seq1 = pF1KB7879.tfa, 1725 bp
seq2 = pF1KB7879/gi568815579f_57756102.tfa (gi568815579f:57756102_57960137), 204036 bp

>pF1KB7879 1725
>gi568815579f:57756102_57960137 (Chr19)

1-33  (93938-93970)   100% ->
34-163  (100003-100132)   100% ->
164-1725  (102475-104036)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCGGCTGTGCCGAGGCGCCCAACTCAG         CAGGGCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
  93938 ATGGCAGCGGCTGTGCCGAGGCGCCCAACTCAGGTA...TAGCAGGGCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGTGACCTTTGAAGATGTGGCTGTGAACTTTTCCCAGGAGGAGTGGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100011 TGTGACCTTTGAAGATGTGGCTGTGAACTTTTCCCAGGAGGAGTGGTGTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTCTTAGTGAGGCTCAGAGGTGCTTGTACCGTGATGTGATGCTAGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100061 TTCTTAGTGAGGCTCAGAGGTGCTTGTACCGTGATGTGATGCTAGAGAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGCTCTCATATCCTCGCTGG         GTTGTTGGTGTGGATCAAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100111 CTGGCTCTCATATCCTCGCTGGGTA...CAGGTTGTTGGTGTGGATCAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGATGAGGAGGCACCTTGTAAGCAGAGAATTTCTGTACAAAGAGAGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102494 AGATGAGGAGGCACCTTGTAAGCAGAGAATTTCTGTACAAAGAGAGTCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGAGCAGGACTCCTAGGGCAGGTGTTTCTCCTAAGAAGGCTCACCCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102544 AGAGCAGGACTCCTAGGGCAGGTGTTTCTCCTAAGAAGGCTCACCCCTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAAATGTGTGGCCTCATCTTGGAGGATGTTTTTCACTTTGCTGACCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102594 GAAATGTGTGGCCTCATCTTGGAGGATGTTTTTCACTTTGCTGACCACCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGAAACTCATCACAAGCAGAAGCTGAACAGGAGTGGAGCATGTGGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102644 GGAAACTCATCACAAGCAGAAGCTGAACAGGAGTGGAGCATGTGGAAAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACTTGGATGACACTGCATACCTTCATCAGCACCAGAAGCAGCATATTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102694 ACTTGGATGACACTGCATACCTTCATCAGCACCAGAAGCAGCATATTGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAGAAATTCTACAGAAAGAGTGTCAGAGAAGCATCGTTTGTAAAGAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102744 GAGAAATTCTACAGAAAGAGTGTCAGAGAAGCATCGTTTGTAAAGAAACG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TAAGCTCAGGGTGTCACAGGAGCCATTTGTCTTCCGCGAGTTTGGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102794 TAAGCTCAGGGTGTCACAGGAGCCATTTGTCTTCCGCGAGTTTGGGAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACGTTCTGCCCAGTTCAGGATTGTGCCAAGAAGAAGCTGCTGTAGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102844 ACGTTCTGCCCAGTTCAGGATTGTGCCAAGAAGAAGCTGCTGTAGAGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ACAGACAGTGAAACTATGCATGGCCCACCCTTTCAGGAGGGAAAAACTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102894 ACAGACAGTGAAACTATGCATGGCCCACCCTTTCAGGAGGGAAAAACTAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TTACAGTTGTGGAAAACGCACAAAAGCCTTCAGCACCAAACACTCAGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102944 TTACAGTTGTGGAAAACGCACAAAAGCCTTCAGCACCAAACACTCAGTTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TTCCACACCAGAAACTTTTCACTAGAGATGGATGTTATGTGTGCAGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102994 TTCCACACCAGAAACTTTTCACTAGAGATGGATGTTATGTGTGCAGTGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TGTGGAAAATCCTTTAGCAGATATGTCAGCTTCAGTAATCATCAGCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103044 TGTGGAAAATCCTTTAGCAGATATGTCAGCTTCAGTAATCATCAGCGAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TCACACTGCAAAAGGACCTTATGATTGTGGAGAGTGTGGGAAATCTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103094 