seq1 = pF1KB7880.tfa, 1920 bp
seq2 = pF1KB7880/gi568815579f_57431067.tfa (gi568815579f:57431067_57638924), 207858 bp

>pF1KB7880 1920
>gi568815579f:57431067_57638924 (Chr19)

1-33  (96508-96540)   96% ->
34-72  (100004-100042)   100% ->
73-199  (104078-104204)   100% ->
200-1920  (106138-107858)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGAGGCAGCGCTAGTGAATACGCCGCAG         ATTCCCAT
        |||||||||||||||||||||| ||||||||||>>>...>>>||||||||
  96508 ATGGCCGAGGCAGCGCTAGTGATTACGCCGCAGGTG...CAGATTCCCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GGTAACAGAAGAGTTTGTGAAACCATCACAG         GGCCATGTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100012 GGTAACAGAAGAGTTTGTGAAACCATCACAGGTA...CAGGGCCATGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 CCTTTGAGGATATTGCTGTGTACTTCTCCCAGGAGGAGTGGGGCCTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104088 CCTTTGAGGATATTGCTGTGTACTTCTCCCAGGAGGAGTGGGGCCTCCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GATGAAGCTCAAAGGTGCCTGTATCATGATGTGATGCTGGAGAACTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104138 GATGAAGCTCAAAGGTGCCTGTATCATGATGTGATGCTGGAGAACTTTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCTTATGGCCTCAGTAG         GTTGTTTGCATGGAATAGAGGCTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 104188 GCTTATGGCCTCAGTAGGTA...TAGGTTGTTTGCATGGAATAGAGGCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AGGAGGCCCCTTCTGAGCAGACTCTTTCTGCGCAAGGAGTGTCACAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106162 AGGAGGCCCCTTCTGAGCAGACTCTTTCTGCGCAAGGAGTGTCACAGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AGGACTCCAAAGCTAGGTCCTTCCATCCCAAATGCTCATTCTTGTGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106212 AGGACTCCAAAGCTAGGTCCTTCCATCCCAAATGCTCATTCTTGTGAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GTGTATCCTGGTCATGAAAGACATTTTGTACCTCAGTGAGCATCAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106262 GTGTATCCTGGTCATGAAAGACATTTTGTACCTCAGTGAGCATCAGGGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CACTTCCCTGGCAGAAACCTTATACGTCTGTGGCCAGTGGGAAATGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106312 CACTTCCCTGGCAGAAACCTTATACGTCTGTGGCCAGTGGGAAATGGTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCATTTGGTTCTAACCTGCAACAGCACCAGAACCAGGACAGTGGAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106362 TCATTTGGTTCTAACCTGCAACAGCACCAGAACCAGGACAGTGGAGAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ACACATCAGAAAGGAGGAGAGCAGTGCCTTGCTTCTGAATAGCTGCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106412 ACACATCAGAAAGGAGGAGAGCAGTGCCTTGCTTCTGAATAGCTGCAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTCCTCTGTCAGACAATCTTTTCCCATGCAAAGATGTTGAGAAGGATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106462 TTCCTCTGTCAGACAATCTTTTCCCATGCAAAGATGTTGAGAAGGATTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CCAACCATCCTGGGCCTTCTCCAACACCAGACCACCCACAGCAGACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106512 CCAACCATCCTGGGCCTTCTCCAACACCAGACCACCCACAGCAGACAAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GTATGCACATAGAAGCAGGGAGACCTTTCAACAAAGACGTTACAAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106562 GTATGCACATAGAAGCAGGGAGACCTTTCAACAAAGACGTTACAAATGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGCAAGTTTTCAATGAGAAAGTTCATGTTACTGAGCATCAGAGAGTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106612 AGCAAGTTTTCAATGAGAAAGTTCATGTTACTGAGCATCAGAGAGTCCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 ACTGGAGAAAAAGCTTATAAGCGTAGGGAATATGGGAAATCCTTGAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106662 ACTGGAGAAAAAGCTTATAAGCGTAGGGAATATGGGAAATCCTTGAACTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TAAATACTTATTTGTTGAACACCAGAGAACCCATAATGCAGAAAAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106712 TAAATACTTATTTGTTGAACACCAGAGAACCCATAATGCAGAAAAGCCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 ATGTGTGCAATATATGTGGGAAATCATTCCTCCATAAACAAACACTCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106762 ATGTGTGCAATATATGTGGGAAATCATTCCTCCATAAACAAACACTCGTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GGGCACCAGCAGAGAATTCACACTAGAGAAAGGTCTTATGTGTGCATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106812 