seq1 = pF1KB7838.tfa, 1842 bp
seq2 = pF1KB7838/gi568815581r_39993086.tfa (gi568815581r:39993086_40197406), 204321 bp

>pF1KB7838 1842
>gi568815581r:39993086_40197406 (Chr17)

(complement)

1-31  (97313-97343)   100% ->
32-370  (100004-100342)   100% ->
371-459  (100628-100716)   100% ->
460-604  (100820-100964)   100% ->
605-1248  (101320-101963)   100% ->
1249-1434  (102287-102472)   100% ->
1435-1645  (103285-103495)   100% ->
1646-1842  (104125-104321)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGACCCTGGACTCCAACAACAACACAG         GTGGCGTCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
  97313 ATGACGACCCTGGACTCCAACAACAACACAGGTA...CAGGTGGCGTCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CACCTACATTGGCTCCAGTGGCTCCTCCCCAAGCCGCACCAGCCCTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100014 CACCTACATTGGCTCCAGTGGCTCCTCCCCAAGCCGCACCAGCCCTGAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCCTCTATAGTGACAACTCCAATGGCAGCTTCCAGTCCCTGACCCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100064 CCCTCTATAGTGACAACTCCAATGGCAGCTTCCAGTCCCTGACCCAAGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGTCCCACCTACTTCCCACCATCCCCCACTGGCTCCCTCACCCAAGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100114 TGTCCCACCTACTTCCCACCATCCCCCACTGGCTCCCTCACCCAAGACCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGCTCGCTCCTTTGGGAGCATTCCACCCAGCCTGAGTGATGACGGCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100164 GGCTCGCTCCTTTGGGAGCATTCCACCCAGCCTGAGTGATGACGGCTCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTTCTTCCTCATCTTCCTCGTCGTCATCCTCCTCCTCCTTCTATAATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100214 CTTCTTCCTCATCTTCCTCGTCGTCATCCTCCTCCTCCTTCTATAATGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGCCCCCCTGGGAGTCTACAAGTGGCCATGGAGGACAGCAGCCGAGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100264 AGCCCCCCTGGGAGTCTACAAGTGGCCATGGAGGACAGCAGCCGAGTGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCCCAGCAAGAGCACCAGCAACATCACCA         AGCTGAATGGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100314 CCCCAGCAAGAGCACCAGCAACATCACCAGTG...CAGAGCTGAATGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGGTGTTACTGTGTAAAGTGTGTGGGGACGTTGCCTCGGGCTTCCACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100640 TGGTGTTACTGTGTAAAGTGTGTGGGGACGTTGCCTCGGGCTTCCACTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGTGTGCACGCCTGCGAGGGCTGCAAG         GGCTTTTTCCGTCG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100690 GGTGTGCACGCCTGCGAGGGCTGCAAGGTG...CAGGGCTTTTTCCGTCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GAGCATCCAGCAGAACATCCAGTACAAAAGGTGTCTGAAGAATGAGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100834 GAGCATCCAGCAGAACATCCAGTACAAAAGGTGTCTGAAGAATGAGAATT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCTCCATCGTCCGCATCAATCGCAACCGCTGCCAGCAATGTCGCTTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100884 GCTCCATCGTCCGCATCAATCGCAACCGCTGCCAGCAATGTCGCTTCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AAGTGTCTCTCTGTGGGCATGTCTCGAGACG         CTGTGCGTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100934 AAGTGTCTCTCTGTGGGCATGTCTCGAGACGGTG...CAGCTGTGCGTTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGGGCGCATCCCCAAACGAGAGAAGCAGCGGATGCTTGCTGAGATGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101330 TGGGCGCATCCCCAAACGAGAGAAGCAGCGGATGCTTGCTGAGATGCAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GTGCCATGAACCTGGCCAACAACCAGTTGAGCAGCCAGTGCCCGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101380 GTGCCATGAACCTGGCCAACAACCAGTTGAGCAGCCAGTGCCCGCTGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ACTTCACCCACCCAGCACCCCACCCCAGGCCCCATGGGCCCCTCGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101430 ACTTCACCCACCCAGCACCCCACCCCAGGCCCCATGGGCCCCTCGCCACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CCCTGCTCCGGTCCCCTCACCCCTGGTGGGCTTCTCCCAGTTTCCACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101480 CCCTGCTCCGGTCCCCTCACCCCTGGTGGGCTTCTCCCAGTTTCCACAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGCTGACGCCTCCCAGATCCCCAAGCCCTGAGCCCACAGTGGAGGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101530 