TCACACTGCAAAAGGACCTTATGATTGTGGAGAGTGTGGGAAATCTTATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 GTCGAAAGAGCAGCCTTATTCAACATCAGCGAGTCCACACTGGACAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103144 GTCGAAAGAGCAGCCTTATTCAACATCAGCGAGTCCACACTGGACAGACA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GCTTATCCCTGTGAGGAGTGCGGGAAATCTTTTAGTCAGAAGGGCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103194 GCTTATCCCTGTGAGGAGTGCGGGAAATCTTTTAGTCAGAAGGGCAGCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TATTAGCCATCAGCTTGTTCACACTGGAGAAGGGCCTTATGAGTGTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103244 TATTAGCCATCAGCTTGTTCACACTGGAGAAGGGCCTTATGAGTGTAGAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 AATGTGGGAAATCTTTTGGTCAAAAGGGTAACCTCATTCAACATCAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103294 AATGTGGGAAATCTTTTGGTCAAAAGGGTAACCTCATTCAACATCAGCAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GGTCACACTGGAGAGAGAGCTTATCACTGTGGGGAATGTGGGAAATCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103344 GGTCACACTGGAGAGAGAGCTTATCACTGTGGGGAATGTGGGAAATCTTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 TCGTCAGAAGTTCTGCTTTATTAACCATCAGCGTGTTCACACTGGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103394 TCGTCAGAAGTTCTGCTTTATTAACCATCAGCGTGTTCACACTGGAGAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 GGCCTTACAAGTGTGGAGAATGTGGGAAATCTTTTGGTCAAAAGGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103444 GGCCTTACAAGTGTGGAGAATGTGGGAAATCTTTTGGTCAAAAGGGCAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 CTCGTTCACCATCAGCGAGGTCATACTGGAGAAAGGCCCTATGAGTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103494 CTCGTTCACCATCAGCGAGGTCATACTGGAGAAAGGCCCTATGAGTGCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 GGAATGTGGGAAATCATTTAGGTACAGATCCCACCTCACTGAACACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103544 GGAATGTGGGAAATCATTTAGGTACAGATCCCACCTCACTGAACACCAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 GACTTCACACTGGGGAAAGACCTTACAATTGTAGGGAATGTGGGAAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103594 GACTTCACACTGGGGAAAGACCTTACAATTGTAGGGAATGTGGGAAATTA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 TTTAACAGGAAGTATCATCTTCTGGTTCATGAGAGAGTTCACACTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103644 TTTAACAGGAAGTATCATCTTCTGGTTCATGAGAGAGTTCACACTGGAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 AAGGCCATATGCGTGTGAGGTATGTGGGAAATTATTTGGCAATAAGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103694 AAGGCCATATGCGTGTGAGGTATGTGGGAAATTATTTGGCAATAAGCACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 GCGTGACTATACATCAGAGGATTCACACTGGAGAAAGGCCGTATGAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103744 GCGTGACTATACATCAGAGGATTCACACTGGAGAAAGGCCGTATGAATGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 AGTGAATGTGGGAAATCATTTCTTTCCAGCTCTGCGCTTCATGTTCATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103794 AGTGAATGTGGGAAATCATTTCTTTCCAGCTCTGCGCTTCATGTTCATAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 AAGAGTTCATTCTGGACAAAAGCCTTATAAGTGCAGTGAATGTGGAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103844 AAGAGTTCATTCTGGACAAAAGCCTTATAAGTGCAGTGAATGTGGAAAAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 CCTTTTCTGAATGTTCCAGTCTCATTAAACACAGGAGAATTCACACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103894 CCTTTTCTGAATGTTCCAGTCTCATTAAACACAGGAGAATTCACACTGGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 GAAAGGCCTTATGAATGCACCAAATGTGGAAAAACATTTCAGCGAAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103944 GAAAGGCCTTATGAATGCACCAAATGTGGAAAAACATTTCAGCGAAGCTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 TACCCTCCTTCATCATCAGAGTTCACACAGGAGAAAGGCCTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103994 TACCCTCCTTCATCATCAGAGTTCACACAGGAGAAAGGCCTTA