seq1 = pF1KB7852.tfa, 1842 bp
seq2 = pF1KB7852/gi568815580r_5856223.tfa (gi568815580r:5856223_6411625), 555403 bp

>pF1KB7852 1842
>gi568815580r:5856223_6411625 (Chr18)

(complement)

1-72  (100001-100072)   100% ->
73-127  (109669-109723)   100% ->
128-219  (147588-147679)   100% ->
220-324  (167038-167142)   100% ->
325-460  (168197-168332)   100% ->
461-552  (170177-170268)   100% ->
553-707  (171754-171908)   100% ->
708-784  (173586-173662)   100% ->
785-870  (195791-195876)   100% ->
871-981  (198367-198477)   100% ->
982-1096  (239684-239798)   100% ->
1097-1199  (273330-273432)   100% ->
1200-1373  (318098-318271)   100% ->
1374-1444  (330675-330745)   100% ->
1445-1614  (442064-442233)   100% ->
1615-1677  (451470-451532)   100% ->
1678-1842  (455239-455403)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAACAGCCCAACAGGAAAAGGAAGCTTAATATGGATTCCAAAGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAACAGCCCAACAGGAAAAGGAAGCTTAATATGGATTCCAAAGAGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTGGATCAGGACGGACGCTTG         GAGCAAGCTGAAGAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100051 TTTGGATCAGGACGGACGCTTGGTA...TAGGAGCAAGCTGAAGAGGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGAAGCCCAAGGATAGCACAACCCCTTTGAGTCACG         TCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 109688 AGAAGCCCAAGGATAGCACAACCCCTTTGAGTCACGGTA...CAGTCCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TCAGCGGCTGCACAGGGAGCATGGTCTTGGGAGTGGTACTTGAAAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147593 TCAGCGGCTGCACAGGGAGCATGGTCTTGGGAGTGGTACTTGAAAGAACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GAAGGCTGTCGCAGCACCTGTTGAGCTGTTTTCCAAG         GATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 147643 GAAGGCTGTCGCAGCACCTGTTGAGCTGTTTTCCAAGGTC...TAGGATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AGTCCTTTCCAGAGCATGAAAATGGTTTTCAGATTGGAATGAGATTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167042 AGTCCTTTCCAGAGCATGAAAATGGTTTTCAGATTGGAATGAGATTAGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GGCATTGATCCCCGACATCCATCGGTATTCTGTGTGCTTTCTGTAGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167092 GGCATTGATCCCCGACATCCATCGGTATTCTGTGTGCTTTCTGTAGCGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 G         GTTTGTGGTTACCGTCTAAGACTTCATTTTGATGGTTATT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167142 GGTA...CAGGTTTGTGGTTACCGTCTAAGACTTCATTTTGATGGTTATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TAAGTTGCTATGATTTTTGGACCAATGCTGGTTCCCCTGACATTCATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168237 TAAGTTGCTATGATTTTTGGACCAATGCTGGTTCCCCTGACATTCATCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GTAGGATGGTGTGAAAAGACCAAACATGAACTGCACATCCCTAAGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 168287 GTAGGATGGTGTGAAAAGACCAAACATGAACTGCACATCCCTAAGGGTA.

