seq1 = pF1KB7840.tfa, 1845 bp
seq2 = pF1KB7840/gi568815575r_49075676.tfa (gi568815575r:49075676_49286297), 210622 bp

>pF1KB7840 1845
>gi568815575r:49075676_49286297 (ChrX)

(complement)

1-42  (100001-100042)   100% ->
43-128  (101588-101673)   100% ->
129-312  (102381-102564)   100% ->
313-426  (106492-106605)   100% ->
427-564  (106910-107047)   100% ->
565-768  (107823-108026)   100% ->
769-955  (108119-108305)   100% ->
956-1255  (109096-109395)   100% ->
1256-1845  (110033-110622)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCGCGCGTGGGTCCCGGAGGCGCCGCTCCGGGCGTGCG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100001 ATGTTCGCGCGTGGGTCCCGGAGGCGCCGCTCCGGGCGTGCGGTG...CA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     43  CCTCCAGAGGCAGAGGACCCAGACCGGGGCCAGCCCTGCAACTCCTGTA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101587 GCCTCCAGAGGCAGAGGACCCAGACCGGGGCCAGCCCTGCAACTCCTGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGGAGCAGTGCCCTGGCTTCCTGCTCCACGGCTGGAG         AAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 101637 GGGAGCAGTGCCCTGGCTTCCTGCTCCACGGCTGGAGGTA...CAGAAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ATCTGCCAGCATTGCAAATGCCCGCGGGAGGAGCATGCAGTGCACGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102385 ATCTGCCAGCATTGCAAATGCCCGCGGGAGGAGCATGCAGTGCACGCGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCCTGTGGACCTGGAACGCATCATGTGTCGGCTAATCTCGGACTTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102435 GCCTGTGGACCTGGAACGCATCATGTGTCGGCTAATCTCGGACTTCCAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCCACTCCATCTCCGACGACGACTCAGGCTGTGCATCGGAGGAGTATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102485 GCCACTCCATCTCCGACGACGACTCAGGCTGTGCATCGGAGGAGTATGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGGGTGCCCCCAGGCCTTAAGCCGGAGCAG         GTATATCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 102535 TGGGTGCCCCCAGGCCTTAAGCCGGAGCAGGTG...CAGGTATATCAATT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTTCAGCTGCCTCCCAGAGGACAAGGTCCCCTACGTCAACAGTCCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106503 TTTCAGCTGCCTCCCAGAGGACAAGGTCCCCTACGTCAACAGTCCTGGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGAAATACAGGATCAAGCAGCTGCTGCACCAGCTGCCCCCACACGACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106553 AGAAATACAGGATCAAGCAGCTGCTGCACCAGCTGCCCCCACACGACAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAG         GCACAGTACTGCACAGCACTGGAAGAGGAGGAAAAGAA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106603 GAGGTG...CAGGCACAGTACTGCACAGCACTGGAAGAGGAGGAAAAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGAGCTCCGAGCCTTTAGCCAGCAGCGGAAGCGGGAGAATCTGGGGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106948 AGAGCTCCGAGCCTTTAGCCAGCAGCGGAAGCGGGAGAATCTGGGGCGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCATCGTGCGCATCTTCCCGGTGACCATCACTGGGGCCATCTGTGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106998 GCATCGTGCGCATCTTCCCGGTGACCATCACTGGGGCCATCTGTGAGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565          TGCGGAAAGCAGATTGGAGGTGGGGACATCGCAGTGTTTGC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107048 GTG...CAGTGCGGAAAGCAGATTGGAGGTGGGGACATCGCAGTGTTTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CAGCCGTGCAGGCCTGGGTGCCTGCTGGCACCCACAGTGCTTCGTGTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107864 CAGCCGTGCAGGCCTGGGTGCCTGCTGGCACCCACAGTGCTTCGTGTGTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCACGTGCCAGGAACTGCTGGTTGACCTCATCTACTTCTACCATGTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107914 CCACGTGCCAGGAACTGCTGGTTGACCTCATCTACTTCTACCATGTTGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAGGTCTACTGCGGGCGTCACCATGCCGAATGCCTGCGTCCACGCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107964 AAGGTCTACTGCGGGCGTCACCATGCCGAATGCCTGCGTCCACGCTGCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AGCCTGTGACGAG         ATCATCTTCTCCCCTGAGTGCACGGAGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 108014 AGCCTGTGACGAGGTT...CAGATCATCTTCTCCCCTGAGTGCACGGAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CTGAGGGCCGCCACTGGCACATGGATCACTTCTGCTGCTTTGAGTGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108147 