seq1 = pF1KB7961.tfa, 795 bp
seq2 = pF1KB7961/gi568815587r_34380221.tfa (gi568815587r:34380221_34605756), 225536 bp

>pF1KB7961 795
>gi568815587r:34380221_34605756 (Chr11)

(complement)

1-26  (94188-94213)   100% ->
27-151  (100004-100128)   100% ->
152-385  (112045-112278)   100% ->
386-436  (115698-115748)   100% ->
437-505  (123258-123326)   100% ->
506-701  (124790-124985)   100% ->
702-795  (125443-125536)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCATCTCTGCCTCACTCCCACAG         GGTAATGTTGGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
  94188 ATGCCATCTCTGCCTCACTCCCACAGGTA...CAGGGTAATGTTGGACTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GGTGACACACAGCACCTTCCTGCCTAATGCATCCTTCTGCGATCCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100019 GGTGACACACAGCACCTTCCTGCCTAATGCATCCTTCTGCGATCCCCTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGTCGTGGACTGATCTGTTCAGCAATGAAGAGTACTACCCTGCCTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100069 TGTCGTGGACTGATCTGTTCAGCAATGAAGAGTACTACCCTGCCTTTGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CATCAGACAG         CCTGTGACTCATACTGGACATCAGTCCACCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100119 CATCAGACAGGTG...CAGCCTGTGACTCATACTGGACATCAGTCCACCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGAATACTGGACTAAGCGCCATGTGTGGGAGTGGCTCCAGTTCTGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112076 TGAATACTGGACTAAGCGCCATGTGTGGGAGTGGCTCCAGTTCTGCTGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACCAGTACAAGTTGGACACCAATTGCATCTCCTTCTGCAACTTCAACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112126 ACCAGTACAAGTTGGACACCAATTGCATCTCCTTCTGCAACTTCAACATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGTGGCCTGCAGCTGTGCAGCATGACACAGGAGGAGTTCGTCGAGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112176 AGTGGCCTGCAGCTGTGCAGCATGACACAGGAGGAGTTCGTCGAGGCAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGGCCTCTGCGGCGAGTACCTGTACTTCATCCTCCAGAACATCCGCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112226 TGGCCTCTGCGGCGAGTACCTGTACTTCATCCTCCAGAACATCCGCACAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAG         GTTACTCCTTTTTTAATGACGCTGAAGAAAGCAAGGCC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112276 AAGGTC...CAGGTTACTCCTTTTTTAATGACGCTGAAGAAAGCAAGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACCATCAAAGACT         ATGCTGATTCCAACTGCTTGAAAACAAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 115736 ACCATCAAAGACTGTA...CAGATGCTGATTCCAACTGCTTGAAAACAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGGCATCAAAAGTCAAGACTGTCACAGTCATAGTAGAACAA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 123286 TGGCATCAAAAGTCAAGACTGTCACAGTCATAGTAGAACAAGTA...AAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GCCTCCAAAGTTCTCATCTATGGGAATTTGTACGAGACCTGCTTCTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124790 GCCTCCAAAGTTCTCATCTATGGGAATTTGTACGAGACCTGCTTCTATCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CCTGAAGAAAACTGTGGCATTCTGGAATGGGAAGATAGGGAACAAGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124840 CCTGAAGAAAACTGTGGCATTCTGGAATGGGAAGATAGGGAACAAGGAAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TTTTCGGGTGGTTAAATCGGAAGCCCTGGCAAAGATGTGGGGACAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124890 TTTTCGGGTGGTTAAATCGGAAGCCCTGGCAAAGATGTGGGGACAAAGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGAAAAATGACAGAATGACATATGAAAAGTTGAGCAGAGCCCTGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 124940 AGAAAAATGACAGAATGACATATGAAAAGTTGAGCAGAGCCCTGAGGTA.

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    702      ATACTACTATAAAACAGGAATTTTGGAGCGGGTTGACCGAAGGTT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124990 ..CAGATACTACTATAAAACAGGAATTTTGGAGCGGGTTGACCGAAGGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    747 AGTGTACAAATTTGGAAAAAATGCACACGGGTGGCAGGAAGACAAGCTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125488 AGTGTACAAATTTGGAAAAAATGCACACGGGTGGCAGGAAGACAAGCTA