seq1 = pF1KB7892.tfa, 1959 bp
seq2 = pF1KB7892/gi568815597r_77847517.tfa (gi568815597r:77847517_78079004), 231488 bp

>pF1KB7892 1959
>gi568815597r:77847517_78079004 (Chr1)

(complement)

1-120  (100001-100120)   100% ->
121-211  (108990-109080)   100% ->
212-250  (110802-110840)   100% ->
251-290  (111339-111378)   100% ->
291-340  (111907-111956)   100% ->
341-412  (112050-112121)   100% ->
413-470  (112254-112311)   100% ->
471-633  (113774-113936)   100% ->
634-732  (114037-114135)   98% ->
733-834  (114258-114359)   100% ->
835-937  (114649-114751)   100% ->
938-1038  (114843-114943)   100% ->
1039-1180  (115290-115431)   100% ->
1181-1341  (116075-116235)   100% ->
1342-1493  (118510-118661)   100% ->
1494-1573  (118742-118821)   100% ->
1574-1702  (122305-122433)   100% ->
1703-1777  (123676-123750)   100% ->
1778-1923  (129705-129850)   100% ->
1924-1959  (131453-131488)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGACTATTCAACAGTGCCTCCCCCCTCTTCTGGCTCAGCTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGACTATTCAACAGTGCCTCCCCCCTCTTCTGGCTCAGCTGGTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGTGGTGGCGGCGGTGGTGGTGGAGGAGTTAACGACGCTTTCAAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGTGGTGGCGGCGGTGGTGGTGGAGGAGTTAACGACGCTTTCAAAGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CACTGCAGAGAGCCCGGCAG         ATTGCAGCAAAAATTGGAGGT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100101 CACTGCAGAGAGCCCGGCAGGTA...TAGATTGCAGCAAAAATTGGAGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GATGCAGGGACATCACTGAATTCAAATGACTATGGTTATGGGGGACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109011 GATGCAGGGACATCACTGAATTCAAATGACTATGGTTATGGGGGACAAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAGACCTTTAGAAGATGGAG         ATCAACCAGATGCTAAGAAAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 109061 AAGACCTTTAGAAGATGGAGGTA...CAGATCAACCAGATGCTAAGAAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGCTCCTCAAAATGACT         CTTTTGGAACACAGTTACCACCG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 110823 TTGCTCCTCAAAATGACTGTA...TAGCTTTTGGAACACAGTTACCACCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ATGCATCAGCAGCAAAG         ATCTGTAATGACAGAAGAATACAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 111362 ATGCATCAGCAGCAAAGGTA...CAGATCTGTAATGACAGAAGAATACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 AGTTCCAGATGGAATGGTTGGATTCA         TAATTGGCAGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 111931 AGTTCCAGATGGAATGGTTGGATTCAGTA...TAGTAATTGGCAGAGGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 GTGAACAGATCTCACGCATACAACAGGAATCTGGATGCAAAATACAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112065 GTGAACAGATCTCACGCATACAACAGGAATCTGGATGCAAAATACAGATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GCTCCTG         ACAGTGGTGGCCTTCCAGAAAGGTCCTGTATGTT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112115 GCTCCTGGTA...TAGACAGTGGTGGCCTTCCAGAAAGGTCCTGTATGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 AACTGGAACACCTGAATCTGTCCA         GTCAGCAAAACGGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 112288 AACTGGAACACCTGAATCTGTCCAGTA...CAGGTCAGCAAAACGGTTAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    488 TGGACCAGATTGTTGAAAAAGGAAGACCAGCTCCTGGCTTCCATCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113791 TGGACCAGATTGTTGAAAAAGGAAGACCAGCTCCTGGCTTCCATCATGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 GATGGACCGGGAAATGCAGTTCAAGAAATCATGATTCCAGCTAGCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113841 GATGGACCGGGAAATGCAGTTCAAGAAATCATGATTCCAGCTAGCAAGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 AGGATTAGTCATTGGAAAAGGGGGAGAAACTATTAAACAGCTTCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 113891 AGGATTAGTCATTGGAAAAGGGGGAGAAACTATTAAACAGCTTCAGGTA.

