seq1 = pF1KB7849.tfa, 1635 bp
seq2 = pF1KB7849/gi568815579r_2833492.tfa (gi568815579r:2833492_3039408), 205917 bp

>pF1KB7849 1635
>gi568815579r:2833492_3039408 (Chr19)

(complement)

1-130  (100000-100128)   99% ->
131-311  (102705-102885)   99% ->
312-1635  (104594-105917)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACTGCGTGATCTTTGAGGAAGTGGCTGTGAACTTCACCCCAGAAGA
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 A GGACTGCGTGATCTTTGAGGAAGTGGCTGTGAACTTCACCCCAGAAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGGGCATTGCTGGATCATGCTCAGAGGAGCCTCTACAGAGATGTGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 GTGGGCATTGCTGGATCATGCTCAGAGGAGCCTCTACAGAGATGTGATGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGAGACCTGCAGGAACCTTGCCTCCTTGG         ATTGTTACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100099 TGGAGACCTGCAGGAACCTTGCCTCCTTGGGTA...CAGATTGTTACATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TATGTTAGAACCAGTGGATCAAGTTCTCAGAGGGACGTTTTTGGGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102716 TATGTTAGAACCAGTGGATCAAGTTCTCAGAGGGACGTTTTTGGGAATGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AATATCCAATGATGAAGAAATTGTAAAGTTCACAGGAAGTGATTCCTGGT
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 102766 AATATCCAATGATGAAGAGATTGTAAAGTTCACAGGAAGTGATTCCTGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTATTTTTGGAGAAAATTGGAGATTTGATAACACTGGAGATCAGCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102816 CTATTTTTGGAGAAAATTGGAGATTTGATAACACTGGAGATCAGCACCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATCCCACAGAGGCATCTGAG         AAGTCAGCTGGGGAGACTCTG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 102866 ATCCCACAGAGGCATCTGAGGTG...CAGAAGTCAGCTGGGGAGACTCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGAAAGTAATGAAGGTCATCAATGCGGAGAGACCTTGAGCCAGACTGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104615 TGAAAGTAATGAAGGTCATCAATGCGGAGAGACCTTGAGCCAGACTGCGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACCTTCTTGTGCACAAGAGTTACCCTACCGAAGCTAAACCCTCTGAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104665 ACCTTCTTGTGCACAAGAGTTACCCTACCGAAGCTAAACCCTCTGAGTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ACTAAGTGTGGCAAAGCCTTCGAGAATCGGCAGAGATCTCACACTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104715 ACTAAGTGTGGCAAAGCCTTCGAGAATCGGCAGAGATCTCACACTGGACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GAGACCGTGTAAGGAATGTGGGCAAGCCTGCAGCTGCCTCTCCTGCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104765 GAGACCGTGTAAGGAATGTGGGCAAGCCTGCAGCTGCCTCTCCTGCCAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GCCCTCCTATGAAAACGCAGACTGTAGAGAAACCCTGTAATTGCCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104815 GCCCTCCTATGAAAACGCAGACTGTAGAGAAACCCTGTAATTGCCAGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TCAAGGACAGCATCTGTGACATACGTGAAAAGTCTCAGCAGTAAAAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104865 TCAAGGACAGCATCTGTGACATACGTGAAAAGTCTCAGCAGTAAAAAGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TTATGAATGTCAGAAATGTGGAAAAGCTTTCATTTGTCCCTCATCTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104915 TTATGAATGTCAGAAATGTGGAAAAGCTTTCATTTGTCCCTCATCTTTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GGGGACATGTGAATAGTCATCATGGGCAGAAAACCCATGCATGTAAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104965 GGGGACATGTGAATAGTCATCATGGGCAGAAAACCCATGCATGTAAAGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TGTGGGAAGACCTTTATGTATTACTCCTACCTTACACGGCACGTAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105015 TGTGGGAAGACCTTTATGTATTACTCCTACCTTACACGGCACGTAAGAAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TCACACAGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGGAGTGTGGGAAAGCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105065 TCACACAGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGGAGTGTGGGAAAGCCTTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 GCTGTCCCTCGTACTTTCGAGAACATGTCAGAACACACACTGGAGAGAAA
