seq1 = pF1KB7896.tfa, 1974 bp
seq2 = pF1KB7896/gi568815579f_57961579.tfa (gi568815579f:57961579_58168458), 206880 bp

>pF1KB7896 1974
>gi568815579f:57961579_58168458 (Chr19)

1-33  (98425-98457)   100% ->
34-160  (100002-100128)   99% ->
161-256  (101868-101963)   100% ->
257-1974  (105163-106880)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCCCTGGGGTGCGCGTCTCCACAGACCCG         GAGCAAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
  98425 ATGACCCCTGGGGTGCGCGTCTCCACAGACCCGGTG...CAGGAGCAAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GACGTTTGAGGACGTGGTAGTGGACTTCAGCCAGGAGGAGTGGGGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 100010 GACGTTTGAGGACGTGGTAGTGGGCTTCAGCCAGGAGGAGTGGGGGCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGAAGCCTGCCCAGAGGACCCTGTACCGTGATGTAATGCTGGACACCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100060 TGAAGCCTGCCCAGAGGACCCTGTACCGTGATGTAATGCTGGACACCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGGCTTCTGGTCTCTGTGG         GACATTGGTTACCGAAGCCGAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100110 AGGCTTCTGGTCTCTGTGGGTA...CAGGACATTGGTTACCGAAGCCGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGTCATCTCCCTGCTGGAGCAAGAGGCAGAGCTGTGGGCGGTGGAGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101890 TGTCATCTCCCTGCTGGAGCAAGAGGCAGAGCTGTGGGCGGTGGAGTCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GACTTCCCCAAGGCGTGTACCCAG         ACTTGGAAACTAGACCC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 101940 GACTTCCCCAAGGCGTGTACCCAGGTG...CAGACTTGGAAACTAGACCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAAGTCAAACTGTCAGTTCTAAAGCAAGGCATCTCTGAAGAAATATCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105180 AAAGTCAAACTGTCAGTTCTAAAGCAAGGCATCTCTGAAGAAATATCCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAGTGTCATCTTGGTAGAAAGATTCCTGTGGGATGGTCTGTGGTACTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105230 CAGTGTCATCTTGGTAGAAAGATTCCTGTGGGATGGTCTGTGGTACTGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGGGTGAGGACACTGAGGGCCACTGGGAATGGAGTTGTGAGAGTCTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105280 GGGGTGAGGACACTGAGGGCCACTGGGAATGGAGTTGTGAGAGTCTAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGCCTGGCAGTGCCGGTGGCCTTCACGCCTGTGAAGACGCCTGTTCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105330 AGCCTGGCAGTGCCGGTGGCCTTCACGCCTGTGAAGACGCCTGTTCTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCAGTGGCAGAGGAATGGGTTTGGGGAAAACATAAGTCTGAACCCTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105380 GCAGTGGCAGAGGAATGGGTTTGGGGAAAACATAAGTCTGAACCCTGATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCCCACATCAACCAATGACTCCTGAAAGACAAAGCCCCCACACATGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105430 TCCCACATCAACCAATGACTCCTGAAAGACAAAGCCCCCACACATGGGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACACGTGGAAAAAGGGAGAAGCCAGACCTAAATGTTTTACAGAAAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105480 ACACGTGGAAAAAGGGAGAAGCCAGACCTAAATGTTTTACAGAAAACCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGTAAAAGAGAAACCCTACAAATGTCAGGAATGCGGAAAGGCCTTTAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105530 TGTAAAAGAGAAACCCTACAAATGTCAGGAATGCGGAAAGGCCTTTAGTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ACAGCTCAGCACTTATCGAACACCACCGGACGCACACAGGAGAGAGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105580 ACAGCTCAGCACTTATCGAACACCACCGGACGCACACAGGAGAGAGACCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TATGAATGTCACGAATGCTTAAAAGGCTTCCGGAACAGCTCGGCACTTAC
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105630 TACGAATGTCACGAATGCTTAAAAGGCTTCCGGAACAGCTCGGCACTTAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CAAACACCAGAGAATCCATACTGGGGAGAAACCCTATAAATGCACTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105680 CAAACACCAGAGAATCCATACTGGGGAGAAACCCTATAAATGCACTCAGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GTGGGAGGACCTTCAACCAAATTGCCCCACTGATCCAGCACCAGAGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105730 GTGGGAGGACCTTCAACCAAATTGCCCCACTGATCCAGCACCAGAGAACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CACACAGGTGAGAAGCCCTATGAATGCAGCGAATGTGGGAAATCCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105780 CACACAGGTGAGAAGCCCTATGAATGCAGCGAATGTGGGAAATCCTTCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TTTTAGGTCCTCCTTCAGCCAGCACGAGCGAACTCACACAGGCGAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105830 