seq1 = pF1KB7931.tfa, 1095 bp
seq2 = pF1KB7931/gi568815578r_24976264.tfa (gi568815578r:24976264_25182096), 205833 bp

>pF1KB7931 1095
>gi568815578r:24976264_25182096 (Chr20)

(complement)

1-424  (100001-100424)   100% ->
425-503  (102583-102661)   100% ->
504-627  (103145-103268)   100% ->
628-808  (104232-104412)   100% ->
809-1095  (105547-105833)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCGGCCGGGACTCGCTTTCCGACGGGCGCACTAGCAGCAGGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCGGCCGGGACTCGCTTTCCGACGGGCGCACTAGCAGCAGGGCGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGCCTGGCGGTTCCCCTAGGGGCTCGCGCCCCCGGGGCTTCGCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTGCCTGGCGGTTCCCCTAGGGGCTCGCGCCCCCGGGGCTTCGCCATCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGACCTGCTGGGCTTGGAGGCCGAGCTGCCGGCGCCCGCTGGCCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGACCTGCTGGGCTTGGAGGCCGAGCTGCCGGCGCCCGCTGGCCCAGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGGGATCTGGCTGCGAGGGTCCGGCAGTCGCGCCGTGCCCGGGCCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGGGATCTGGCTGCGAGGGTCCGGCAGTCGCGCCGTGCCCGGGCCCGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTTGACGGCTCCAGCCTGGCGCGTGGGGCCCTACCGCTGGGACTCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTTGACGGCTCCAGCCTGGCGCGTGGGGCCCTACCGCTGGGACTCGGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCTCTGTGGCTTCGGCACGCAGCCGCCGGCGGCCGCTCGAGCACCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCCTCTGTGGCTTCGGCACGCAGCCGCCGGCGGCCGCTCGAGCACCCTGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCTCCTAGCGGACGTGCCGTTCCTGCCGCCCAGGGGCCCCGAGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGCTCCTAGCGGACGTGCCGTTCCTGCCGCCCAGGGGCCCCGAGCCCGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGCCCCGCTGGCTCCCAGCCGTCCGCCGCCTGCGCTCGGCCGCCAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGCCCCGCTGGCTCCCAGCCGTCCGCCGCCTGCGCTCGGCCGCCAGAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCAGCGACAGCGTCTCCACGTCCG         ATGAGGACAGCCAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100401 GCAGCGACAGCGTCTCCACGTCCGGTA...CAGATGAGGACAGCCAGTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAAGACAGGAATGACCTAAAGGCATCCCCCACCTTGGGCAAGAGGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102600 GAAGACAGGAATGACCTAAAGGCATCCCCCACCTTGGGCAAGAGGAAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCGGCGGCACAG         GACAGTTTTCACTGCTCACCAGCTGGAAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 102650 GCGGCGGCACAGGTA...CAGGACAGTTTTCACTGCTCACCAGCTGGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGTTGGAGAAGGCATTCAGCGAGGCCCACTACCCTGATGTGTATGCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103174 AGTTGGAGAAGGCATTCAGCGAGGCCCACTACCCTGATGTGTATGCCCGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GAAATGCTGGCTGTGAAAACTGAGCTCCCCGAAGACCGGATACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 103224 GAAATGCTGGCTGTGAAAACTGAGCTCCCCGAAGACCGGATACAGGTG..

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    628     GTCTGGTTTCAAAACCGCAGGGCCAAATGGCGCAAGCGGGAGAAGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103274 .CAGGTCTGGTTTCAAAACCGCAGGGCCAAATGGCGCAAGCGGGAGAAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GCTGGGGCGGCAGCAGCGTGATGGCCGAGTACGGGCTGTACGGGGCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104278 GCTGGGGCGGCAGCAGCGTGATGGCCGAGTACGGGCTGTACGGGGCCATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GTGCGCCACTGCATCCCGCTGCCAGACTCCGTGCTCAACTCCGCCGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104328 GTGCGCCACTGCATCCCGCTGCCAGACTCCGTGCTCAACTCCGCCGAGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CGGCCTGCTGGGCTCCTGCGCGCCCTGGCTCCTGG         GGATGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 104378 CGGCCTGCTGGGCTCCTGCGCGCCCTGGCTCCTGGGTA...AAGGGATGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ATAAAAAATCCATGGGGATGATAAGGAAGCCAGGAAGTGAAGATAAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105553 ATAAAAAATCCATGGGGATGATAAGGAAGCCAGGAAGTGAAGATAAGTTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GCAGGACTCTGGGGCTCTGACCACTTCAAAGAAGGTTCTAGCCAGAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105603 GCAGGACTCTGGGGCTCTGACCACTTCAAAGAAGGTTCTAGCCAGAGTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GTCAGGATCACAGAGAGGCTCAGATAAAGTGAGCCCTGAGAATGGCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105653 GTCAGGATCACAGAGAGGCTCAGATAAAGTGAGCCCTGAGAATGGCTTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 AAGATGTGGCTATTGACCTCTCCAGCTCTGCCCGGCAGGAGACCAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105703 AAGATGTGGCTATTGACCTCTCCAGCTCTGCCCGGCAGGAGACCAAGAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GTGCACCCTGGGGCTGGTGCTCAAGGAGGCTCCAACTCCACGGCACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105753 GTGCACCCTGGGGCTGGTGCTCAAGGAGGCTCCAACTCCACGGCACTGGA

   1100     .    :    .    :    .    :
   1065 GGGGCCCCAGCCAGGGAAGGTGGGAGCCACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 105803 GGGGCCCCAGCCAGGGAAGGTGGGAGCCACA