seq1 = pF1KB7860.tfa, 1797 bp
seq2 = pF1KB7860/gi568815594r_120595114.tfa (gi568815594r:120595114_121022608), 427495 bp

>pF1KB7860 1797
>gi568815594r:120595114_121022608 (Chr4)

(complement)

1-93  (100001-100093)   100% ->
94-177  (115052-115135)   100% ->
178-300  (169069-169191)   100% ->
301-475  (201264-201438)   100% ->
476-650  (204082-204256)   100% ->
651-772  (206035-206156)   100% ->
773-852  (211160-211239)   100% ->
853-937  (222864-222948)   100% ->
938-1095  (224185-224342)   100% ->
1096-1189  (237518-237611)   98% ->
1190-1350  (241306-241466)   100% ->
1351-1444  (245328-245421)   100% ->
1445-1530  (267971-268056)   100% ->
1531-1635  (312196-312300)   100% ->
1636-1797  (327334-327495)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGGCATGTACGTGCCGGACAGGTTCTCCCTGAAGTCCTCCCGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGGGCATGTACGTGCCGGACAGGTTCTCCCTGAAGTCCTCCCGGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCAGGACGGCATGGGGCTCTACACGGCCCGCAGAGTGCGAAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100051 TCAGGACGGCATGGGGCTCTACACGGCCCGCAGAGTGCGAAAGGTG...C

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     94   GGTGAAAAGTTCGGACCCTTTGCTGGAGAGAAGAGAATGCCTGAAGAC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115050 AGGGTGAAAAGTTCGGACCCTTTGCTGGAGAGAAGAGAATGCCTGAAGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTGGATGAAAATATGGATTACAGGTTGATGTGGGAG         GTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 115100 TTGGATGAAAATATGGATTACAGGTTGATGTGGGAGGTG...CAGGTTCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGGGAGTAAGGGAGAAGTTTTGTACATTTTGGATGCTACCAACCCACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169074 TGGGAGTAAGGGAGAAGTTTTGTACATTTTGGATGCTACCAACCCACGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACTCCAACTGGCTTCGCTTCGTTCATGAGGCACCATCTCAGGAGCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169124 ACTCCAACTGGCTTCGCTTCGTTCATGAGGCACCATCTCAGGAGCAGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AACTTGGCTGCCATTCAA         GAAGGAGAAAACATTTTCTATTT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 169174 AACTTGGCTGCCATTCAAGTG...CAGGAAGGAGAAAACATTTTCTATTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGCAGTTGAAGATATAGAAACAGACACGGAGCTTCTGATTGGCTACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201287 GGCAGTTGAAGATATAGAAACAGACACGGAGCTTCTGATTGGCTACCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATAGTGACATGGAGGCTGAGGAGGAAGAACAGCAAATTATGACAGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201337 ATAGTGACATGGAGGCTGAGGAGGAAGAACAGCAAATTATGACAGTCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAAGAAGGGGAAGTTGAAAATTCTAGAAGACAATCAACAGCGGGCAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201387 AAAGAAGGGGAAGTTGAAAATTCTAGAAGACAATCAACAGCGGGCAGAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AG         ATCGCCTTGGCTGTAAAGAGGACTATGCTTGTCCTCAAT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201437 AGGTA...CAGATCGCCTTGGCTGTAAAGAGGACTATGCTTGTCCTCAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GTGAATCGAGTTTTACCAGTGAGGATATTCTTGCTGAGCATCTCCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204121 GTGAATCGAGTTTTACCAGTGAGGATATTCTTGCTGAGCATCTCCAGACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TTGCACCAGAAACCCACAGAGGAGAAAGAATTTAAGTGCAAGAACTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204171 TTGCACCAGAAACCCACAGAGGAGAAAGAATTTAAGTGCAAGAACTGTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GAAGAAATTCCCAGTTAAGCAGGCTTTGCAAAGACA         TTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 204221 GAAGAAATTCCCAGTTAAGCAGGCTTTGCAAAGACAGTG...TAGTTTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGCAGCACCAGGAGACTTGCCGGGGGGATGCCAGGTTTGTGTGCAAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206040 AGCAGCACCAGGAGACTTGCCGGGGGGATGCCAGGTTTGTGTGCAAGGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GACAGCTGTGGAAAGAGGCTGAAGAGCAAGGATGCCCTGAAAAGACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206090 GACAGCTGTGGAAAGAGGCTGAAGAGCAAGGATGCCCTGAAAAGACACCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGAAAATGTCCACACTG         GAGATCCTAAGAAAAAGCTTATAT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 206140 GGAAAATGTCCACACTGGTG...TAGGAGATCCTAAGAAAAAGCTTATAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GTTCAGTGTGCAATAAAAAGTGTTCTTCAGCATCAAGCCTACAGGAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211184 GTTCAGTGTGCAATAAAAAGTGTTCTTCAGCATCAAGCCTACAGGAACAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AGAAAG         ATTCATGAGATATTTGATTGTCAAGAATGTATGAA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211234 AGAAAGGTC...CAGATTCATGAGATATTTGATTGTCAAGAATGTATGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GAAATTTATTTCAGCTAATCAGCTAAAACGTCATATGATCACCCACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222899 GAAATTTATTTCAGCTAATCAGCTAAAACGTCATATGATCACCCACTCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938          AAAAACGACCCTATAATTGCGAGATTTGTAATAAGTCTTTC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222949 GTA...TAGAAAAACGACCCTATAATTGCGAGATTTGTAATAAGTCTTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AAGAGGCTTGATCAAGTGGGTGCTCACAAAGTAATACACAGCGAAGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224226 AAGAGGCTTGATCAAGTGGGTGCTCACAAAGTAATACACAGCGAAGACAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 ACCTTACAAATGCAAACTTTGTGGAAAGGGATTTGCCCACAGAAATGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224276 ACCTTACAAATGCAAACTTTGTGGAAAGGGATTTGCCCACAGAAATGTTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 ACAAGAATCATAAGAAG         ACCCACTCTGAGGAGAGACCGTTC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 224326 ACAAGAATCATAAGAAGGTA...CAGACCCACTCTGAGGAGAGACCGTTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CAATGTGAAGAATGTAAAGCTCTGTTCCGGACCCCATTTTCTTTACAGAG
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 237542 CAATGTGAAGAATGTAAAGCTTTGTTCCGGACCCCATTTTCTTTACAGAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 ACACCTGCTAATACATAACA         GTGAGAGGACTTTCAAGTGCC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 237592 ACACCTGCTAATACATAACAGTA...AAGGTGAGAGGACTTTCAAGTGCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 ATCACTGCGATGCTACCTTTAAGAGGAAGGATACATTAAATGTTCATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 241327 ATCACTGCGATGCTACCTTTAAGAGGAAGGATACATTAAATGTTCATGTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 CAGGTGGTTCATGAAAGACACAAGAAGTATAGGTGTGAGCTATGTAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 241377 CAGGTGGTTCATGAAAGACACAAGAAGTATAGGTGTGAGCTATGTAATAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GGCCTTTGTTACACCTTCAGTGCTTAGAAGTCATAAGAAA         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 241427 GGCCTTTGTTACACCTTCAGTGCTTAGAAGTCATAAGAAAGTA...TAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CACATACAGGAGAAAAGGAGAAAATCTGTCCATATTGTGGCCAGAAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245329 CACATACAGGAGAAAAGGAGAAAATCTGTCCATATTGTGGCCAGAAATTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GCCAGCAGTGGTACACTCAGAGTTCATATCCGGAGCCACACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 245379 GCCAGCAGTGGTACACTCAGAGTTCATATCCGGAGCCACACAGGTA...T

