seq1 = pF1KB7885.tfa, 1743 bp
seq2 = pF1KB7885/gi568815583f_64287864.tfa (gi568815583f:64287864_64555061), 267198 bp

>pF1KB7885 1743
>gi568815583f:64287864_64555061 (Chr15)

1-101  (100001-100101)   100% ->
102-271  (106083-106252)   100% ->
272-405  (107535-107668)   100% ->
406-618  (109743-109955)   100% ->
619-697  (112880-112958)   100% ->
698-827  (118467-118596)   100% ->
828-1043  (121750-121965)   100% ->
1044-1170  (126222-126348)   100% ->
1171-1358  (130678-130865)   100% ->
1359-1483  (136168-136292)   100% ->
1484-1575  (137677-137768)   100% ->
1576-1678  (157143-157245)   99% ->
1679-1743  (167134-167198)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGTGGCTGGGGCGGTGTCCGGGGAGCCGCTGGTGCACTGGTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGTGGCTGGGGCGGTGTCCGGGGAGCCGCTGGTGCACTGGTGCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGCAGTTGCGGAAGACTTTCGGCCTGGATGTCAGCGAGGAGATCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCAGCAGTTGCGGAAGACTTTCGGCCTGGATGTCAGCGAGGAGATCATTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 A         GTACGTTTTGTCAATTGAGAGTGCTGAAGAGATACGAGAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTG...GAGGTACGTTTTGTCAATTGAGAGTGCTGAAGAGATACGAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TATGTTACTGATCTCCTCCAGGGAAATGAAGGCAAAAAAGGTCAATTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106123 TATGTTACTGATCTCCTCCAGGGAAATGAAGGCAAAAAAGGTCAATTCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGAAGAACTTATAACCAAATGGCAAAAGAATGATCAGGAGTTGATTTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106173 AGAAGAACTTATAACCAAATGGCAAAAGAATGATCAGGAGTTGATTTCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATCCTTTGCAGCAGTGCTTCAAAAAAGATG         AAATTTTAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 106223 ATCCTTTGCAGCAGTGCTTCAAAAAAGATGGTA...AAGAAATTTTAGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGGCAGAAATCAGGCGACCATCTAAAGCGGGGTAGGAAGAAAGGGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107546 GGGCAGAAATCAGGCGACCATCTAAAGCGGGGTAGGAAGAAAGGGAGAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAGACAGGAAGTTCCTGCATTTACTGAACCTGACACGACTGCAGAGGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107596 CAGACAGGAAGTTCCTGCATTTACTGAACCTGACACGACTGCAGAGGTTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAACACCTTTTGATTTGGCCAAG         GCACAAGAGAACAGCAAC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 107646 AAACACCTTTTGATTTGGCCAAGGTG...TAGGCACAAGAGAACAGCAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCCGTAAAGAAGAAGACAAAGTTTGTCAATTTATACACAAGAGAGGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109761 TCCGTAAAGAAGAAGACAAAGTTTGTCAATTTATACACAAGAGAGGGACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGACAGGCTTGCAGTCCTGCTCCCTGGTCGTCACCCTTGTGATTGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109811 GGACAGGCTTGCAGTCCTGCTCCCTGGTCGTCACCCTTGTGATTGCCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCCAGAAGCACAAGCTCATCAATAACTGTCTGATCTGTGGGCGCATTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109861 GCCAGAAGCACAAGCTCATCAATAACTGTCTGATCTGTGGGCGCATTGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TGTGAACAAGAAGGCTCAGGCCCTTGCTTATTCTGTGGCACTCTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 109911 TGTGAACAAGAAGGCTCAGGCCCTTGCTTATTCTGTGGCACTCTGGTA..

