seq1 = pF1KB7950.tfa, 1182 bp
seq2 = pF1KB7950/gi568815597r_39797375.tfa (gi568815597r:39797375_40001888), 204514 bp

>pF1KB7950 1182
>gi568815597r:39797375_40001888 (Chr1)

(complement)

1-81  (100001-100081)   100% ->
82-586  (100446-100950)   100% ->
587-1182  (103919-104514)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGCGTGTGTGCTGGCTGCCGGGCTGCCCCGAGCCGGCGGGGAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGCGTGTGTGCTGGCTGCCGGGCTGCCCCGAGCCGGCGGGGAGCCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCCGCTCCAGGTGGCGGGCGGCTGGAGCGAG         GGAGCGGACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100051 TCCGCTCCAGGTGGCGGGCGGCTGGAGCGAGGTG...CAGGGAGCGGACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGACTACGACTCGTACCAGCACTATTTCTACGACTATGACTGCGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100456 TGGACTACGACTCGTACCAGCACTATTTCTACGACTATGACTGCGGGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GATTTCTACCGCTCCACGGCGCCCAGCGAGGACATCTGGAAGAAATTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100506 GATTTCTACCGCTCCACGGCGCCCAGCGAGGACATCTGGAAGAAATTCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGGTGCCATCGCCCCCCACGTCGCCGCCCTGGGGCTTGGGTCCCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100556 GCTGGTGCCATCGCCCCCCACGTCGCCGCCCTGGGGCTTGGGTCCCGGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGGGGACCCGGCCCCCGGGATTGGTCCCCCGGAGCCGTGGCCCGGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100606 CAGGGGACCCGGCCCCCGGGATTGGTCCCCCGGAGCCGTGGCCCGGAGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGCACCGGAGACGAAGCGGAATCCCGGGGCCACTCGAAAGGCTGGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100656 TGCACCGGAGACGAAGCGGAATCCCGGGGCCACTCGAAAGGCTGGGGCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAACTACGCCTCCATCATACGCCGTGACTGCATGTGGAGCGGCTTCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100706 GAACTACGCCTCCATCATACGCCGTGACTGCATGTGGAGCGGCTTCTCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCCGGGAACGGCTGGAGAGAGCTGTGAGCGACCGGCTCGCTCCTGGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100756 CCCGGGAACGGCTGGAGAGAGCTGTGAGCGACCGGCTCGCTCCTGGCGCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CCCCGGGGGAACCCGCCCAAGGCGTCCGCCGCCCCGGACTGCACTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100806 CCCCGGGGGAACCCGCCCAAGGCGTCCGCCGCCCCGGACTGCACTCCCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CCTCGAAGCCGGCAACCCGGCGCCCGCCGCCCCCTGTCCGCTGGGCGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100856 CCTCGAAGCCGGCAACCCGGCGCCCGCCGCCCCCTGTCCGCTGGGCGAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CCAAGACCCAGGCCTGCTCCGGGTCCGAGAGCCCAAGCGACTCGG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100906 CCAAGACCCAGGCCTGCTCCGGGTCCGAGAGCCCAAGCGACTCGGGTA..

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    587     AGAATGAAGAAATTGATGTTGTGACAGTAGAGAAGAGGCAGTCTCT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100956 .CAGAGAATGAAGAAATTGATGTTGTGACAGTAGAGAAGAGGCAGTCTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GGGTATTCGGAAGCCGGTCACCATCACGGTGCGAGCAGACCCCCTGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103965 GGGTATTCGGAAGCCGGTCACCATCACGGTGCGAGCAGACCCCCTGGATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CCTGCATGAAGCATTTCCACATCTCCATCCATCAGCAACAGCACAACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104015 CCTGCATGAAGCATTTCCACATCTCCATCCATCAGCAACAGCACAACTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GCTGCCCGTTTTCCTCCAGAAAGCTGCTCCCAAGAAGAGGCTTCAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104065 GCTGCCCGTTTTCCTCCAGAAAGCTGCTCCCAAGAAGAGGCTTCAGAGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GGGTCCCCAAGAAGAGGTTCTGGAGAGAGATGCTGCAGGGGAAAAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104115 GGGTCCCCAAGAAGAGGTTCTGGAGAGAGATGCTGCAGGGGAAAAGGAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 ATGAGGAGGATGAAGAGATTGTGAGTCCCCCACCTGTAGAAAGTGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104165 ATGAGGAGGATGAAGAGATTGTGAGTCCCCCACCTGTAGAAAGTGAGGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GCCCAGTCCTGCCACCCCAAACCTGTCAGTTCTGATACTGAGGATGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104215 GCCCAGTCCTGCCACCCCAAACCTGTCAGTTCTGATACTGAGGATGTGAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CAAGAGGAAGAATCACAACTTCCTGGAGCGCAAGAGGCGGAATGACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104265 CAAGAGGAAGAATCACAACTTCCTGGAGCGCAAGAGGCGGAATGACCTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 GTTCGCGATTCTTGGCGCTGAGGGACCAGGTGCCCACCCTGGCCAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104315 GTTCGCGATTCTTGGCGCTGAGGGACCAGGTGCCCACCCTGGCCAGCTGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 TCCAAGGCCCCCAAAGTAGTGATCCTAAGCAAGGCCTTGGAATACTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104365 TCCAAGGCCCCCAAAGTAGTGATCCTAAGCAAGGCCTTGGAATACTTGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 AGCCCTGGTGGGGGCTGAGAAGAGGATGGCTACAGAGAAAAGACAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104415 AGCCCTGGTGGGGGCTGAGAAGAGGATGGCTACAGAGAAAAGACAGCTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 GATGCCGGCAGCAGCAGTTGCAGAAAAGAATTGCATACCTCACTGGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104465 GATGCCGGCAGCAGCAGTTGCAGAAAAGAATTGCATACCTCACTGGCTAC