seq1 = pF1KB7935.tfa, 1113 bp
seq2 = pF1KB7935/gi568815597f_201911137.tfa (gi568815597f:201911137_202115320), 204184 bp

>pF1KB7935 1113
>gi568815597f:201911137_202115320 (Chr1)

1-163  (100001-100163)   100% ->
164-385  (100821-101042)   100% ->
386-478  (101208-101300)   100% ->
479-598  (101504-101623)   100% ->
599-688  (101811-101900)   100% ->
689-805  (102046-102162)   100% ->
806-1001  (102693-102888)   100% ->
1002-1113  (104073-104184)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCAACCTGTGAGATTAGCAACATTTTTAGCAACTACTTCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCAACCTGTGAGATTAGCAACATTTTTAGCAACTACTTCAGTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATGTACAGCTCGGAGGACTCCACCCTGGCCTCTGTTCCCCCTGCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATGTACAGCTCGGAGGACTCCACCCTGGCCTCTGTTCCCCCTGCTGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTTTGGGGCCGATGACTTGGTACTGACCCTGAGCAACCCCCAGATGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTTTGGGGCCGATGACTTGGTACTGACCCTGAGCAACCCCCAGATGTCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGGAGGGTACAG         AGAAGGCCAGCTGGTTGGGGGAACAGCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGGAGGGTACAGGTG...CAGAGAAGGCCAGCTGGTTGGGGGAACAGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCAGTTCTGGTCGAAGACGCAGGTTCTGGACTGGATCAGCTACCAAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100849 CCAGTTCTGGTCGAAGACGCAGGTTCTGGACTGGATCAGCTACCAAGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGAAGAACAAGTACGACGCAAGCGCCATTGACTTCTCACGATGTGACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100899 AGAAGAACAAGTACGACGCAAGCGCCATTGACTTCTCACGATGTGACATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GATGGCGCCACCCTCTGCAATTGTGCCCTTGAGGAGCTGCGTCTGGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100949 GATGGCGCCACCCTCTGCAATTGTGCCCTTGAGGAGCTGCGTCTGGTCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGGGCCTCTGGGGGACCAACTCCATGCCCAGCTGCGAGACCTCA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100999 TGGGCCTCTGGGGGACCAACTCCATGCCCAGCTGCGAGACCTCAGTG...

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    386    CTTCCAGCTCTTCTGATGAGCTCAGTTGGATCATTGAGCTGCTGGAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101205 CAGCTTCCAGCTCTTCTGATGAGCTCAGTTGGATCATTGAGCTGCTGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAGGATGGCATGGCCTTCCAGGAGGCCCTAGACCCAGGGCCCTTTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 101255 AAGGATGGCATGGCCTTCCAGGAGGCCCTAGACCCAGGGCCCTTTGGTG.

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    479      ACCAGGGCAGCCCCTTTGCCCAGGAGCTGCTGGACGACGGTCAGC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101305 ..CAGACCAGGGCAGCCCCTTTGCCCAGGAGCTGCTGGACGACGGTCAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAGCCAGCCCCTACCACCCCGGCAGCTGTGGCGCAGGAGCCCCCTCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101549 AAGCCAGCCCCTACCACCCCGGCAGCTGTGGCGCAGGAGCCCCCTCCCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGCAGCTCTGACGTCTCCACCGCAG         GGACTGGTGCTTCTCG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 101599 GGCAGCTCTGACGTCTCCACCGCAGGTG...CAGGGACTGGTGCTTCTCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GAGCTCCCACTCCTCAGACTCCGGTGGAAGTGACGTGGACCTGGATCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101827 GAGCTCCCACTCCTCAGACTCCGGTGGAAGTGACGTGGACCTGGATCCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CTGATGGCAAGCTCTTCCCCAGCG         ATGGTTTTCGTGACTGC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 101877 CTGATGGCAAGCTCTTCCCCAGCGGTG...CAGATGGTTTTCGTGACTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAGAAGGGGGATCCCAAGCACGGGAAGCGGAAACGAGGCCGGCCCCGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102063 AAGAAGGGGGATCCCAAGCACGGGAAGCGGAAACGAGGCCGGCCCCGAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GCTGAGCAAAGAGTACTGGGACTGTCTCGAGGGCAAGAAGAGCAAGCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102113 GCTGAGCAAAGAGTACTGGGACTGTCTCGAGGGCAAGAAGAGCAAGCACG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806          CGCCCAGAGGCACCCACCTGTGGGAGTTCATCCGGGACATC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102163 GTG...CAGCGCCCAGAGGCACCCACCTGTGGGAGTTCATCCGGGACATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTCATCCACCCGGAGCTCAACGAGGGCCTCATGAAGTGGGAGAATCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102734 CTCATCCACCCGGAGCTCAACGAGGGCCTCATGAAGTGGGAGAATCGGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TGAAGGCGTCTTCAAGTTCCTGCGCTCCGAGGCTGTGGCCCAACTATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102784 TGAAGGCGTCTTCAAGTTCCTGCGCTCCGAGGCTGTGGCCCAACTATGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GCCAAAAGAAAAAGAACAGCAACATGACCTACGAGAAGCTGAGCCGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102834 GCCAAAAGAAAAAGAACAGCAACATGACCTACGAGAAGCTGAGCCGGGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 ATGAG         GTACTACTACAAACGGGAGATCCTGGAACGGGTGGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102884 ATGAGGTG...CAGGTACTACTACAAACGGGAGATCCTGGAACGGGTGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TGGCCGGCGACTCGTCTACAAGTTTGGCAAAAACTCAAGCGGCTGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104109 TGGCCGGCGACTCGTCTACAAGTTTGGCAAAAACTCAAGCGGCTGGAAGG

   1150     .    :    .    :    .
   1088 AGGAAGAGGTTCTCCAGAGTCGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||
 104159 AGGAAGAGGTTCTCCAGAGTCGGAAC