seq1 = pF1KB7937.tfa, 1128 bp
seq2 = pF1KB7937/gi568815584r_81080226.tfa (gi568815584r:81080226_81316515), 236290 bp

>pF1KB7937 1128
>gi568815584r:81080226_81316515 (Chr14)

(complement)

1-30  (95998-96027)   100% ->
31-132  (100002-100103)   100% ->
133-337  (112412-112616)   100% ->
338-402  (114858-114922)   100% ->
403-478  (119032-119107)   100% ->
479-612  (120275-120408)   100% ->
613-933  (123677-123997)   100% ->
934-1023  (130896-130985)   100% ->
1024-1128  (136186-136290)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGAACTCGGCAAATACAAACACCGTG         CCTAAATTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
  95998 ATGGCGAACTCGGCAAATACAAACACCGTGGTA...AAGCCTAAATTATA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CAGATCTGTGATTGAAGATGTCATTAATGATGTGAGAGACATCTTTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100013 CAGATCTGTGATTGAAGATGTCATTAATGATGTGAGAGACATCTTTCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGATGGAGTGGATGAACAAGTACTGATGGAACTAAAAACT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100063 ATGATGGAGTGGATGAACAAGTACTGATGGAACTAAAAACTGTG...TAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TTATGGGAAAACAAACTAATGCAGTCCAGGGCAGTAGATGGATTTCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112412 TTATGGGAAAACAAACTAATGCAGTCCAGGGCAGTAGATGGATTTCATTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGAAGAGCAGCAGCTTCTACTGCAAGTTCAACAGCAGCATCAACCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112462 AGAAGAGCAGCAGCTTCTACTGCAAGTTCAACAGCAGCATCAACCCCAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGCAGCAGCATCACCACCATCACCATCATCAGCAAGCTCAGCCTCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112512 AGCAGCAGCATCACCACCATCACCATCATCAGCAAGCTCAGCCTCAGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACAGTACCTCAGCAAGCGCAGACCCAGCAGGTTCTTATTCCTGCATCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112562 ACAGTACCTCAGCAAGCGCAGACCCAGCAGGTTCTTATTCCTGCATCACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCAAG         CCACAGCACCACAAGTTATTGTTCCAGATTCTAAGT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112612 GCAAGGTG...TAGCCACAGCACCACAAGTTATTGTTCCAGATTCTAAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGATACAGCATATGAATGCATCAAACATG         AGTGCTGCTGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 114894 TGATACAGCATATGAATGCATCAAACATGGTA...CAGAGTGCTGCTGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ACAGCTGCTACCTTAGCACTCCCTGCAGGTGTGACTCCTGTTCAGCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119044 ACAGCTGCTACCTTAGCACTCCCTGCAGGTGTGACTCCTGTTCAGCAGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ATTAACAAATTCAG         GCCAGCTTCTTCAGGTGGTCAGAGCAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 119094 ATTAACAAATTCAGGTA...TAGGCCAGCTTCTTCAGGTGGTCAGAGCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CCAATGGTGCCCAATATATCTTTCAGCCTCAGCAGTCAGTGGTTCTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120302 CCAATGGTGCCCAATATATCTTTCAGCCTCAGCAGTCAGTGGTTCTACAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CAACAGGTTATACCACAAATGCAGCCTGGTGGAGTACAAGCTCCTGTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120352 CAACAGGTTATACCACAAATGCAGCCTGGTGGAGTACAAGCTCCTGTTAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ACAGCAG         GTGCTGGCTCCTCTTCCTGGAGGGATTTCACCAC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120402 ACAGCAGGTA...TAGGTGCTGGCTCCTCTTCCTGGAGGGATTTCACCAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AGACAGGTGTCATCATCCAGCCTCAGCAAATCTTATTTACAGGAAATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123711 AGACAGGTGTCATCATCCAGCCTCAGCAAATCTTATTTACAGGAAATAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ACTCAAGTTATACCTACGACAGTGGCAGCACCTACACCAGCCCAAGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123761 ACTCAAGTTATACCTACGACAGTGGCAGCACCTACACCAGCCCAAGCACA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GATAACTGCAACTGGCCAGCAGCAACCGCAGGCCCAGCCTGCTCAAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123811 GATAACTGCAACTGGCCAGCAGCAACCGCAGGCCCAGCCTGCTCAAACAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AAGCTCCATTGGTCTTACAAGTTGATGGAACTGGGGATACATCATCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123861 AAGCTCCATTGGTCTTACAAGTTGATGGAACTGGGGATACATCATCTGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GAAGATGAAGATGAAGAAGAAGACTATGATGATGATGAGGAGGAAGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123911 GAAGATGAAGATGAAGAAGAAGACTATGATGATGATGAGGAGGAAGACAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AGAGAAAGATGGAGCTGAAGATGGGCAGGTGGAAGAA         GAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 123961 AGAGAAAGATGGAGCTGAAGATGGGCAGGTGGAAGAAGTA...TAGGAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCCTCAATAGTGAAGATGATGTGAGTGATGAGGAAGGACAGGAACTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130900 CCCTCAATAGTGAAGATGATGTGAGTGATGAGGAAGGACAGGAACTCTTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GACACAGAAAATGTTGTTGTATGCCAATATGATAAG         ATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 130950 GACACAGAAAATGTTGTTGTATGCCAATATGATAAGGTA...TAGATACA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CAGAAGTAAAAACAAATGGAAATTTCATCTCAAGGATGGCATTATGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136191 CAGAAGTAAAAACAAATGGAAATTTCATCTCAAGGATGGCATTATGAATC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TTAATGGAAGAGATTATATATTTTCCAAAGCCATTGGAGATGCAGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136241 TTAATGGAAGAGATTATATATTTTCCAAAGCCATTGGAGATGCAGAATGG