seq1 = pF1KB7909.tfa, 402 bp
seq2 = pF1KB7909/gi568815597f_26069984.tfa (gi568815597f:26069984_26270713), 200730 bp

>pF1KB7909 402
>gi568815597f:26069984_26270713 (Chr1)

1-200  (100001-100200)   100% ->
201-263  (100435-100497)   100% ->
264-402  (100592-100730)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGTCGCTCCCGCCGGACAGGCGCGCACCGAGCGCACTCTCTAGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGTCGCTCCCGCCGGACAGGCGCGCACCGAGCGCACTCTCTAGCCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGATGAAGGCGAAGCGGCGGCGGCCGGACTTGGATGAGATTCACCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCAGATGAAGGCGAAGCGGCGGCGGCCGGACTTGGATGAGATTCACCGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCTGCGGCCTCAGGGATCCGCACGACCCCAGCCCGACCCAAACGCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCTGCGGCCTCAGGGATCCGCACGACCCCAGCCCGACCCAAACGCCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCGACCCCGACCTGCCAGGGGGCGGTCTGCACCGCTGTCTGGCCTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCGACCCCGACCTGCCAGGGGGCGGTCTGCACCGCTGTCTGGCCTGCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201          GAGGTACTTCATCGATTCCACCAACCTGAAGACCCACTTCC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTG...CAGGAGGTACTTCATCGATTCCACCAACCTGAAGACCCACTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GATCCAAAGACCACAAGAAAAG         GCTGAAGCAGCTGAGCGTC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100476 GATCCAAAGACCACAAGAAAAGGTA...CAGGCTGAAGCAGCTGAGCGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGCCCTACAGTCAGGAAGAGGCGGAGAGGGCAGCGGGTATGGGATCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100611 GAGCCCTACAGTCAGGAAGAGGCGGAGAGGGCAGCGGGTATGGGATCCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGTGCCCCCCAGGCGGCTGGCAGTGCCCACGGAAGTGTCCACTGAGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100661 TGTGCCCCCCAGGCGGCTGGCAGTGCCCACGGAAGTGTCCACTGAGGTCC

    400     .    :    .    :
    383 CTGAGATGGATACCTCTACC
        ||||||||||||||||||||
 100711 CTGAGATGGATACCTCTACC