TTTTAGGTCCTCCTTCAGCCAGCACGAGCGAACTCACACAGGCGAGAAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CCTACGAGTGCAGTGAGTGTGGGAAAGCCTTCCGGCAAAGCATCCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105880 CCTACGAGTGCAGTGAGTGTGGGAAAGCCTTCCGGCAAAGCATCCACCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 ACCCAGCATCTGCGAATCCACACTGGGGAGAAACCCTATCAGTGTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105930 ACCCAGCATCTGCGAATCCACACTGGGGAGAAACCCTATCAGTGTGGTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GTGTGGCAAGGCCTTCAGCCACAGCTCATCCTTGACCAAACACCAGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105980 GTGTGGCAAGGCCTTCAGCCACAGCTCATCCTTGACCAAACACCAGCGAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 TCCACACAGGGGAGAAGCCCTACGAGTGCCATGAGTGTGGAAAAGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106030 TCCACACAGGGGAGAAGCCCTACGAGTGCCATGAGTGTGGAAAAGCCTTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 ACCCAGATCACACCACTGATTCAGCACCAGAGGACCCACACAGGAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106080 ACCCAGATCACACCACTGATTCAGCACCAGAGGACCCACACAGGAGAAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 GCCCTATGAGTGTGGTGAGTGTGGGAAAGCCTTCAGTCAGAGCACACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106130 GCCCTATGAGTGTGGTGAGTGTGGGAAAGCCTTCAGTCAGAGCACACTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 TGACCGAGCATCGGAGGATTCACACAGGAGAGAAGCCCTATGGATGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106180 TGACCGAGCATCGGAGGATTCACACAGGAGAGAAGCCCTATGGATGCAAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 GAGTGTGGGAAAACCTTCAGCCACAGCTCCTCACTCAGCCAGCATGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106230 GAGTGTGGGAAAACCTTCAGCCACAGCTCCTCACTCAGCCAGCATGAGCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 GACACACACAGGAGAGAAGCCCTATGAGTGCAGTCAGTGTGGGAAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106280 GACACACACAGGAGAGAAGCCCTATGAGTGCAGTCAGTGTGGGAAGGCCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 TCCGGCAGAGCACACACCTCACCCAACACCAGCGAATCCACACAGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106330 TCCGGCAGAGCACACACCTCACCCAACACCAGCGAATCCACACAGGGGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 AAGCCCTATGAATGCAATGACTGCGGCAAGGCATTCAGTCACAGCTCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106380 AAGCCCTATGAATGCAATGACTGCGGCAAGGCATTCAGTCACAGCTCGTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 CCTCACCAAACATCAGCGAATCCACACTGGGGAGAAGCCCTACGAATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106430 CCTCACCAAACATCAGCGAATCCACACTGGGGAGAAGCCCTACGAATGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 ACCAGTGTGGCAGAGCCTTCAGCCAGCTTGCTCCCCTCATTCAGCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106480 ACCAGTGTGGCAGAGCCTTCAGCCAGCTTGCTCCCCTCATTCAGCATCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 AGGATCCACACAGGAGAGAAACCCTATGAATGTAACCAGTGTGGCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106530 AGGATCCACACAGGAGAGAAACCCTATGAATGTAACCAGTGTGGCAGAGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 CTTCAGCCAGAGCTCCCTTCTCATCGAACACCAGAGGATTCACACCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106580 CTTCAGCCAGAGCTCCCTTCTCATCGAACACCAGAGGATTCACACCAAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 AAAAGCCGTATGGGTGCAATGAGTGTGGGAAATCCTTCAGCCACAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106630 AAAAGCCGTATGGGTGCAATGAGTGTGGGAAATCCTTCAGCCACAGCTCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 TCGCTCAGCCAGCACGAAAGGACGCACACTGGGGAAAAGCCCTATGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106680 TCGCTCAGCCAGCACGAAAGGACGCACACTGGGGAAAAGCCCTATGAGTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 TCACGATTGCGGAAAGTCCTTTAGGCAGAGCACCCACCTCACTCAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106730 TCACGATTGCGGAAAGTCCTTTAGGCAGAGCACCCACCTCACTCAGCACC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1874 GGAGGATCCACACAGGAGAGAAGCCATATGCATGCAGGGACTGTGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106780 GGAGGATCCACACAGGAGAGAAGCCATATGCATGCAGGGACTGTGGAAAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1924 GCCTTTACCCACAGCTCCTCCCTTACCAAGCACCAGAGAACTCACACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106830 GCCTTTACCCACAGCTCCTCCCTTACCAAGCACCAGAGAACTCACACTGG

   2000 
   1974 A
        |
 106880 A