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1445   GTGAGCGTCCCTATCAATGTCCTTACTGTGAAAAAGGATTCAGTAAAA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 267969 AGGTGAGCGTCCCTATCAATGTCCTTACTGTGAAAAAGGATTCAGTAAAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 ATGATGGACTGAAGATGCACATTCGTACTCACACCAGG         GAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 268019 ATGATGGACTGAAGATGCACATTCGTACTCACACCAGGGTA...CAGGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 AAGCCGTACAAGTGCTCAGAGTGCAGCAAGGCCTTCAGCCAGAAGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 312199 AAGCCGTACAAGTGCTCAGAGTGCAGCAAGGCCTTCAGCCAGAAGCGAGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 CCTGGATGAGCACAAGAGGACGCACACTGGAGAAAAGCCTTTTCAGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 312249 CCTGGATGAGCACAAGAGGACGCACACTGGAGAAAAGCCTTTTCAGTGTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 AT         GTTTGTGATTTGGCTTTTAGCCTGAAGAAAATGCTGATT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 312299 ATGTG...TAGGTTTGTGATTTGGCTTTTAGCCTGAAGAAAATGCTGATT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 CGACACAAGATGACTCATAATCCCAATCGTCCCCTGGCAGAATGCCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 327373 CGACACAAGATGACTCATAATCCCAATCGTCCCCTGGCAGAATGCCAGTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 TTGCCATAAGAAGTTTACAAGGAATGACTACCTCAAAGTGCACATGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 327423 TTGCCATAAGAAGTTTACAAGGAATGACTACCTCAAAGTGCACATGGACA

   1900     .    :    .    :
   1775 ATATCCATGGTGTAGCTGACAGC
        |||||||||||||||||||||||
 327473 ATATCCATGGTGTAGCTGACAGC