seq1 = pF1KB7865.tfa, 1671 bp
seq2 = pF1KB7865/gi568815581r_37599076.tfa (gi568815581r:37599076_37844884), 245809 bp

>pF1KB7865 1671
>gi568815581r:37599076_37844884 (Chr17)

(complement)

1-344  (100001-100344)   100% ->
345-544  (105246-105445)   100% ->
545-809  (111064-111328)   100% ->
810-1045  (113055-113290)   100% ->
1046-1206  (134222-134382)   100% ->
1207-1339  (139836-139968)   100% ->
1340-1534  (143708-143902)   100% ->
1535-1653  (145691-145809)   100% ->
1654-1671  (157493-157510)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGTCCAAGCTCACGTCGCTCCAGCAAGAACTCCTGAGCGCCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGTCCAAGCTCACGTCGCTCCAGCAAGAACTCCTGAGCGCCCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGCTCCGGGGTCACCAAGGAGGTGCTGGTTCAGGCCTTGGAGGAGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGCTCCGGGGTCACCAAGGAGGTGCTGGTTCAGGCCTTGGAGGAGTTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCCATCCCCGAACTTCGGGGTGAAGCTGGAGACGCTGCCCCTGTCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCCATCCCCGAACTTCGGGGTGAAGCTGGAGACGCTGCCCCTGTCCCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCAGCGGGGCCGAGCCCGACACCAAGCCGGTCTTCCATACTCTCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCAGCGGGGCCGAGCCCGACACCAAGCCGGTCTTCCATACTCTCACCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGGCCACGCCAAGGGCCGCTTGTCCGGCGACGAGGGCTCCGAGGACGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGGCCACGCCAAGGGCCGCTTGTCCGGCGACGAGGGCTCCGAGGACGGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACGACTATGACACACCTCCCATCCTCAAGGAGCTGCAGGCGCTCAACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACGACTATGACACACCTCCCATCCTCAAGGAGCTGCAGGCGCTCAACACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGGAGGCGGCGGAGCAGCGGGCGGAGGTGGACCGGATGCTCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100301 GAGGAGGCGGCGGAGCAGCGGGCGGAGGTGGACCGGATGCTCAGGTA...

