104843-104929)   100% ->
502-915  (105065-105478)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTGTGGATCCAGCTTGTCCCCAAAGCTTGCCTTGCTTTGAAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTGTGGATCCAGCTTGTCCCCAAAGCTTGCCTTGCTTTGAAGCATC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACTGTAAAGAATCTTCACCTATGCCTGTGATTTGTGGGCCTGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGACTGTAAAGAATCTTCACCTATGCCTGTGATTTGTGGGCCTGAAGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTATCCATCCTTGCAAATGTCTTCTGCTGAGATGCCTCACACGGAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTATCCATCCTTGCAAATGTCTTCTGCTGAGATGCCTCACACGGAGACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 G         TCTCTCCTCTTCCTTCCTCCATGGATCTGCTTATTCAGGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGTA...CAGTCTCTCCTCTTCCTTCCTCCATGGATCTGCTTATTCAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAGCCCTGATTCTTCCACCAGTCCCAAAGGCAAACAACCCACTTCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103376 CAGCCCTGATTCTTCCACCAGTCCCAAAGGCAAACAACCCACTTCTGCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGAAGAGTGTCGCAAAAAAGGAAGACAAGGTCCCGGTCAAGAAACAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103426 AGAAGAGTGTCGCAAAAAAGGAAGACAAGGTCCCGGTCAAGAAACAGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACCAGAACTGTGTTCTCTTCCACCCAGCTGTGTGTACTCAATGATAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103476 ACCAGAACTGTGTTCTCTTCCACCCAGCTGTGTGTACTCAATGATAGATT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TCAGAGACAGAAATACCTCAGCCTCCAGCAGATGCAAGAACTCTCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103526 TCAGAGACAGAAATACCTCAGCCTCCAGCAGATGCAAGAACTCTCCAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCCTGAACCTCAGCTACAAACAG         GTGAAGACCTGGTTCCAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 103576 TCCTGAACCTCAGCTACAAACAGGTA...CAGGTGAAGACCTGGTTCCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AACCAGAGAATGAAATCTAAGAGGTGGCAGAAAAACAACTGGCCGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104861 AACCAGAGAATGAAATCTAAGAGGTGGCAGAAAAACAACTGGCCGAAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TAGCAATGGTGTGACGCAG         AAGGCCTCAGCACCTACCTACC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 104911 TAGCAATGGTGTGACGCAGGTA...CAGAAGGCCTCAGCACCTACCTACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCAGCCTTTACTCTTCCTACCACCAGGGATGCCTGGTGAACCCGACTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105087 CCAGCCTTTACTCTTCCTACCACCAGGGATGCCTGGTGAACCCGACTGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AACCTTCCAATGTGGAGCAACCAGACCTGGAACAATTCAACCTGGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105137 AACCTTCCAATGTGGAGCAACCAGACCTGGAACAATTCAACCTGGAGCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCAGACCCAGAACATCCAGTCCTGGAGCAACCACTCCTGGAACACTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105187 CCAGACCCAGAACATCCAGTCCTGGAGCAACCACTCCTGGAACACTCAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CCTGGTGCACCCAATCCTGGAACAATCAGGCCTGGAACAGTCCCTTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105237 CCTGGTGCACCCAATCCTGGAACAATCAGGCCTGGAACAGTCCCTTCTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AACTGTGGAGAGGAATCTCTGCAGTCCTGCATGCAGTTCCAGCCAAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105287 AACTGTGGAGAGGAATCTCTGCAGTCCTGCATGCAGTTCCAGCCAAATTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TCCTGCCAGTGACTTGGAGGCTGCCTTGGAAGCTGCTGGGGAAGGCCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105337 TCCTGCCAGTGACTTGGAGGCTGCCTTGGAAGCTGCTGGGGAAGGCCTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 ATGTAATACAGCAGACCACTAGGTATTTTAGTACTCCACAAACCATGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105387 ATGTAATACAGCAGACCACTAGGTATTTTAGTACTCCACAAACCATGGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TTATTCCTAAACTACTCCATGAACATGCAACCTGAAGACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105437 TTATTCCTAAACTACTCCATGAACATGCAACCTGAAGACGTG