seq1 = pF1KB7869.tfa, 1683 bp
seq2 = pF1KB7869/gi568815591r_99393532.tfa (gi568815591r:99393532_99600093), 206562 bp

>pF1KB7869 1683
>gi568815591r:99393532_99600093 (Chr7)

(complement)

1-456  (100001-100456)   100% ->
457-583  (101252-101378)   100% ->
584-1683  (105463-106562)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATTCCAGCTTGACCGCCCAGAGGCGCGGCAGTGACGCCGAGTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATTCCAGCTTGACCGCCCAGAGGCGCGGCAGTGACGCCGAGTTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACCCTGGGTGATGGCTGCGAGGTCCAAGGACGCGGCGCCGTCCCAACGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACCCTGGGTGATGGCTGCGAGGTCCAAGGACGCGGCGCCGTCCCAACGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGGACTTTTGCCCGTGAAAGTGGAGGAAGACTCACCCGGAAGTTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGGACTTTTGCCCGTGAAAGTGGAGGAAGACTCACCCGGAAGTTGGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCAACTATCCCGCGGCTTCGCCGGACCCCGAAACTTCTCGACTGCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCAACTATCCCGCGGCTTCGCCGGACCCCGAAACTTCTCGACTGCACTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TAGGCAGCTGCGTTACCAGGAGGTGGCTGGACCGGAAGAGGCGCTGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TAGGCAGCTGCGTTACCAGGAGGTGGCTGGACCGGAAGAGGCGCTGAGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGCTCCGAGAACTCTGTCGTCGGTGGCTGAGACCCGAGCTGCTCTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGCTCCGAGAACTCTGTCGTCGGTGGCTGAGACCCGAGCTGCTCTCCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGCAGATCCTGGAGCTGCTGGTGCTGGAGCAGTTCCTCACCATCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGCAGATCCTGGAGCTGCTGGTGCTGGAGCAGTTCCTCACCATCCTGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGAGGAGCTTCAAGCCTGGGTGCGAGAGCACTGCCCAGAGAGCGGGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGAGGAGCTTCAAGCCTGGGTGCGAGAGCACTGCCCAGAGAGCGGGGAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGCGGTGGCCGTGGTGCGGGCTCTGCAGCGAGCGCTCGATGGAACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGCGGTGGCCGTGGTGCGGGCTCTGCAGCGAGCGCTCGATGGAACCTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCCCAG         GGGATGGTGACTTTCGAGGACACGGCTGTGTCTCT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCCCAGGTG...CAGGGGATGGTGACTTTCGAGGACACGGCTGTGTCTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AACCTGGGAGGAGTGGGAGCGCCTGGACCCAGCACGGAGGGACTTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101287 AACCTGGGAGGAGTGGGAGCGCCTGGACCCAGCACGGAGGGACTTCTGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GAGAGAGTGCGCAGAAGGATTCCGGGAGCACAGTTCCGCCGA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 101337 GAGAGAGTGCGCAGAAGGATTCCGGGAGCACAGTTCCGCCGAGTG...CA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    584  GTTTGGAAAGCAGAGTGGAGAACAAAGAGTTGATTCCAATGCAACAAAT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105462 GGTTTGGAAAGCAGAGTGGAGAACAAAGAGTTGATTCCAATGCAACAAAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TTTAGAAGAAGCGGAGCCACAGGGGCAACTACAAGAAGCGTTCCAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105512 TTTAGAAGAAGCGGAGCCACAGGGGCAACTACAAGAAGCGTTCCAGGGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AGCGCCCCCTGTTTTCTAAGTGTGGCAGTACCCATGAGGACAGGGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105562 AGCGCCCCCTGTTTTCTAAGTGTGGCAGTACCCATGAGGACAGGGTGGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AAGCAGTCCGGAGACCCCTTGCCCCTGAAACTTGAAAATTCTCCTGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105612 AAGCAGTCCGGAGACCCCTTGCCCCTGAAACTTGAAAATTCTCCTGAAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 AGAAGGACTCAACAGCATCTCAGATGTCAATAAGAATGGTTCCATAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105662 