seq1 = pF1KB7893.tfa, 1764 bp
seq2 = pF1KB7893/gi568815587r_120012417.tfa (gi568815587r:120012417_120238031), 225615 bp

>pF1KB7893 1764
>gi568815587r:120012417_120238031 (Chr11)

(complement)

1-804  (100001-100804)   100% ->
805-900  (109537-109632)   98% ->
901-1134  (110463-110696)   100% ->
1135-1333  (112143-112341)   100% ->
1334-1435  (114977-115078)   100% ->
1436-1528  (117367-117459)   100% ->
1529-1627  (119711-119809)   100% ->
1628-1704  (122618-122694)   100% ->
1705-1764  (125556-125615)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGCTGCAGATGCCTCCAGGAGCAACGGGTCGAGCCCAGAAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAGCTGCAGATGCCTCCAGGAGCAACGGGTCGAGCCCAGAAGCCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGATGCCCGGAGCCCGTCGGGCCCCAGTGGCAGCCTGGAGAATGGCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGATGCCCGGAGCCCGTCGGGCCCCAGTGGCAGCCTGGAGAATGGCACCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGCTGACGGCAAGGATGCCAAGACCACCAACGGGCACGGCGGGGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGCTGACGGCAAGGATGCCAAGACCACCAACGGGCACGGCGGGGAGGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTGAGGGCAAGAGCCTGGGCAGCGCCCTGAAGCCAGGGGAAGGTAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCTGAGGGCAAGAGCCTGGGCAGCGCCCTGAAGCCAGGGGAAGGTAGGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGCCCTGTTCGCGGGCAATGAGTGGCGGCGACCCATCATCCAGTTTGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGCCCTGTTCGCGGGCAATGAGTGGCGGCGACCCATCATCCAGTTTGTCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGTCCGGGGACGACAAGAACTCCAACTACTTCAGCATGGACTCTATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGTCCGGGGACGACAAGAACTCCAACTACTTCAGCATGGACTCTATGGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCAAGAGGTCGCCGTACGCAGGGCTCCAGCTGGGGGCTGCCAAGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCAAGAGGTCGCCGTACGCAGGGCTCCAGCTGGGGGCTGCCAAGAAGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACCCGTTACCTTTGCCGAAAAGGGCGAGCTGCGCAAGTCCATTTTCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACCCGTTACCTTTGCCGAAAAGGGCGAGCTGCGCAAGTCCATTTTCTCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGTCCCGGAAGCCCACGGTGTCCATCATGGAGCCCGGGGAGACCCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGTCCCGGAAGCCCACGGTGTCCATCATGGAGCCCGGGGAGACCCGGCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AACAGCTACCCCCGGGCCGACACGGGCCTTTTTTCACGGTCCAAGTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AACAGCTACCCCCGGGCCGACACGGGCCTTTTTTCACGGTCCAAGTCCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTCCGAGGAGGTGCTGTGCGACTCCTGCATCGGCAACAAGCAGAAGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTCCGAGGAGGTGCTGTGCGACTCCTGCATCGGCAACAAGCAGAAGGCGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCAAGTCCTGCCTGGTGTGCCAGGCCTCCTTCTGCGAGCTGCATCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCAAGTCCTGCCTGGTGTGCCAGGCCTCCTTCTGCGAGCTGCATCTCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCCCACCTGGAGGGCGCCGCCTTCCGAGACCACCAGCTGCTCGAGCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCCCACCTGGAGGGCGCCGCCTTCCGAGACCACCAGCTGCTCGAGCCCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCGGGACTTTGAGGCCCGCAAGTGTCCCGTGCATGGCAAGACGATGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCGGGACTTTGAGGCCCGCAAGTGTCCCGTGCATGGCAAGACGATGGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCTTCTGCCAGACCGACCAGACCTGCATCTGCTACCTTTGCATGTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCTTCTGCCAGACCGACCAGACCTGCATCTGCTACCTTTGCATGTTCCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GAGCACAAGAATCATAGCACCGTGACAGTGGAGGAGGCCAAGGCCGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GAGCACAAGAATCATAGCACCGTGACAGTGGAGGAGGCCAAGGCCGAGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGAG         ACGGAGCTGTCACTGCAAAAGGAGCAGCTGCAGCTCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 100801 GGAGGTA...CAGACGGAGCTGTCATTGCAAAAGGAGCAGCTGCAGCTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AGATCATTGAGATTGAGGATGAAGCTGAGAAGTGGCAGAAGGAGAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109574 