seq1 = pF1KB7853.tfa, 1647 bp
seq2 = pF1KB7853/gi568815581r_11877960.tfa (gi568815581r:11877960_12092829), 214870 bp

>pF1KB7853 1647
>gi568815581r:11877960_12092829 (Chr17)

(complement)

1-387  (100001-100387)   100% ->
388-577  (101667-101856)   100% ->
578-666  (102280-102368)   100% ->
667-751  (108633-108717)   100% ->
752-862  (109423-109533)   100% ->
863-1647  (114086-114870)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCGTTGACTTGGGGCAGGCCCTAGGCCTGCTGCCATCGCTGGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCGTTGACTTGGGGCAGGCCCTAGGCCTGCTGCCATCGCTGGCGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCGAGGACTCCCAGTTCTCAGAATCAGATGCTGCCCTTCAAGAGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCGAGGACTCCCAGTTCTCAGAATCAGATGCTGCCCTTCAAGAGGAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTCCAGCCCTGAGACCGCACGCCAGCTTTTCAGGCAGTTCCGTTACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTCCAGCCCTGAGACCGCACGCCAGCTTTTCAGGCAGTTCCGTTACCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGATGTCTGGGCCTCATGAGACCTTGAAGCAACTTCGGAAGCTCTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGATGTCTGGGCCTCATGAGACCTTGAAGCAACTTCGGAAGCTCTGTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCAGTGGCTACAGCCAGAGGTTCACACCAAAGAGCAGATCCTAGAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCAGTGGCTACAGCCAGAGGTTCACACCAAAGAGCAGATCCTAGAGATCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCATGTTGGAGCAGTTTCTGACCATCCTGCCTGGGGAGATCCAGATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCATGTTGGAGCAGTTTCTGACCATCCTGCCTGGGGAGATCCAGATGTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGCGGAAACAGTGTCCAGGAAGTGGAGAAGAGGCAGTGACCCTTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGCGGAAACAGTGTCCAGGAAGTGGAGAAGAGGCAGTGACCCTTGTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AAGCTTGAAGGGGGACCCCCAGAGACTGTGGCAATGG         ATCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100351 AAGCTTGAAGGGGGACCCCCAGAGACTGTGGCAATGGGTA...TAGATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GTATCCAGGTTCTAGGACAGGACATCTTATCAGAGAAGATGGAATCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101671 GTATCCAGGTTCTAGGACAGGACATCTTATCAGAGAAGATGGAATCTCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AGCTGCCAAGTGGGGGAAGTGGAGCCCCATCTTGAAGTGGTGCCTCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101721 AGCTGCCAAGTGGGGGAAGTGGAGCCCCATCTTGAAGTGGTGCCTCAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GTTGGGACTTGAGAATTCATCCTCAGGGCCTGGGGAGCTTCTGAGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101771 GTTGGGACTTGAGAATTCATCCTCAGGGCCTGGGGAGCTTCTGAGCCACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TCGTGAAAGAGGAATCTGACACAGAAGCAGAACTAG         CCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101821 TCGTGAAAGAGGAATCTGACACAGAAGCAGAACTAGGTG...CAGCCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GCTGCCTCCCAGCCTGCCCGACTGGAGGAAAGGCTGATCAGAGACCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102285 GCTGCCTCCCAGCCTGCCCGACTGGAGGAAAGGCTGATCAGAGACCAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCTCGGAGCCTCACTGCTCCCAGCAGCACCTCAG         GAACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 102335 CCTCGGAGCCTCACTGCTCCCAGCAGCACCTCAGGTG...CAGGAACAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GGAGACAACTGGATTCCACTCAAAAGGAGCAATACTGGGATCTCATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108640 GGAGACAACTGGATTCCACTCAAAAGGAGCAATACTGGGATCTCATGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GAGACCTATGGGAAAATGGTCTCAGGAG         CAGGCATTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 108690 GAGACCTATGGGAAAATGGTCTCAGGAGGTG...TAGCAGGCATTTCCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TCCCAAATCTGACCTGACTAATTCAATAGAATTTGGGGAAGAGCTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109436 