AGAAGGACTCAACAGCATCTCAGATGTCAATAAGAATGGTTCCATAGAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 GGGAAGACTCTAAAAATAATGAATTGCAGAACAGTGCCAGGTGTTCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105712 GGGAAGACTCTAAAAATAATGAATTGCAGAACAGTGCCAGGTGTTCCAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 CTTGTTCTATGTCAGCACATCCCGAAAGCAGAGAGGCCCACTGACAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105762 CTTGTTCTATGTCAGCACATCCCGAAAGCAGAGAGGCCCACTGACAGTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GGAACACGGGAACAAGTGCAAGCAAAGTTTCCACATGGTGACGTGGCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105812 GGAACACGGGAACAAGTGCAAGCAAAGTTTCCACATGGTGACGTGGCACG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TGCTGAAACCTCACAAGTCTGACAGTGGAGACAGTTTCCATCATTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105862 TGCTGAAACCTCACAAGTCTGACAGTGGAGACAGTTTCCATCATTCCAGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 CTTTTTGAGACCCAGAGGCAGCTCCATGAAGAAAGACCTTATAAATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105912 CTTTTTGAGACCCAGAGGCAGCTCCATGAAGAAAGACCTTATAAATGTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 TAACTGTGGGAAGAGTTTCAAACAACGCTCTGACCTCTTTAGACACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105962 TAACTGTGGGAAGAGTTTCAAACAACGCTCTGACCTCTTTAGACACCAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 GAATCCACACAGGTGAGAAACCCTATGGCTGCCAAGAATGTGGGAAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106012 GAATCCACACAGGTGAGAAACCCTATGGCTGCCAAGAATGTGGGAAAAGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 TTCAGCCAGAGTGCTGCCCTGACCAAGCACCAGAGGACACACACAGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106062 TTCAGCCAGAGTGCTGCCCTGACCAAGCACCAGAGGACACACACAGGCGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 GAAGCCGTACACCTGTCTGAAATGTGGGGAGCGCTTCAGGCAGAATTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106112 GAAGCCGTACACCTGTCTGAAATGTGGGGAGCGCTTCAGGCAGAATTCAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 ACCTAAATCGTCATCAAAGTACCCACAGTAGAGACAAACATTTTAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106162 ACCTAAATCGTCATCAAAGTACCCACAGTAGAGACAAACATTTTAAATGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 GAGGAATGCGGGGAAACCTGTCATATTTCCAACCTTTTTAGACATCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106212 GAGGAATGCGGGGAAACCTGTCATATTTCCAACCTTTTTAGACATCAGAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 ACTACATAAAGGGGAAAGACCCTATAAGTGTGAAGAATGCGAGAAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106262 ACTACATAAAGGGGAAAGACCCTATAAGTGTGAAGAATGCGAGAAGAGCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 TCAAACAGCGCTCTGACCTCTTTAAACACCACAGAATCCACACTGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106312 TCAAACAGCGCTCTGACCTCTTTAAACACCACAGAATCCACACTGGGGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 AAGCCCTATGGATGTTCCGTCTGTGGGAAACGCTTCAATCAGAGTGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106362 AAGCCCTATGGATGTTCCGTCTGTGGGAAACGCTTCAATCAGAGTGCAAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 CCTCATTAAACACCAGAGAATTCACACTGGGGAAAAGCCTTACAAATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106412 CCTCATTAAACACCAGAGAATTCACACTGGGGAAAAGCCTTACAAATGTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 TTGAATGTGGGGAAAGATTTAGACAAAGTACACACCTTATCCGACACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106462 TTGAATGTGGGGAAAGATTTAGACAAAGTACACACCTTATCCGACACCAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 AGAATTCATCAAAATAAAGTGCTGTCGGCTGGGCGTGGTGGCTCACGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106512 AGAATTCATCAAAATAAAGTGCTGTCGGCTGGGCGTGGTGGCTCACGCCT

   1700 
   1683 A
        |
 106562 A