seq1 = pF1KB7928.tfa, 600 bp
seq2 = pF1KB7928/gi568815575r_107614522.tfa (gi568815575r:107614522_107875419), 260898 bp

>pF1KB7928 600
>gi568815575r:107614522_107875419 (ChrX)

(complement)

1-320  (100001-100320)   100% ->
321-372  (159470-159521)   100% ->
373-600  (160671-160898)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCAGTCCAAGCTCGATTGCCGCTCACCTGTCGGCCTCGACTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCAGTCCAAGCTCGATTGCCGCTCACCTGTCGGCCTCGACTGCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAACTGCTGCCTGGACCTGGCCCATCGGAGTGGGCTCCAGCGAGGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAACTGCTGCCTGGACCTGGCCCATCGGAGTGGGCTCCAGCGAGGCAGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGGGGAGAACAACAACCCGGGCAGCCCTACAGTGAGCAACTTTCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGGGGAGAACAACAACCCGGGCAGCCCTACAGTGAGCAACTTTCGGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCAGGAAAAGCTGGTCTTTGAGAACCTCAATACCGACAAGCTCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGCAGGAAAAGCTGGTCTTTGAGAACCTCAATACCGACAAGCTCAACAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATAATGCGGCAGGATTCGCTAGAGCCGGTGCTGCGGGACCCCTGCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATAATGCGGCAGGATTCGCTAGAGCCGGTGCTGCGGGACCCCTGCTACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGATCAACGAGGGCATCTGCAACCGCAACATCGACCAGACCATGCTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGATCAACGAGGGCATCTGCAACCGCAACATCGACCAGACCATGCTCTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATCCTGCTCTTCTTCCACAG         TGCCTCCGGAGCCAGCGTGGT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100301 ATCCTGCTCTTCTTCCACAGGTG...CAGTGCCTCCGGAGCCAGCGTGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGCCATAGACAACAAGATCGAACAGGCCATG         GATCTGGTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 159491 GGCCATAGACAACAAGATCGAACAGGCCATGGTG...CAGGATCTGGTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGAATCATCTGATGTATGCTGTGAGAGAGGAGGTGGAGATCCTGAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160681 AGAATCATCTGATGTATGCTGTGAGAGAGGAGGTGGAGATCCTGAAGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAGATCCGAGAGCTGGTGGAGAAGAACTCCCAGCTAGAGCGTGAGAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160731 CAGATCCGAGAGCTGGTGGAGAAGAACTCCCAGCTAGAGCGTGAGAACAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCTGTTGAAGACCCTGGCAAGCCCAGAGCAGCTGGAGAAGTTCCAGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160781 CCTGTTGAAGACCCTGGCAAGCCCAGAGCAGCTGGAGAAGTTCCAGTCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GTCTGAGCCCTGAAGAGCCAGCTCCCGAATCCCCACAAGTGCCCGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160831 GTCTGAGCCCTGAAGAGCCAGCTCCCGAATCCCCACAAGTGCCCGAGGCC

    600     .    :    .
    583 CCTGGTGGTTCTGCGGTG
        ||||||||||||||||||
 160881 CCTGGTGGTTCTGCGGTG