AGCTGACGCCTCCCAGATCCCCAAGCCCTGAGCCCACAGTGGAGGATGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ATATCCCAGGTGGCCCGGGCCCATCGAGAGATCTTCACCTACGCCCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101580 ATATCCCAGGTGGCCCGGGCCCATCGAGAGATCTTCACCTACGCCCATGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CAAGCTGGGCAGCTCACCTGGCAACTTCAATGCCAACCATGCATCAGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101630 CAAGCTGGGCAGCTCACCTGGCAACTTCAATGCCAACCATGCATCAGGTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 GCCCTCCAGCCACCACCCCACATCGCTGGGAAAATCAGGGCTGCCCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101680 GCCCTCCAGCCACCACCCCACATCGCTGGGAAAATCAGGGCTGCCCACCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GCCCCCAATGACAACAACACCTTGGCTGCCCAGCGTCATAACGAGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101730 GCCCCCAATGACAACAACACCTTGGCTGCCCAGCGTCATAACGAGGCCCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 AAATGGTCTGCGCCAGGCTCCCTCCTCCTACCCTCCCACCTGGCCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101780 AAATGGTCTGCGCCAGGCTCCCTCCTCCTACCCTCCCACCTGGCCTCCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 GCCCTGCACACCACAGCTGCCACCAGTCCAACAGCAACGGGCACCGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101830 GCCCTGCACACCACAGCTGCCACCAGTCCAACAGCAACGGGCACCGTCTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 TGCCCCACCCACGTGTATGCAGCCCCAGAAGGCAAGGCACCTGCCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101880 TGCCCCACCCACGTGTATGCAGCCCCAGAAGGCAAGGCACCTGCCAACAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 TCCCCGGCAGGGCAACTCAAAGAATGTTCTGCTG         GCATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 101930 TCCCCGGCAGGGCAACTCAAAGAATGTTCTGCTGGTA...CAGGCATGTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 CTATGAACATGTACCCGCATGGACGCAGTGGGCGAACGGTGCAGGAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102294 CTATGAACATGTACCCGCATGGACGCAGTGGGCGAACGGTGCAGGAGATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 TGGGAGGATTTCTCCATGAGCTTCACGCCCGCTGTGCGGGAGGTGGTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102344 TGGGAGGATTTCTCCATGAGCTTCACGCCCGCTGTGCGGGAGGTGGTAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 GTTTGCCAAACACATCCCGGGCTTCCGTGACCTTTCTCAGCATGACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102394 GTTTGCCAAACACATCCCGGGCTTCCGTGACCTTTCTCAGCATGACCAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 TCACCCTGCTTAAGGCTGGCACCTTTGAG         GTGCTGATGGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 102444 TCACCCTGCTTAAGGCTGGCACCTTTGAGGTG...TAGGTGCTGATGGTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 CGCTTTGCTTCGTTGTTCAACGTGAAGGACCAGACAGTGATGTTCCTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103297 CGCTTTGCTTCGTTGTTCAACGTGAAGGACCAGACAGTGATGTTCCTAAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 CCGCACCACCTACAGCCTGCAGGAGCTTGGTGCCATGGGCATGGGAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103347 CCGCACCACCTACAGCCTGCAGGAGCTTGGTGCCATGGGCATGGGAGACC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 TGCTCAGTGCCATGTTCGACTTCAGCGAGAAGCTCAACTCCCTGGCGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103397 TGCTCAGTGCCATGTTCGACTTCAGCGAGAAGCTCAACTCCCTGGCGCTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 ACCGAGGAGGAGCTGGGCCTCTTCACCGCGGTGGTGCTTGTCTCTGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 103447 ACCGAGGAGGAGCTGGGCCTCTTCACCGCGGTGGTGCTTGTCTCTGCAGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1646         ACCGCTCGGGCATGGAGAATTCCGCTTCGGTGGAGCAGCTCC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103497 TA...CAGACCGCTCGGGCATGGAGAATTCCGCTTCGGTGGAGCAGCTCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 AGGAGACGCTGCTGCGGGCTCTTCGGGCTCTGGTGCTGAAGAACCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104167 AGGAGACGCTGCTGCGGGCTCTTCGGGCTCTGGTGCTGAAGAACCGGCCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 TTGGAGACTTCCCGCTTCACCAAGCTGCTGCTCAAGCTGCCGGACCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104217 TTGGAGACTTCCCGCTTCACCAAGCTGCTGCTCAAGCTGCCGGACCTGCG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 GACCCTGAACAACATGCATTCCGAGAAGCTGCTGTCCTTCCGGGTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104267 GACCCTGAACAACATGCATTCCGAGAAGCTGCTGTCCTTCCGGGTGGACG

   1900     .
   1838 CCCAG
        |||||
 104317 CCCAG