seq1 = pF1KB7845.tfa, 1632 bp
seq2 = pF1KB7845/gi568815591f_99519607.tfa (gi568815591f:99519607_99730017), 210411 bp

>pF1KB7845 1632
>gi568815591f:99519607_99730017 (Chr7)

1-387  (100001-100387)   99% ->
388-589  (101767-101968)   100% ->
590-681  (102943-103034)   100% ->
682-805  (104451-104574)   100% ->
806-1632  (109585-110411)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTTAAAGAGCATCCAGAGATGGCGGAAGCTCCTCAGCAGCAGTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTTAAAGAGCATCCAGAGATGGCGGAAGCTCCTCAGCAGCAGTTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATTCCTGTGGTGAAACTGGAGAAAGAGTTGCCATGGGGCAGAGGAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TATTCCTGTGGTGAAACTGGAGAAAGAGTTGCCATGGGGCAGAGGAAGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGACCCTAGTCCAGAGACTTTTCGGCTGAGGTTTCGGCAGTTCCGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGACCCTAGTCCAGAGACTTTTCGGCTGAGGTTTCGGCAGTTCCGCTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGGAGGCAGCTGGACCCCAGGAAGCTCTTAGGGAGCTCCAGGAACTCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 100151 CAGGAGGCAGCTGGACCCCAGGAAGCTCTTAGGGAGCTCCAGGAGCTCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCGTCGGTGGCTGAGGCCCGAGTTGCACACCAAGGAGCAGATCCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCGTCGGTGGCTGAGGCCCGAGTTGCACACCAAGGAGCAGATCCTGGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCTGGTGCTGGAGCAGTTCCTCACTATCCTGCCCCGCGAGTTCTACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCTGGTGCTGGAGCAGTTCCTCACTATCCTGCCCCGCGAGTTCTACGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGGATCCGGGAGCATGGCCCAGAGAGTGGCAAGGCCCTGGCCGCCATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TGGATCCGGGAGCATGGCCCAGAGAGTGGCAAGGCCCTGGCCGCCATGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGAGGACCTGACAGAAAGAGCACTGGAGGCCAAGGCG         GTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100351 GGAGGACCTGACAGAAAGAGCACTGGAGGCCAAGGCGGTG...TAGGTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CATGCCACAGGCAGGGAGAGCAGGAGGAAACAGCACTTTGCAGAGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101771 CATGCCACAGGCAGGGAGAGCAGGAGGAAACAGCACTTTGCAGAGGCGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TGGGAGCCAGGCATCCAGCTGGGGCCAGTGGAGGTCAAGCCTGAATGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101821 TGGGAGCCAGGCATCCAGCTGGGGCCAGTGGAGGTCAAGCCTGAATGGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GATGCCCCCTGGGGAAGGAGTTCAAGGTCCAGACCCAGGTACCGAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101871 GATGCCCCCTGGGGAAGGAGTTCAAGGTCCAGACCCAGGTACCGAGGAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AGCTCAGTCAGGACCCTGGAGATGAGACACGGGCCTTCCAGGAGCAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 101921 AGCTCAGTCAGGACCCTGGAGATGAGACACGGGCCTTCCAGGAGCAAGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    590        CACTACCTGTTCTGCAGGCGGGTCCTGGCCTCCCCGCAGTGAA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101971 G...CAGCACTACCTGTTCTGCAGGCGGGTCCTGGCCTCCCCGCAGTGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TCCCAGAGACCAAGAGATGGCAGCTGGGTTCTTTACTGCTGGATCGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 102986 TCCCAGAGACCAAGAGATGGCAGCTGGGTTCTTTACTGCTGGATCGCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    682         GGGTTGGGGCCATTTAAAGATATGGCCCTGGCCTTCCCTGAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103036 TG...CAGGGGTTGGGGCCATTTAAAGATATGGCCCTGGCCTTCCCTGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GAGGAGTGGAGGCATGTGACCCCAGCCCAGATAGACTGCTTTGGGGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104493 