GGGCACCAGCAGAGAATTCACACTAGAGAAAGGTCTTATGTGTGCATCGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 ATGTGGGAAATCCTTGAGCTCCAAATACTCACTTGTGGAACACCAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106862 ATGTGGGAAATCCTTGAGCTCCAAATACTCACTTGTGGAACACCAGAGAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CCCATAATGGAGAAAAGCCTTATGTGTGCAATGTATGTGGGAAATCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106912 CCCATAATGGAGAAAAGCCTTATGTGTGCAATGTATGTGGGAAATCATTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 CGCCACAAACAAACATTTGTTGGCCATCAGCAGAGAATCCACACTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106962 CGCCACAAACAAACATTTGTTGGCCATCAGCAGAGAATCCACACTGGAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GAGGCCTTATGTGTGTATGGAATGTGGGAAATCTTTTATTCATTCCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107012 GAGGCCTTATGTGTGTATGGAATGTGGGAAATCTTTTATTCATTCCTATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 ACCGCATTCGACACCAGAGAGTTCACACTGGAGAAGGGGCTTATCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107062 ACCGCATTCGACACCAGAGAGTTCACACTGGAGAAGGGGCTTATCAGTGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 AGTGAATGTGGGAAATCCTTCATATACAAACAGTCACTTCTTGATCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107112 AGTGAATGTGGGAAATCCTTCATATACAAACAGTCACTTCTTGATCACCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 TAGAATCCACACGGGAGAAAGGCCTTATGAGTGCAAAGAATGTGGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107162 TAGAATCCACACGGGAGAAAGGCCTTATGAGTGCAAAGAATGTGGGAAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 CCTTCATTCACAAAAAAAGACTTCTTGAGCACCAGAGAATTCATACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107212 CCTTCATTCACAAAAAAAGACTTCTTGAGCACCAGAGAATTCATACTGGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 GAAAAGCCTTATGTGTGCATCATATGTGGGAAATCATTTATCCGCTCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107262 GAAAAGCCTTATGTGTGCATCATATGTGGGAAATCATTTATCCGCTCGTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 TGACTACATGCGACACCAGAGAATTCACACTGGAGAAAGGGCTTATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107312 TGACTACATGCGACACCAGAGAATTCACACTGGAGAAAGGGCTTATGAAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 GCAGTGACTGTGGGAAAGCCTTCATCTCCAAACAAACACTTCTTAAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107362 GCAGTGACTGTGGGAAAGCCTTCATCTCCAAACAAACACTTCTTAAGCAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 CACAAAATCCACACTAGAGAAAGGCCTTATGAATGCAGTGAATGTGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107412 CACAAAATCCACACTAGAGAAAGGCCTTATGAATGCAGTGAATGTGGAAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 AGGCTTCTACCTTGAGGTTAAACTTCTTCAGCACCAAAGAATCCATACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107462 AGGCTTCTACCTTGAGGTTAAACTTCTTCAGCACCAAAGAATCCATACTA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 GAGAACAACTTTGTGAGTGCAATGAATGTGGAAAAGTCTTCAGCCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107512 GAGAACAACTTTGTGAGTGCAATGAATGTGGAAAAGTCTTCAGCCACCAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 AAAAGACTTCTTGAGCACCAGAAAGTTCACACTGGCGAAAAGCCCTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107562 AAAAGACTTCTTGAGCACCAGAAAGTTCACACTGGCGAAAAGCCCTGTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 GTGCAGTGAATGTGGGAAATGCTTTAGACACCGCACCAGCCTCATTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107612 GTGCAGTGAATGTGGGAAATGCTTTAGACACCGCACCAGCCTCATTCAAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 ACCAGAAAGTTCACAGTGGAGAGAGGCCTTATAACTGCACTGCATGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107662 ACCAGAAAGTTCACAGTGGAGAGAGGCCTTATAACTGCACTGCATGTGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 AAGGCCTTTATCTATAAAAACAAACTTGTTGAGCATCAGCGAATCCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107712 AAGGCCTTTATCTATAAAAACAAACTTGTTGAGCATCAGCGAATCCACAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 CGGAGAAAAGCCGTATGAATGTGGTAAATGTGGGAAAGCCTTCAACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107762 CGGAGAAAAGCCGTATGAATGTGGTAAATGTGGGAAAGCCTTCAACAAAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1874 GATATTCCCTTGTCAGGCACCAGAAGGTACATATAACAGAAGAGCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107812 GATATTCCCTTGTCAGGCACCAGAAGGTACATATAACAGAAGAGCCC