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    634      GAAAGGGCTGGAGTTAAAATGGTTATGATTCAAGACGGGCCGCAG
        ..>>>||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113941 ..CAGGAACGGGCTGGAGTTAAAATGGTTATGATTCAAGACGGGCCGCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 AACACTGGTGCTGACAAACCTCTTAGGATTACAGGAGACCCATATAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114082 AACACTGGTGCTGACAAACCTCTTAGGATTACAGGAGACCCATATAAAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 TCAA         CAAGCCAAGGAAATGGTGTTAGAGTTAATTCGTGATC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114132 TCAAGTA...TAGCAAGCCAAGGAAATGGTGTTAGAGTTAATTCGTGATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 AAGGCGGTTTCAGAGAAGTTCGGAATGAGTATGGGTCAAGAATAGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114295 AAGGCGGTTTCAGAGAAGTTCGGAATGAGTATGGGTCAAGAATAGGAGGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 AATGAAGGGATAGAT         GTCCCCATTCCAAGATTTGCTGTTGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 114345 AATGAAGGGATAGATGTA...AAGGTCCCCATTCCAAGATTTGCTGTTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 CATTGTAATAGGAAGAAATGGAGAGATGATCAAAAAAATACAAAATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114675 CATTGTAATAGGAAGAAATGGAGAGATGATCAAAAAAATACAAAATGATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 CTGGTGTTCGCATTCAGTTTAAGCCAG         ATGATGGGACAACA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 114725 CTGGTGTTCGCATTCAGTTTAAGCCAGGTG...AAGATGATGGGACAACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    952 CCCGAAAGGATAGCACAAATAACAGGACCTCCAGACCGATGTCAACATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114857 CCCGAAAGGATAGCACAAATAACAGGACCTCCAGACCGATGTCAACATGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 TGCAGAAATTATTACAGACCTTCTTCGAAGTGTTCAG         GCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 114907 TGCAGAAATTATTACAGACCTTCTTCGAAGTGTTCAGGTT...TAGGCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1043 GTAATCCTGGTGGACCTGGACCTGGTGGTCGAGGAAGAGGTAGAGGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115294 GTAATCCTGGTGGACCTGGACCTGGTGGTCGAGGAAGAGGTAGAGGTCAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 GGCAACTGGAACATGGGACCACCTGGTGGACTACAGGAATTTAATTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115344 GGCAACTGGAACATGGGACCACCTGGTGGACTACAGGAATTTAATTTTAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 TGTGCCAACTGGGAAAACTGGATTAATAATAGGAAAAG         GAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 115394 TGTGCCAACTGGGAAAACTGGATTAATAATAGGAAAAGGCA...TAGGAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1184 GTGAAACCATAAAAAGCATAAGCCAGCAGTCTGGTGCAAGAATAGAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116078 GTGAAACCATAAAAAGCATAAGCCAGCAGTCTGGTGCAAGAATAGAACTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 CAGAGAAATCCTCCACCAAATGCAGATCCTAATATGAAGTTATTTACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116128 CAGAGAAATCCTCCACCAAATGCAGATCCTAATATGAAGTTATTTACAAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 TCGTGGCACTCCACAACAGATAGACTATGCTCGGCAACTCATAGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116178 TCGTGGCACTCCACAACAGATAGACTATGCTCGGCAACTCATAGAAGAAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 AGATTGGT         GGCCCAGTAAATCCTTTAGGGCCACCTGTACCC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 116228 AGATTGGTGTG...TAGGGCCCAGTAAATCCTTTAGGGCCACCTGTACCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375 CATGGGCCCCATGGTGTCCCAGGCCCCCATGGACCTCCTGGGCCTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118543 CATGGGCCCCATGGTGTCCCAGGCCCCCATGGACCTCCTGGGCCTCCAGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1425 GCCTGGAACTCCAATGGGACCATACAACCCTGCACCTTATAATCCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118593 GCCTGGAACTCCAATGGGACCATACAACCCTGCACCTTATAATCCTGGAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 CACCAGGCCCGGCTCCTCA         TGGTCCTCCAGCCCCATATGCT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 118643 CACCAGGCCCGGCTCCTCAGTA...CAGTGGTCCTCCAGCCCCATATGCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 CCCCAGGGATGGGGAAATGCATATCCACACTGGCAGCAGCAGGCTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118764 CCCCAGGGATGGGGAAATGCATATCCACACTGGCAGCAGCAGGCTCCTCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1566 TGATCCAG         CTAAGGCAGGAACGGATCCAAATTCAGCAGCTT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 118814 TGATCCAGGTA...TAGCTAAGGCAGGAACGGATCCAAATTCAGCAGCTT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1607 GGGCTGCTTATTACGCTCACTATTATCAACAGCAAGCACAGCCACCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122338 GGGCTGCTTATTACGCTCACTATTATCAACAGCAAGCACAGCCACCACCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1657 GCAGCCCCTGCAGGTGCACCAACTACAACTCAAACTAATGGACAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 122388 GCAGCCCCTGCAGGTGCACCAACTACAACTCAAACTAATGGACAAGGTA.

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1703      GAGATCAGCAGAATCCAGCCCCAGCTGGACAGGTTGATTATACCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122438 ..AAGGAGATCAGCAGAATCCAGCCCCAGCTGGACAGGTTGATTATACCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1748 AGGCTTGGGAAGAGTACTACAAGAAAATGG         GTCAGGCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 123721 AGGCTTGGGAAGAGTACTACAAGAAAATGGGTA...AAGGTCAGGCAGTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1789 CCTGCTCCGACTGGGGCTCCTCCAGGTGGTCAGCCAGATTATAGTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129716 CCTGCTCCGACTGGGGCTCCTCCAGGTGGTCAGCCAGATTATAGTGCAGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1839 CTGGGCTGAGTATTATAGACAACAAGCAGCCTATTATGCCCAGACAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129766 CTGGGCTGAGTATTATAGACAACAAGCAGCCTATTATGCCCAGACAAGTC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1889 CCCAGGGAATGCCACAGCATCCTCCAGCACCTCAG         TGCAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 129816 CCCAGGGAATGCCACAGCATCCTCCAGCACCTCAGGTA...AAGTGCAGG

   2100     .    :    .    :    .    :
   1930 TTTGATCCAGCCAGTATAGAACTAGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 131459 TTTGATCCAGCCAGTATAGAACTAGCTCTG