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    461      GTTATAGAAAAGATAAATTTGTTTGGATGGATTACTTGAAGGCCT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168337 ..TAGGTTATAGAAAAGATAAATTTGTTTGGATGGATTACTTGAAGGCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GCAAATTGCAAAATGCTCCAAAGAAATTATTCAGAAACAGAAGTCCT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 170222 GCAAATTGCAAAATGCTCCAAAGAAATTATTCAGAAACAGAAGTCCTGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    553       AATGGGCCAATGTCTAAAGAATTTCAGGTTGGAATGAAGCTGGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170272 ...TAGAATGGGCCAATGTCTAAAGAATTTCAGGTTGGAATGAAGCTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GGCCGTGGACAGGAAGAACCCTTCCTTGGTGTGTGTGGCGACCATAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171798 GGCCGTGGACAGGAAGAACCCTTCCTTGGTGTGTGTGGCGACCATAGCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ATATTGTTGAAGATCGCTTACTAGTGCATTTTGACAACTGGGATGATAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171848 ATATTGTTGAAGATCGCTTACTAGTGCATTTTGACAACTGGGATGATAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TACGATTACTG         GTGCGATGTTAATAGCCCTTATGTCCAGCC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 171898 TACGATTACTGGTG...CAGGTGCGATGTTAATAGCCCTTATGTCCAGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 AGTTGGTTGGTGTCAGGAGAATGGAAGAACTCTGATAGCACCCCAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 173616 AGTTGGTTGGTGTCAGGAGAATGGAAGAACTCTGATAGCACCCCAAGGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    785       GTTATCCCAATCCAGAAAATTTTTCCTGGACAGAATACCTGGAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173666 ...CAGGTTATCCCAATCCAGAAAATTTTTCCTGGACAGAATACCTGGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GCTACTCAAACCAATGCAGTTCCTGCCAAAGTTTTTAAAATG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 195835 GCTACTCAAACCAATGCAGTTCCTGCCAAAGTTTTTAAAATGGTA...CA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    871  AGGTTGCCTCATGGTTTTCTGCCAAATATGAAACTTGAAGTTGTGGATA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198366 GAGGTTGCCTCATGGTTTTCTGCCAAATATGAAACTTGAAGTTGTGGATA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 AACGGAACCCCAGGTTAATTCGTGTTGCTACGATTGTAGATGTTGATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198416 AACGGAACCCCAGGTTAATTCGTGTTGCTACGATTGTAGATGTTGATGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 CAAAGAGTAAAG         GTTCATTTTGATGGTTGGGACCATAAGTA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 198466 CAAAGAGTAAAGGTA...CAGGTTCATTTTGATGGTTGGGACCATAAGTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 TGACTACTGGGTGGAGGCAGACAGCCCTGATATCCACCCGATCGGATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239713 TGACTACTGGGTGGAGGCAGACAGCCCTGATATCCACCCGATCGGATGGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 GTGATGTCACAGGGCATCCACTGGAAGTGCCACAGC         GAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 239763 GTGATGTCACAGGGCATCCACTGGAAGTGCCACAGCGTG...AAGGAACG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 AATGACCTGAAGATCCTTCCAGGTCAAGCTGTCTGTCCTACTCCCGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 273335 AATGACCTGAAGATCCTTCCAGGTCAAGCTGTCTGTCCTACTCCCGGGTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 CCGAGGAATAGGCCATATCCGTGGTCCACGTTATTCGGGACATCACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 273385 CCGAGGAATAGGCCATATCCGTGGTCCACGTTATTCGGGACATCACAGGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1200        TGCTTTTGGCTGCCCGTATTCAGACATGAACTTGAAAAAGGAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 273435 A...CAGTGCTTTTGGCTGCCCGTATTCAGACATGAACTTGAAAAAGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 GCAACACTTCACGATCGTTTGAGAGAACAAACACAGGCAAATTTGGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 318141 GCAACACTTCACGATCGTTTGAGAGAACAAACACAGGCAAATTTGGAATC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 AGACTCTTCACATTCAAAATCAAAAAGCCTCTGTAGTTTGAACTTCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 318191 AGACTCTTCACATTCAAAATCAAAAAGCCTCTGTAGTTTGAACTTCAATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 GAAAACATGAAAAGGTGAACAGTCAGCCCAG         ACTTGTACAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 318241 GAAAACATGAAAAGGTGAACAGTCAGCCCAGGTA...CAGACTTGTACAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 CAGGCAAAGTGTTTGAAAATCAAAGGAAAAGAAGATATTGACTTGGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 330685 CAGGCAAAGTGTTTGAAAATCAAAGGAAAAGAAGATATTGACTTGGATAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 TCTCTTCAGAG         AATACTCGGTGGAGCAGGCGCAGCAGGTGC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 330735 TCTCTTCAGAGGTA...CAGAATACTCGGTGGAGCAGGCGCAGCAGGTGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 TTCACCAGTCAGTGTCCATGTCCACGGTGTCAGCCCACCCTTTTCGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 442094 TTCACCAGTCAGTGTCCATGTCCACGGTGTCAGCCCACCCTTTTCGGGAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 CTTCCCCTCGGCAGGGAGCAACACTGCAAGTTGCTTCCAGGCGTGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 442144 CTTCCCCTCGGCAGGGAGCAACACTGCAAGTTGCTTCCAGGCGTGGCTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 CATCCGGGCCAGCCAAGTGGCACGTTGGACTGTGGATGAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 442194 CATCCGGGCCAGCCAAGTGGCACGTTGGACTGTGGATGAGGTG...TAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 TGGCTGAGTTTGTACAGTCTCTTCTGGGCTGTGAAGAGCATGCCAAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 451471 TGGCTGAGTTTGTACAGTCTCTTCTGGGCTGTGAAGAGCATGCCAAGTGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 TTTAAGAAAGAG         CAGATCGATGGCAAAGCCTTCCTGCTTCT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 451521 TTTAAGAAAGAGGTA...CAGCAGATCGATGGCAAAGCCTTCCTGCTTCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 GACACAGACGGACATTGTCAAAGTGATGAAGATCAAACTGGGCCCAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 455268 GACACAGACGGACATTGTCAAAGTGATGAAGATCAAACTGGGCCCAGCAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757 TGAAGATTTACAACTCTATCCTGATGTTCAGGCATTCCCAGGAACTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 455318 TGAAGATTTACAACTCTATCCTGATGTTCAGGCATTCCCAGGAACTCCCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .
   1807 GAAGAAGATATTGCCTCAGGCCAAGAAGTCAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 455368 GAAGAAGATATTGCCTCAGGCCAAGAAGTCAGGGGA