CTGAGGGCCGCCACTGGCACATGGATCACTTCTGCTGCTTTGAGTGTGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GCTTCACTAGGAGGGCAGCGCTATGTCATGCGTCAGAGCCGCCCCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108197 GCTTCACTAGGAGGGCAGCGCTATGTCATGCGTCAGAGCCGCCCCCACTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CTGCGCCTGCTACGAGGCCCGCCACGCGGAGTACTGTGATGGCTGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108247 CTGCGCCTGCTACGAGGCCCGCCACGCGGAGTACTGTGATGGCTGTGGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AGCACATCG         GCCTGGACCAAGGCCAGATGGCTTACGAGGGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 108297 AGCACATCGGTG...CAGGCCTGGACCAAGGCCAGATGGCTTACGAGGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CAGCACTGGCATGCCTCAGACCGCTGCTTCTGCTGTAGTCGCTGTGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109128 CAGCACTGGCATGCCTCAGACCGCTGCTTCTGCTGTAGTCGCTGTGGGCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GGCCCTGCTGGGCCGCCCATTCCTGCCACGCCGAGGCCTAATCTTCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109178 GGCCCTGCTGGGCCGCCCATTCCTGCCACGCCGAGGCCTAATCTTCTGCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CTCGAGCCTGCAGCCTTGGGTCCGAGCCCACAGCTCCAGGGCCGAGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109228 CTCGAGCCTGCAGCCTTGGGTCCGAGCCCACAGCTCCAGGGCCGAGCCGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CGCAGCTGGAGTGCCGGCCCTGTCACAGCCCCACTTGCAGCCTCCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109278 CGCAGCTGGAGTGCCGGCCCTGTCACAGCCCCACTTGCAGCCTCCACAGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CTCTTTCTCTGCTGTGAAGGGGGCATCAGAGACCACCACCAAAGGCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109328 CTCTTTCTCTGCTGTGAAGGGGGCATCAGAGACCACCACCAAAGGCACCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 GCACAGAGTTAGCGCCAG         CTACAGGCCCTGAGGAGCCCTCC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 109378 GCACAGAGTTAGCGCCAGGTG...CAGCTACAGGCCCTGAGGAGCCCTCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CGCTTTCTGAGAGGGGCTCCCCACCGCCACTCCATGCCGGAACTGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110056 CGCTTTCTGAGAGGGGCTCCCCACCGCCACTCCATGCCGGAACTGGGGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CCGCAGTGTCCCCGAGCCGCCCCCAGAGTCCCCCGGCCAGCCTAACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110106 CCGCAGTGTCCCCGAGCCGCCCCCAGAGTCCCCCGGCCAGCCTAACCTGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 GCCCAGATGATAGTGCCTTCGGTCGTCAGAGCACCCCACGCGTCAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110156 GCCCAGATGATAGTGCCTTCGGTCGTCAGAGCACCCCACGCGTCAGCTTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CGCGACCCTCTGGTGTCTGAAGGAGGCCCGCGCCGGACCCTGAGTGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110206 CGCGACCCTCTGGTGTCTGAAGGAGGCCCGCGCCGGACCCTGAGTGCACC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 CCCGGCCCAGCGCCGCAGGCCACGCAGTCCCCCACCCAGGGCCCCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110256 CCCGGCCCAGCGCCGCAGGCCACGCAGTCCCCCACCCAGGGCCCCCAGCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 GTCGCCGCCACCATCATCATAATCACCATCACCATCACAACCGCCACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110306 GTCGCCGCCACCATCATCATAATCACCATCACCATCACAACCGCCACCCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 AGCAGACGTCGCCACTATCAATGTGACGCGGGATCAGGGTCAGACTCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110356 AGCAGACGTCGCCACTATCAATGTGACGCGGGATCAGGGTCAGACTCGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 ATCTTGCTCCAGCTCGCCCTCCAGTTCCAGTTCCGAATCATCAGAGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110406 ATCTTGCTCCAGCTCGCCCTCCAGTTCCAGTTCCGAATCATCAGAGGATG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 ATGGCTTCTTCCTAGGAGAGCGCATCCCTCTGCCCCCGCATTTGTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110456 ATGGCTTCTTCCTAGGAGAGCGCATCCCTCTGCCCCCGCATTTGTGCAGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 CCCATGCCTGCTCAGGACACTGCAATGGAGACCTTCAACTCCCCATCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110506 CCCATGCCTGCTCAGGACACTGCAATGGAGACCTTCAACTCCCCATCTTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 ATCGCTCCCCAGGGACTCTCGCGCAGGGATGCCTCGTCAGGCCCGAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110556 ATCGCTCCCCAGGGACTCTCGCGCAGGGATGCCTCGTCAGGCCCGAGACA

   1900     .    :    .
   1829 AGAACTGCATCGTGGCT
        |||||||||||||||||
 110606 AGAACTGCATCGTGGCT