GAGGAGTGGAGGCATGTGACCCCAGCCCAGATAGACTGCTTTGGGGAGTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TGTGGAACCGCAGGACTGCAGGGTCTCTCCAG         GCGGTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 104543 TGTGGAACCGCAGGACTGCAGGGTCTCTCCAGGTA...TAGGCGGTGGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GCAAGGAAAAGGAGGCAAAACCCCCACAGGAAGACCTGAAAGGGGCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109594 GCAAGGAAAAGGAGGCAAAACCCCCACAGGAAGACCTGAAAGGGGCGCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GTGGCACTGACATCAGAGAGGTTTGGGGAAGCCTCTCTCCAGGGCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109644 GTGGCACTGACATCAGAGAGGTTTGGGGAAGCCTCTCTCCAGGGCCCTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GCTCGGAAGGGTCTGTGAGCAGGAGCCTGGTGGCCCTGCAGGCAGTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109694 GCTCGGAAGGGTCTGTGAGCAGGAGCCTGGTGGCCCTGCAGGCAGTGCGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CTGGGCTTCCTCCTCCCCAGCACGGTGCCATCCCCCTGCCTGACGAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109744 CTGGGCTTCCTCCTCCCCAGCACGGTGCCATCCCCCTGCCTGACGAAGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 AAAACCCACAGCTCCTTCTGGAAGCCTTTCCAGTGCCCTGAGTGTGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109794 AAAACCCACAGCTCCTTCTGGAAGCCTTTCCAGTGCCCTGAGTGTGGGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 AGGATTCAGTCGGAGCTCCAATCTCGTCAGGCACCAGCGAACCCACGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109844 AGGATTCAGTCGGAGCTCCAATCTCGTCAGGCACCAGCGAACCCACGAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 AGAAGTCTTATGGCTGTGTGGAGTGTGGGAAGGGCTTTACCCTGAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 109894 AGAAGTCTTATGGCTGTGTGGAGTGTGGGAAGGGCTTTACCCTGAGAGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 TACCTGATGAAGCACCAGAGAACCCACCTGGGAAAGAGGCCCTACGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109944 TACCTGATGAAGCACCAGAGAACCCACCTGGGAAAGAGGCCCTACGTGTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 CAGCGAGTGCTGGAAAACCTTCAGCCAGAGACACCACCTGGAGGTGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109994 CAGCGAGTGCTGGAAAACCTTCAGCCAGAGACACCACCTGGAGGTGCACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 AGCGCAGCCACACTGGGGAGAAGCCCTACAAGTGCGGGGACTGCTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110044 AGCGCAGCCACACTGGGGAGAAGCCCTACAAGTGCGGGGACTGCTGGAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 AGCTTCAGCCGCAGGCAGCACCTGCAGGTGCACCGGAGGACGCACACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110094 AGCTTCAGCCGCAGGCAGCACCTGCAGGTGCACCGGAGGACGCACACCGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 GGAGAAGCCCTACACCTGCGAGTGTGGCAAGAGCTTCAGCAGGAATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110144 GGAGAAGCCCTACACCTGCGAGTGTGGCAAGAGCTTCAGCAGGAATGCCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 ATCTGGCGGTGCACCGGCGTGCCCACACTGGCGAGAAGCCATATGGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110194 ATCTGGCGGTGCACCGGCGTGCCCACACTGGCGAGAAGCCATATGGGTGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 CAGGTGTGCGGGAAGCGGTTCAGCAAAGGGGAGCGGCTGGTCCGACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110244 CAGGTGTGCGGGAAGCGGTTCAGCAAAGGGGAGCGGCTGGTCCGACACCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 GAGAATCCATACAGGGGAGAAGCCCTACCACTGTCCTGCCTGCGGGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110294 GAGAATCCATACAGGGGAGAAGCCCTACCACTGTCCTGCCTGCGGGCGAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 GCTTCAACCAGAGGTCCATCCTCAACCGGCACCAGAAGACCCAGCACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110344 GCTTCAACCAGAGGTCCATCCTCAACCGGCACCAGAAGACCCAGCACCGC

   1650     .    :    .
   1615 CAGGAGCCGCTGGTGCAG
        ||||||||||||||||||
 110394 CAGGAGCCGCTGGTGCAG