seq1 = pF1KB7933.tfa, 1101 bp
seq2 = pF1KB7933/gi568815594r_84393292.tfa (gi568815594r:84393292_84598228), 204937 bp

>pF1KB7933 1101
>gi568815594r:84393292_84598228 (Chr4)

(complement)

1-670  (100001-100670)   100% ->
671-843  (102385-102557)   100% ->
844-1101  (104680-104937)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTAGCGGTGGGGGCAATGGAGGGCACCCGGCAGAGCGCATTCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTAGCGGTGGGGGCAATGGAGGGCACCCGGCAGAGCGCATTCCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCAGCCCTCCCCTGGCCGCCCTGCACAGCATGGCCGAGATGAAGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCAGCCCTCCCCTGGCCGCCCTGCACAGCATGGCCGAGATGAAGACCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCTGTACCCTGCCGCGTATCCCCCGCTGCCTGCCGGCCCCCCCTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCTGTACCCTGCCGCGTATCCCCCGCTGCCTGCCGGCCCCCCCTCCTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCGTCCTCGTCGTCGTCCTCCTCGTCGCCCTCCCCGCCTCTGGGCACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCGTCCTCGTCGTCGTCCTCCTCGTCGCCCTCCCCGCCTCTGGGCACCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAACCCAGGCGGCCTGAAGCCCCCGGCCACGGGGGGGCTCTCATCCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAACCCAGGCGGCCTGAAGCCCCCGGCCACGGGGGGGCTCTCATCCCTCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCAGCCCCCCGCAGCAGCTCTCGGCCGCCACCCCACACGGCATCAACGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCAGCCCCCCGCAGCAGCTCTCGGCCGCCACCCCACACGGCATCAACGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATCCTGAGCCGGCCCTCCATGCCCGTGGCCTCGGGGGCCGCCCTGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATCCTGAGCCGGCCCTCCATGCCCGTGGCCTCGGGGGCCGCCCTGCCCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGCCTCGCCCTCCGGTTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCGTCCGCCTCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGCCTCGCCCTCCGGTTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCGTCCGCCTCTGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCTCCGCCTCTGCCGCCGCCGCGGCTGCTGCCGCGGCCGCAGCCGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCTCCGCCTCTGCCGCCGCCGCGGCTGCTGCCGCGGCCGCAGCCGCCGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCATCCCCGGCGGGGCTGCTGGCCGGACTGCCACGCTTTAGCAGCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCATCCCCGGCGGGGCTGCTGGCCGGACTGCCACGCTTTAGCAGCCTGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCCGCCGCCGCCGCCGCCCGGGCTCTACTTCAGCCCCAGCGCCGCGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCCGCCGCCGCCGCCGCCCGGGCTCTACTTCAGCCCCAGCGCCGCGGCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGGCCGCCGTGGGCCGGTACCCCAAGCCGCTGGCTGAGCTGCCTGGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGGCCGCCGTGGGCCGGTACCCCAAGCCGCTGGCTGAGCTGCCTGGCCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACGCCCATCTTCTGGCCCGGAGTGATGCAGAGCCCGCCCTGGAGGGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACGCCCATCTTCTGGCCCGGAGTGATGCAGAGCCCGCCCTGGAGGGACGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ACGCCTGGCCTGTACCCCTC         ATCAAGGATCCATTTTGTTGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100651 ACGCCTGGCCTGTACCCCTCGTG...CAGATCAAGGATCCATTTTGTTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ACAAAGACGGGAAGAGAAAACACACGAGACCCACTTTTTCCGGACAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102406 ACAAAGACGGGAAGAGAAAACACACGAGACCCACTTTTTCCGGACAGCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 ATCTTCGCCCTGGAGAAGACTTTCGAACAAACAAAATACTTGGCGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102456 ATCTTCGCCCTGGAGAAGACTTTCGAACAAACAAAATACTTGGCGGGGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CGAGAGGGCTCGTTTGGCCTATTCGTTGGGGATGACAGAGAGTCAGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102506 CGAGAGGGCTCGTTTGGCCTATTCGTTGGGGATGACAGAGAGTCAGGTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AG         GTCTGGTTCCAGAACCGCCGGACCAAGTGGAGGAAGAAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102556 AGGTG...CAGGTCTGGTTCCAGAACCGCCGGACCAAGTGGAGGAAGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 CACGCTGCCGAGATGGCCACGGCCAAGAAGAAGCAGGACTCGGAGACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104719 CACGCTGCCGAGATGGCCACGGCCAAGAAGAAGCAGGACTCGGAGACAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GCGCCTCAAGGGGGCCTCGGAGAACGAGGAAGAGGACGACGACTACAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104769 GCGCCTCAAGGGGGCCTCGGAGAACGAGGAAGAGGACGACGACTACAATA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 AGCCTCTGGATCCCAACTCGGACGACGAGAAAATCACGCAGCTGTTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104819 AGCCTCTGGATCCCAACTCGGACGACGAGAAAATCACGCAGCTGTTGAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 AAGCACAAGTCCAGCAGCGGCGGCGGCGGCGGCCTCCTACTGCACGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104869 AAGCACAAGTCCAGCAGCGGCGGCGGCGGCGGCCTCCTACTGCACGCGTC

   1100     .    :    .
   1083 CGAGCCGGAGAGCTCATCC
        |||||||||||||||||||
 104919 CGAGCCGGAGAGCTCATCC