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105115 GCTGTCCCTCATACTTTCGAGAACATGTCAGAACACACACTGGAGAGAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 CCGTATGAATGTAAGCATTGTGGAAAATCATTCAGCTGTTACTCCTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105165 CCGTATGAATGTAAGCATTGTGGAAAATCATTCAGCTGTTACTCCTCCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TAGAGATCACGTGAGGACGCACACTGGAGAGAAACCCTGTCAGTGTAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105215 TAGAGATCACGTGAGGACGCACACTGGAGAGAAACCCTGTCAGTGTAAAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 ATTGCGGAAAAGCGTTCACTTGTTACTCGTCTCTTCGAGAACATGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105265 ATTGCGGAAAAGCGTTCACTTGTTACTCGTCTCTTCGAGAACATGGGAGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 ACGCACAGTGGAGAGAAACCCTATGAATGTAAGGAATGCGGCAAAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105315 ACGCACAGTGGAGAGAAACCCTATGAATGTAAGGAATGCGGCAAAGCCTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 CAGGTACCCCTCCTCTCTGCGAGCACACATGAGAATGCACACCGGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105365 CAGGTACCCCTCCTCTCTGCGAGCACACATGAGAATGCACACCGGAGAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 AGCCCTATGTGTGCAAGCAGTGTGGGAAGGCCTTCGGATGTCCCACTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105415 AGCCCTATGTGTGCAAGCAGTGTGGGAAGGCCTTCGGATGTCCCACTTAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 TTTAGAAGACATGTGAAAACACACAGCGGGGTGAAGCCCTATCAATGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105465 TTTAGAAGACATGTGAAAACACACAGCGGGGTGAAGCCCTATCAATGTAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 AGAGTGTGGGAAAGCCTACAGTTTTTCCTCCTCCCTTCGAATCCACGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105515 AGAGTGTGGGAAAGCCTACAGTTTTTCCTCCTCCCTTCGAATCCACGTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 GGACGCATACTGGAGAGAAGCCCTTTGAGTGTAAGCATTGTGGGAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105565 GGACGCATACTGGAGAGAAGCCCTTTGAGTGTAAGCATTGTGGGAAAGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 TTCAGCTGTCACTCCTCCCTTCGAGAGCATGTGCGAACCCACAGCGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105615 TTCAGCTGTCACTCCTCCCTTCGAGAGCATGTGCGAACCCACAGCGGAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 GAAACCGTACGAATGTAATCAATGTGGGAAAGCCTTCAGCCACGCTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105665 GAAACCGTACGAATGTAATCAATGTGGGAAAGCCTTCAGCCACGCTCAGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 ACTTTCAAAAGCATGTGAGATCACACAGTGGGGTCAAACCCTACGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105715 ACTTTCAAAAGCATGTGAGATCACACAGTGGGGTCAAACCCTACGAATGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 ACTGAATGTGGGAAAGCCTACAGTTGTTCCTCGTCCCTTCGTGTGCACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105765 ACTGAATGTGGGAAAGCCTACAGTTGTTCCTCGTCCCTTCGTGTGCACGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 GAGAACGCACACTGGAGAGAGACCGTATGAATGCAAGCAGTGTGGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105815 GAGAACGCACACTGGAGAGAGACCGTATGAATGCAAGCAGTGTGGGAAAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 CCTTCAGGTATCTCGCATCGCTTCAAGCACATGTGAGAACACATGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105865 CCTTCAGGTATCTCGCATCGCTTCAAGCACATGTGAGAACACATGCTGGA

   1650 
   1633 GCG
        |||
 105915 GCG