seq1 = pF1KB7967.tfa, 849 bp
seq2 = pF1KB7967/gi568815588r_3679542.tfa (gi568815588r:3679542_3885014), 205473 bp

>pF1KB7967 849
>gi568815588r:3679542_3885014 (Chr10)

(complement)

1-102  (100001-100102)   100% ->
103-676  (102801-103374)   100% ->
677-800  (104786-104909)   100% ->
801-849  (105425-105473)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACGTGCTCCCCATGTGCAGCATCTTCCAGGAGCTCCAGATCGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACGTGCTCCCCATGTGCAGCATCTTCCAGGAGCTCCAGATCGTGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGACCGGCTACTTCTCGGCGCTGCCGTCTCTGGAGGAGTACTGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAGACCGGCTACTTCTCGGCGCTGCCGTCTCTGGAGGAGTACTGGCAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AG         ACCTGCCTAGAGCTGGAACGTTACCTCCAGAGCGAGCCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGTA...CAGACCTGCCTAGAGCTGGAACGTTACCTCCAGAGCGAGCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGCTATGTTTCAGCCTCAGAAATCAAATTTGACAGCCAGGAAGATCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102840 TGCTATGTTTCAGCCTCAGAAATCAAATTTGACAGCCAGGAAGATCTGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GACCAAAATCATTCTGGCTCGGGAGAAAAAGGAGGAATCCGAACTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102890 GACCAAAATCATTCTGGCTCGGGAGAAAAAGGAGGAATCCGAACTGAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TATCTTCCAGTCCTCCAGAGGACACTCTCATCAGCCCGAGCTTTTGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102940 TATCTTCCAGTCCTCCAGAGGACACTCTCATCAGCCCGAGCTTTTGTTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AACTTAGAGACCAACAGCCTGAACTCAGATGTCAGCAGCGAATCCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102990 AACTTAGAGACCAACAGCCTGAACTCAGATGTCAGCAGCGAATCCTCTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAGCTCCGAGGAACTTTCTCCCACGGCCAAGTTTACCTCCGACCCCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103040 CAGCTCCGAGGAACTTTCTCCCACGGCCAAGTTTACCTCCGACCCCATTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCGAAGTTTTGGTCAGCTCGGGAAAATTGAGCTCCTCTGTCACCTCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103090 GCGAAGTTTTGGTCAGCTCGGGAAAATTGAGCTCCTCTGTCACCTCCACG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CCTCCATCTTCTCCGGAACTGAGCAGGGAACCTTCTCAACTGTGGGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103140 CCTCCATCTTCTCCGGAACTGAGCAGGGAACCTTCTCAACTGTGGGGTTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CGTGCCCGGGGAGCTGCCCTCGCCAGGGAAGGTGCGCAGCGGGACTTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103190 CGTGCCCGGGGAGCTGCCCTCGCCAGGGAAGGTGCGCAGCGGGACTTCGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GGAAGCCAGGTGACAAGGGAAATGGCGATGCCTCCCCCGACGGCAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103240 GGAAGCCAGGTGACAAGGGAAATGGCGATGCCTCCCCCGACGGCAGGAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AGGGTGCACCGGTGCCACTTTAACGGCTGCAGGAAAGTTTACACCAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103290 AGGGTGCACCGGTGCCACTTTAACGGCTGCAGGAAAGTTTACACCAAAAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CTCCCACTTGAAAGCACACCAGCGGACGCACACAG         GAGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 103340 CTCCCACTTGAAAGCACACCAGCGGACGCACACAGGTC...CAGGAGAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AGCCTTACAGATGCTCATGGGAAGGGTGTGAGTGGCGTTTTGCAAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104792 AGCCTTACAGATGCTCATGGGAAGGGTGTGAGTGGCGTTTTGCAAGAAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GATGAGTTAACCAGGCACTTCCGAAAGCACACCGGGGCCAAGCCTTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104842 GATGAGTTAACCAGGCACTTCCGAAAGCACACCGGGGCCAAGCCTTTTAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 ATGCTCCCACTGTGACAG         GTGTTTTTCCAGGTCTGACCACC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 104892 ATGCTCCCACTGTGACAGGTA...CAGGTGTTTTTCCAGGTCTGACCACC

    850     .    :    .    :    .
    824 TGGCCCTGCACATGAAGAGGCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||
 105448 TGGCCCTGCACATGAAGAGGCACCTC