seq1 = pF1KB7948.tfa, 1125 bp
seq2 = pF1KB7948/gi568815588r_119475668.tfa (gi568815588r:119475668_119688248), 212581 bp

>pF1KB7948 1125
>gi568815588r:119475668_119688248 (Chr10)

(complement)

1-32  (91784-91815)   100% ->
33-129  (100001-100097)   100% ->
130-228  (105692-105790)   100% ->
229-283  (106026-106080)   100% ->
284-371  (106240-106327)   100% ->
372-447  (108239-108314)   100% ->
448-556  (109415-109523)   100% ->
557-652  (110513-110608)   100% ->
653-737  (110714-110798)   100% ->
738-861  (111046-111169)   100% ->
862-1001  (111499-111638)   100% ->
1002-1125  (112458-112581)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGGAAGACGACGGGCAGCCCCGGACTCT         ATACGTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
  91784 ATGATGGAAGACGACGGGCAGCCCCGGACTCTGTG...CAGATACGTAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TAACCTTTCCAGAGATGTGACAGAAGTCCTTATACTTCAGTTGTTCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100010 TAACCTTTCCAGAGATGTGACAGAAGTCCTTATACTTCAGTTGTTCAGTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGATTGGACCCTGTAAAAGCTGTAAAATGATAACAGAG         CAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100060 AGATTGGACCCTGTAAAAGCTGTAAAATGATAACAGAGGTA...CAGCAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ACAAGCAATGACCCATATTGCTTTGTGGAATTTTATGAACACAGAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105695 ACAAGCAATGACCCATATTGCTTTGTGGAATTTTATGAACACAGAGATGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGCTGCTGCATTAGCTGCTATGAATGGGAGAAAAATTTTGGGAAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 105745 AGCTGCTGCATTAGCTGCTATGAATGGGAGAAAAATTTTGGGAAAGGTA.

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    229      GAGGTCAAAGTAAACTGGGCAACCACACCAAGTAGCCAGAAAAAA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105795 ..TAGGAGGTCAAAGTAAACTGGGCAACCACACCAAGTAGCCAGAAAAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GATACTTCCA         ATCACTTCCATGTGTTTGTTGGGGATTTGAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 106071 GATACTTCCAGTA...CAGATCACTTCCATGTGTTTGTTGGGGATTTGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TCCAGAAATTACAACAGAAGATATCAAATCAGCATTTGCCCCCTTTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106271 TCCAGAAATTACAACAGAAGATATCAAATCAGCATTTGCCCCCTTTGGTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AAATATC         GGATGCCCGGGTAGTTAAAGACATGGCAACTGGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106321 AAATATCGTA...CAGGGATGCCCGGGTAGTTAAAGACATGGCAACTGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 AAATCCAAAGGCTATGGTTTTGTATCTTTTTATAACAAACTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 108273 AAATCCAAAGGCTATGGTTTTGTATCTTTTTATAACAAACTGGTA...TA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    448  GATGCAGAAAATGCGATTGTGCATATGGGCGGTCAGTGGTTGGGTGGTC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109414 GGATGCAGAAAATGCGATTGTGCATATGGGCGGTCAGTGGTTGGGTGGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 GTCAAATCCGAACCAATTGGGCCACTCGTAAACCACCTGCACCTAAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109464 GTCAAATCCGAACCAATTGGGCCACTCGTAAACCACCTGCACCTAAAAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 ACACAAGAAA         ACAACACTAAGCAGTTGAGATTTGAAGATGT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 109514 ACACAAGAAAGTA...CAGACAACACTAAGCAGTTGAGATTTGAAGATGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 AGTAAACCAGTCAAGTCCAAAAAATTGTACTGTGTACTGTGGAGGAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110544 AGTAAACCAGTCAAGTCCAAAAAATTGTACTGTGTACTGTGGAGGAATTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 CGTCTGGGTTAACAG         ATCAGCTTATGAGACAGACATTCTCA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 110594 CGTCTGGGTTAACAGGTA...TAGATCAGCTTATGAGACAGACATTCTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 CCATTTGGACAAATTATGGAAATAAGAGTTTTCCCAGAAAAGGGCTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110740 CCATTTGGACAAATTATGGAAATAAGAGTTTTCCCAGAAAAGGGCTATTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 ATTTGTCAG         ATTTTCAACCCATGAAAGTGCAGCCCATGCCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 110790 ATTTGTCAGGTA...TAGATTTTCAACCCATGAAAGTGCAGCCCATGCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 TTGTTTCGGTGAACGGTACTACGATTGAAGGACATGTGGTTAAATGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111078 TTGTTTCGGTGAACGGTACTACGATTGAAGGACATGTGGTTAAATGCTAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 TGGGGTAAAGAATCTCCTGATATGACTAAAAACTTCCAACAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 111128 TGGGGTAAAGAATCTCCTGATATGACTAAAAACTTCCAACAGGTA...TA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    862  GTTGACTATAGTCAATGGGGCCAATGGAGCCAAGTGTATGGAAACCCAC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111498 GGTTGACTATAGTCAATGGGGCCAATGGAGCCAAGTGTATGGAAACCCAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 AACAGTATGGACAGTATATGGCAAATGGGTGGCAAGTACCGCCTTATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111548 AACAGTATGGACAGTATATGGCAAATGGGTGGCAAGTACCGCCTTATGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 GTATACGGGCAACCATGGAATCAACAAGGATTTGGAGTAGA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 111598 GTATACGGGCAACCATGGAATCAACAAGGATTTGGAGTAGAGTA...AAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 TCAATCACCTTCTGCTGCTTGGATGGGTGGATTTGGTGCTCAGCCTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112458 TCAATCACCTTCTGCTGCTTGGATGGGTGGATTTGGTGCTCAGCCTCCCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 AAGGACAAGCTCCTCCCCCTGTAATACCTCCTCCTAACCAAGCCGGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112508 AAGGACAAGCTCCTCCCCCTGTAATACCTCCTCCTAACCAAGCCGGATAT

   1200     .    :    .    :
   1102 GGTATGGCAAGTTACCAAACACAG
        ||||||||||||||||||||||||
 112558 GGTATGGCAAGTTACCAAACACAG