seq1 = pF1KB7958.tfa, 1188 bp
seq2 = pF1KB7958/gi568815593r_60774618.tfa (gi568815593r:60774618_61045008), 270391 bp

>pF1KB7958 1188
>gi568815593r:60774618_61045008 (Chr5)

(complement)

1-77  (100001-100077)   100% ->
78-173  (116050-116145)   100% ->
174-275  (122854-122955)   100% ->
276-399  (126621-126744)   100% ->
400-481  (140136-140217)   100% ->
482-550  (141293-141361)   100% ->
551-617  (142501-142567)   100% ->
618-718  (145282-145382)   100% ->
719-843  (146609-146733)   100% ->
844-1041  (153923-154120)   100% ->
1042-1122  (157489-157569)   100% ->
1123-1188  (170326-170391)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGGGTTTTTGTCCGCACGCCAAACGGGTTTGGAGGACCCTCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGGGGTTTTTGTCCGCACGCCAAACGGGTTTGGAGGACCCTCTTCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTTCGGAGAGCAGAGTCAACACGGAG         AGTTTTGGGACTGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100051 CCTTCGGAGAGCAGAGTCAACACGGAGGTA...AAGAGTTTTGGGACTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AATTAAATAAAGACAGAGATGTTGAAAGAATCCACGGCGGTGGAATTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116064 AATTAAATAAAGACAGAGATGTTGAAAGAATCCACGGCGGTGGAATTAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCCTTGACATTGAACCTGTTGAAGGGAGATA         CATGTTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 116114 ACCCTTGACATTGAACCTGTTGAAGGGAGATAGTA...CAGCATGTTATC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGGTGGTTCAGATGGTGTGATTGTACTTTATGACCTTGAGAACTCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122863 AGGTGGTTCAGATGGTGTGATTGTACTTTATGACCTTGAGAACTCCAGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GACAATCTTATTACACATGTAAAGCAGTGTGTTCCATTGGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 122913 GACAATCTTATTACACATGTAAAGCAGTGTGTTCCATTGGCAGGTA...T

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    276   AGATCATCCTGATGTTCACAGATACAGTGTGGAGACTGTACAGTGGTA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126619 AGAGATCATCCTGATGTTCACAGATACAGTGTGGAGACTGTACAGTGGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCCTCATGACACTGGCATGTTCACATCAAGCTCATTTGATAAAACTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126669 TCCTCATGACACTGGCATGTTCACATCAAGCTCATTTGATAAAACTCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAGTATGGGATACAAATACATTACAA         ACTGCAGATGTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 126719 AAGTATGGGATACAAATACATTACAAGTA...CAGACTGCAGATGTATTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AATTTTGAGGAAACAGTTTATAGTCATCATATGTCTCCAGTCTCCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140151 AATTTTGAGGAAACAGTTTATAGTCATCATATGTCTCCAGTCTCCACCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GCACTGTTTGGTAGCAG         TTGGTACTAGAGGACCCAAAGTAC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 140201 GCACTGTTTGGTAGCAGGTT...CAGTTGGTACTAGAGGACCCAAAGTAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AACTTTGTGACTTGAAGTCTGGATCCTGTTCTCACATTCTACAGG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 141317 AACTTTGTGACTTGAAGTCTGGATCCTGTTCTCACATTCTACAGGGTA..

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551     GTCACAGACAAGAAATATTAGCAGTTTCCTGGTCTCCACGTTATGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141367 .CAGGTCACAGACAAGAAATATTAGCAGTTTCCTGGTCTCCACGTTATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CTATATCTTGGCAACAGCAAG         TGCTGACAGTAGAGTAAAAT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 142547 CTATATCTTGGCAACAGCAAGGTA...CAGTGCTGACAGTAGAGTAAAAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 TATGGGATGTGAGAAGAGCATCAGGATGTTTGATTACTCTTGATCAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145302 TATGGGATGTGAGAAGAGCATCAGGATGTTTGATTACTCTTGATCAACAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 AATGGGAAAAAGTCACAAGCTGTTGAATCAG         CAAACACTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 145352 AATGGGAAAAAGTCACAAGCTGTTGAATCAGGTA...CAGCAAACACTGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 TCATAATGGGAAAGTTAATGGCTTATGTTTTACAAGTGATGGACTTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146619 TCATAATGGGAAAGTTAATGGCTTATGTTTTACAAGTGATGGACTTCACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 TCCTCACTGTTGGTACAGATAATCGAATGAGGCTCTGGAATAGTTCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146669 TCCTCACTGTTGGTACAGATAATCGAATGAGGCTCTGGAATAGTTCCAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GGAGAAAACACACTT         GTGAACTATGGAAAAGTTTGTAATAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 146719 GGAGAAAACACACTTGTA...CAGGTGAACTATGGAAAAGTTTGTAATAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 CAGTAAAAAAGGATTGAAATTCACTGTCTCCTGTGGCTGCAGTTCAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153949 CAGTAAAAAAGGATTGAAATTCACTGTCTCCTGTGGCTGCAGTTCAGAAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TTGTTTTTGTACCATATGGTAGCACCATTGCTGTTTATACAGTTTACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153999 TTGTTTTTGTACCATATGGTAGCACCATTGCTGTTTATACAGTTTACTCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GGAGAACAGATAACTATGCTTAAGGGACATTATAAAACTGTTGACTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154049 GGAGAACAGATAACTATGCTTAAGGGACATTATAAAACTGTTGACTGCTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TGTATTTCAGTCAAATTTCCAG         GAACTTTATAGTGGTAGCA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 154099 TGTATTTCAGTCAAATTTCCAGGTA...TAGGAACTTTATAGTGGTAGCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 GAGACTGCAACATTCTGGCTTGGGTTCCATCCTTATATGAACCAGTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157508 GAGACTGCAACATTCTGGCTTGGGTTCCATCCTTATATGAACCAGTTCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GATGATGATGAG         ACTACAACAAAATCACAATTAAATCCGGC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 157558 GATGATGATGAGGTA...TAGACTACAACAAAATCACAATTAAATCCGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .
   1152 CTTTGAAGATGCCTGGAGCAGCAGTGATGAAGAAGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170355 CTTTGAAGATGCCTGGAGCAGCAGTGATGAAGAAGGA