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    619     GTGTGTACTCATGAGGAACAAGATATTTTACAGCGTGACTCAAACA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109961 .CAGGTGTGTACTCATGAGGAACAAGATATTTTACAGCGTGACTCAAACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGAGCCAGAAACTGCTAAAGAAACTCATGTCAG         GAGTGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 112926 AGAGCCAGAAACTGCTAAAGAAACTCATGTCAGGTA...CAGGAGTGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AATTCTGGAAAGGTGGACATCTCTACCAAGGACCTTCTTCCTCATCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118475 AATTCTGGAAAGGTGGACATCTCTACCAAGGACCTTCTTCCTCATCAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ATTGCGAATTAAGTCTGGTCTGGAGAAGGCTATCAAGCATAAAGACAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118525 ATTGCGAATTAAGTCTGGTCTGGAGAAGGCTATCAAGCATAAAGACAAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGTTAGAGTTTGACAGAACTAG         TATTCGAAGGACCCAAGTC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 118575 TGTTAGAGTTTGACAGAACTAGGTA...CAGTATTCGAAGGACCCAAGTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ATTGATGATGAGTCAGATTACTTTGCCAGTGATTCTAACCAATGGTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121769 ATTGATGATGAGTCAGATTACTTTGCCAGTGATTCTAACCAATGGTTGTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CAAACTTGAGCGGGAAACCTTGCAGAAGCGAGAGGAGGAGCTGAGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121819 CAAACTTGAGCGGGAAACCTTGCAGAAGCGAGAGGAGGAGCTGAGAGAAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TTCGACACGCCTCTCGACTTTCTAAGAAGGTCACCATTGACTTTGCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121869 TTCGACACGCCTCTCGACTTTCTAAGAAGGTCACCATTGACTTTGCAGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AGGAAGATCCTGGAAGAAGAAAATTCACTAGCAGAGTATCATAGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 121919 AGGAAGATCCTGGAAGAAGAAAATTCACTAGCAGAGTATCATAGCAGGTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1044       ACTAGATGAGACAATACAGGCCATTGCCAATGGAACCTTGAACC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121969 ...CAGACTAGATGAGACAATACAGGCCATTGCCAATGGAACCTTGAACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AGCCACTGACCAAATTGGATAGATCTTCTGAAGAGCCTTTGGGAGTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126266 AGCCACTGACCAAATTGGATAGATCTTCTGAAGAGCCTTTGGGAGTTCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GTAAATCCCAACATGTACCAGTCCCCTCCCCAG         TGGGTTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 126316 GTAAATCCCAACATGTACCAGTCCCCTCCCCAGGTT...TAGTGGGTTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CCACACAGGTGCAGCCTCACAGAAGAAGGCTTTCCGTTCTTCAGGATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130686 CCACACAGGTGCAGCCTCACAGAAGAAGGCTTTCCGTTCTTCAGGATTTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GACTAGAGTTCAACTCATTTCAGCACCAGTTGCGAATCCAGGATCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130736 GACTAGAGTTCAACTCATTTCAGCACCAGTTGCGAATCCAGGATCAAGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 TTTCAGGAAGGCTTTGATGGTGGCTGGTGCCTCTCTGTACATCAGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130786 TTTCAGGAAGGCTTTGATGGTGGCTGGTGCCTCTCTGTACATCAGCCCTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GGCTTCTCTGCTTGTCAGAGGGATTAAAAG         GGTGGAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 130836 GGCTTCTCTGCTTGTCAGAGGGATTAAAAGGTA...AAGGGTGGAGGGCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 GATCCTGGTACACCCCCCACAGAGGACGACTTTGGATAGCAGCCACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136179 GATCCTGGTACACCCCCCACAGAGGACGACTTTGGATAGCAGCCACAGCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 AAAAAACCCTCCCCTCAAGAAGTCTCAGAACTCCAGGCTACATATCGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136229 AAAAAACCCTCCCCTCAAGAAGTCTCAGAACTCCAGGCTACATATCGTCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TCTTCGTGGGAAAG         ATGTGGAATTTCCTAATGACTATCCGT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 136279 TCTTCGTGGGAAAGGTA...CAGATGTGGAATTTCCTAATGACTATCCGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CAGGTTGTCTTCTGGGCTGTGTGGACCTAATTGACTGCTTGTCCCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137704 CAGGTTGTCTTCTGGGCTGTGTGGACCTAATTGACTGCTTGTCCCAGAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 CAATTTAAGGAGCAG         TTTCCAGACATCAGTCAAGAATCTGA
        |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||| |||||
 137754 CAATTTAAGGAGCAGGTG...CAGTTTCCAGACATCAGTCAAGAGTCTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 TTCTCCATTTGTTTTCATCTGCAAAAATCCTCAGGAAATGGTTGTGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157169 TTCTCCATTTGTTTTCATCTGCAAAAATCCTCAGGAAATGGTTGTGAAGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 TTCCTATTAAAGGAAATCCAAAAATCT         GGAAATTGGATTCC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 157219 TTCCTATTAAAGGAAATCCAAAAATCTGTA...CAGGGAAATTGGATTCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 AAGATCCATCAAGGAGCAAAGAAGGGGTTAATGAAGCAGAATAAAGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167148 AAGATCCATCAAGGAGCAAAGAAGGGGTTAATGAAGCAGAATAAAGCTGT

   1850 
   1743 C
        |
 167198 C