TCCCAAATCTGACCTGACTAATTCAATAGAATTTGGGGAAGAGCTGGCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GAATATACCTTCATGTCAATGAGAAGATCCCAAGACCCACCTGCATAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 109486 GAATATACCTTCATGTCAATGAGAAGATCCCAAGACCCACCTGCATAGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    863        GAGATAGACAAGAGAATGACAAGGAGAACCTAAATTTGGAGAA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109536 G...TAGGAGATAGACAAGAGAATGACAAGGAGAACCTAAATTTGGAGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TCACAGGGACCAGGAGCTCCTGCATGCTTCCTGTCAAGCTTCAGGAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114129 TCACAGGGACCAGGAGCTCCTGCATGCTTCCTGTCAAGCTTCAGGAGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TTCCTTCTCAGGCTTCCTTGAGGGGCTTCTTCACTGAGGATGAGCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114179 TTCCTTCTCAGGCTTCCTTGAGGGGCTTCTTCACTGAGGATGAGCCAGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TGCTTTGGAGAAGGAGAGAATCTCCCTGAGGCTCTGCAAAACATTCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114229 TGCTTTGGAGAAGGAGAGAATCTCCCTGAGGCTCTGCAAAACATTCAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TGAGGGAACAGGGGAACAGCTGTCTCCTCAAGAAAGGATTTCTGAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114279 TGAGGGAACAGGGGAACAGCTGTCTCCTCAAGAAAGGATTTCTGAGAAAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AACTAGGTCAGCATTTGCCTAATCCTCATTCAGGAGAAATGTCCACCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114329 AACTAGGTCAGCATTTGCCTAATCCTCATTCAGGAGAAATGTCCACCATG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 TGGCTTGAGGAGAAGAGAGAGACCTCCCAGAAGGGGCAGCCAAGAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114379 TGGCTTGAGGAGAAGAGAGAGACCTCCCAGAAGGGGCAGCCAAGAGCCCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 CATGGCCCAGAAGCTCCCCACCTGCAGGGAGTGTGGGAAGACCTTTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114429 CATGGCCCAGAAGCTCCCCACCTGCAGGGAGTGTGGGAAGACCTTTTATA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 GGAATTCTCAGCTTATTTTTCACCAAAGAACTCACACCGGAGAGACATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114479 GGAATTCTCAGCTTATTTTTCACCAAAGAACTCACACCGGAGAGACATAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 TTTCAGTGCACCATCTGCAAAAAAGCCTTTCTGCGGAGTTCAGACTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114529 TTTCAGTGCACCATCTGCAAAAAAGCCTTTCTGCGGAGTTCAGACTTTGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 GAAGCATCAGAGAACTCACACGGGAGAGAAGCCCTGTAAATGTGATTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114579 GAAGCATCAGAGAACTCACACGGGAGAGAAGCCCTGTAAATGTGATTACT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 GTGGGAAAGGCTTTAGTGACTTCTCAGGATTGCGCCACCACGAGAAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114629 GTGGGAAAGGCTTTAGTGACTTCTCAGGATTGCGCCACCACGAGAAAATC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 CACACAGGAGAGAAACCCTATAAATGTCCTATCTGTGAGAAAAGTTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114679 CACACAGGAGAGAAACCCTATAAATGTCCTATCTGTGAGAAAAGTTTCAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 TCAGAGATCAAACTTTAATAGACATCAGAGGGTTCACACTGGAGAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114729 TCAGAGATCAAACTTTAATAGACATCAGAGGGTTCACACTGGAGAGAAAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 CTTATAAATGTTCGCACTGTGGGAAAAGTTTCAGCTGGAGCTCGAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114779 CTTATAAATGTTCGCACTGTGGGAAAAGTTTCAGCTGGAGCTCGAGCCTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 GACAAACATCAAAGATCCCACTTAGGAAAGAAGCCCTTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114829 GACAAACATCAAAGATCCCACTTAGGAAAGAAGCCCTTTCAA