AGATCATTGAGATTGAGGATGAAGCTGAGAAGTGGCAGAAGGAGAAGGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CGCATCAAG         AGCTTCACCACCAATGAGAAGGCCATCCTGGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 109624 CGCATCAAGGTG...CAGAGCTTCACCACCAATGAGAAGGCCATCCTGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GCAGAACTTCCGGGACCTGGTGCGGGACCTGGAGAAGCAAAAGGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110495 GCAGAACTTCCGGGACCTGGTGCGGGACCTGGAGAAGCAAAAGGAGGAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TGAGGGCTGCGCTGGAGCAGCGGGAGCAGGATGCTGTGGACCAAGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110545 TGAGGGCTGCGCTGGAGCAGCGGGAGCAGGATGCTGTGGACCAAGTGAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GTGATCATGGATGCTCTGGATGAGAGAGCCAAGGTGCTGCATGAGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110595 GTGATCATGGATGCTCTGGATGAGAGAGCCAAGGTGCTGCATGAGGACAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 GCAGACCCGGGAGCAGCTGCATAGCATCAGCGACTCTGTGTTGTTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110645 GCAGACCCGGGAGCAGCTGCATAGCATCAGCGACTCTGTGTTGTTTCTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 AG         GAATTTGGTGCATTGATGAGCAATTACTCTCTCCCCCCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110695 AGGTA...TAGGAATTTGGTGCATTGATGAGCAATTACTCTCTCCCCCCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 CCCCTGCCCACCTATCATGTCCTGCTGGAGGGGGAGGGCCTGGGACAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112182 CCCCTGCCCACCTATCATGTCCTGCTGGAGGGGGAGGGCCTGGGACAGTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 ACTAGGCAACTTCAAGGACGACCTGCTCAATGTATGCATGCGCCACGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112232 ACTAGGCAACTTCAAGGACGACCTGCTCAATGTATGCATGCGCCACGTTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 AGAAGATGTGCAAGGCGGACCTGAGCCGTAACTTCATTGAGAGGAACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112282 AGAAGATGTGCAAGGCGGACCTGAGCCGTAACTTCATTGAGAGGAACCAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 ATGGAGAACG         GTGGTGACCATCGCTATGTGAACAACTACAC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 112332 ATGGAGAACGGTA...TAGGTGGTGACCATCGCTATGTGAACAACTACAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 GAACAGCTTCGGGGGTGAGTGGAGTGCACCGGACACCATGAAGAGATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115008 GAACAGCTTCGGGGGTGAGTGGAGTGCACCGGACACCATGAAGAGATACT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 CCATGTACCTGACACCCAAAG         GTGGGGTCCGGACATCATAC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 115058 CCATGTACCTGACACCCAAAGGTA...CAGGTGGGGTCCGGACATCATAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 CAGCCCTCGTCTCCTGGCCGCTTCACCAAGGAGACCACCCAGAAGAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117387 CAGCCCTCGTCTCCTGGCCGCTTCACCAAGGAGACCACCCAGAAGAATTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 CAACAATCTCTATGGCACCAAAG         GTAACTACACCTCCCGGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 117437 CAACAATCTCTATGGCACCAAAGGTA...CAGGTAACTACACCTCCCGGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 TCTGGGAGTACTCCTCCAGCATTCAGAACTCTGACAATGACCTGCCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119729 TCTGGGAGTACTCCTCCAGCATTCAGAACTCTGACAATGACCTGCCCGTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 GTCCAAGGCAGCTCCTCCTTCTCCCTGAAAG         GCTATCCCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 119779 GTCCAAGGCAGCTCCTCCTTCTCCCTGAAAGGTG...CAGGCTATCCCTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 CCTCATGCGGAGCCAAAGCCCCAAGGCCCAGCCCCAGACTTGGAAATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122628 CCTCATGCGGAGCCAAAGCCCCAAGGCCCAGCCCCAGACTTGGAAATCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 GCAAGCAGACTATGCTG         TCTCACTACCGGCCATTCTACGTC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 122678 GCAAGCAGACTATGCTGGTA...CAGTCTCACTACCGGCCATTCTACGTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .
   1729 AACAAAGGCAACGGGATTGGGTCCAACGAAGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125580 AACAAAGGCAACGGGATTGGGTCCAACGAAGCCCCA