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    345    TGAGGACCCTTGGAGGGCTGCTAAAATGATCAAGGGTTACATGCAGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105243 TAGTGAGGACCCTTGGAGGGCTGCTAAAATGATCAAGGGTTACATGCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AACACAACATCCCCCAGAGGGAGGTGGTCGATGTCACCGGCCTGAACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105293 AACACAACATCCCCCAGAGGGAGGTGGTCGATGTCACCGGCCTGAACCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCGCACCTCTCCCAGCATCTCAACAAGGGCACCCCTATGAAGACCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105343 TCGCACCTCTCCCAGCATCTCAACAAGGGCACCCCTATGAAGACCCAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCGTGCCGCTCTGTACACCTGGTACGTCAGAAAGCAACGAGAGATCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105393 GCGTGCCGCTCTGTACACCTGGTACGTCAGAAAGCAACGAGAGATCCTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GAC         AATTCAACCAGACAGTCCAGAGTTCTGGAAATATGACA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105443 GACGTA...CAGAATTCAACCAGACAGTCCAGAGTTCTGGAAATATGACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GACAAAAGCAGTCAGGATCAGCTGCTGTTTCTCTTTCCAGAGTTCAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111102 GACAAAAGCAGTCAGGATCAGCTGCTGTTTCTCTTTCCAGAGTTCAGTCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 ACAGAGCCATGGGCCTGGGCAGTCCGATGATGCCTGCTCTGAGCCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111152 ACAGAGCCATGGGCCTGGGCAGTCCGATGATGCCTGCTCTGAGCCCACCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACAAGAAGATGCGCCGCAACCGGTTCAAATGGGGGCCCGCGTCCCAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111202 ACAAGAAGATGCGCCGCAACCGGTTCAAATGGGGGCCCGCGTCCCAGCAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 ATCTTGTACCAGGCCTACGATCGGCAAAAGAACCCCAGCAAGGAAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111252 ATCTTGTACCAGGCCTACGATCGGCAAAAGAACCCCAGCAAGGAAGAGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 AGAGGCCTTAGTGGAGGAATGCAACAG         GGCAGAATGTTTGC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 111302 AGAGGCCTTAGTGGAGGAATGCAACAGGTA...CAGGGCAGAATGTTTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 AGCGAGGGGTGTCCCCCTCCAAAGCCCACGGCCTGGGCTCCAACTTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113069 AGCGAGGGGTGTCCCCCTCCAAAGCCCACGGCCTGGGCTCCAACTTGGTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 ACTGAGGTCCGTGTCTACAACTGGTTTGCAAACCGCAGGAAGGAGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113119 ACTGAGGTCCGTGTCTACAACTGGTTTGCAAACCGCAGGAAGGAGGAGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 ATTCCGGCAAAAGCTGGCCATGGACGCCTATAGCTCCAACCAGACTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113169 ATTCCGGCAAAAGCTGGCCATGGACGCCTATAGCTCCAACCAGACTCACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 GCCTGAACCCTCTGCTCTCCCACGGCTCCCCCCACCACCAGCCCAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113219 GCCTGAACCCTCTGCTCTCCCACGGCTCCCCCCACCACCAGCCCAGCTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 TCTCCTCCAAACAAGCTGTCAG         GAGTGCGCTACAGCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 113269 TCTCCTCCAAACAAGCTGTCAGGTA...CAGGAGTGCGCTACAGCCAGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 GGGAAACAATGAGATCACTTCCTCCTCAACAATCAGTCACCATGGCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134241 GGGAAACAATGAGATCACTTCCTCCTCAACAATCAGTCACCATGGCAACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 GCGCCATGGTGACCAGCCAGTCGGTTTTACAGCAAGTCTCCCCAGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134291 GCGCCATGGTGACCAGCCAGTCGGTTTTACAGCAAGTCTCCCCAGCCAGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 CTGGACCCAGGCCACAATCTCCTCTCACCTGATGGTAAAATG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 134341 CTGGACCCAGGCCACAATCTCCTCTCACCTGATGGTAAAATGGTG...CA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1207  ATCTCAGTCTCAGGAGGAGGTTTGCCCCCAGTCAGCACCTTGACGAATA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139835 GATCTCAGTCTCAGGAGGAGGTTTGCCCCCAGTCAGCACCTTGACGAATA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 TCCACAGCCTCTCCCACCATAATCCCCAGCAATCTCAAAACCTCATCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139885 TCCACAGCCTCTCCCACCATAATCCCCAGCAATCTCAAAACCTCATCATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 ACACCCCTCTCTGGAGTCATGGCAATTGCACAAA         GCCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 139935 ACACCCCTCTCTGGAGTCATGGCAATTGCACAAAGTA...CAGGCCTCAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 CACCTCCCAAGCACAGAGTGTCCCTGTCATCAACAGTGTGGCCGGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143715 CACCTCCCAAGCACAGAGTGTCCCTGTCATCAACAGTGTGGCCGGCAGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 TGGCAGCCCTGCAGCCCGTCCAGTTCTCCCAGCAGCTGCACAGCCCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143765 TGGCAGCCCTGCAGCCCGTCCAGTTCTCCCAGCAGCTGCACAGCCCTCAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 CAGCAGCCCCTCATGCAGCAGAGCCCAGGCAGCCACATGGCCCAGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143815 CAGCAGCCCCTCATGCAGCAGAGCCCAGGCAGCCACATGGCCCAGCAGCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 CTTCATGGCAGCTGTGACTCAGCTGCAGAACTCACACA         TGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 143865 CTTCATGGCAGCTGTGACTCAGCTGCAGAACTCACACAGTA...CAGTGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 ACGCACACAAGCAGGAACCCCCCCAGTATTCCCACACCTCCCGGTTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145694 ACGCACACAAGCAGGAACCCCCCCAGTATTCCCACACCTCCCGGTTTCCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 TCTGCAATGGTGGTCACAGATACCAGCAGCATCAGTACACTCACCAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145744 TCTGCAATGGTGGTCACAGATACCAGCAGCATCAGTACACTCACCAACAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 GTCTTCAAGTAAACAG         TGTCCTCTACAAGCCTGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 145794 GTCTTCAAGTAAACAGGTA...CAGTGTCCTCTACAAGCCTGG