seq1 = pF1KB7830.tfa, 1815 bp
seq2 = pF1KB7830/gi568815593r_178612063.tfa (gi568815593r:178612063_178827128), 215066 bp

>pF1KB7830 1815
>gi568815593r:178612063_178827128 (Chr5)

(complement)

1-33  (98107-98139)   100% ->
34-160  (100004-100130)   100% ->
161-256  (101658-101753)   100% ->
257-1815  (113508-115066)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCTGGGCAGCGGGAAGCGAGGCCCCAG         GTGTCACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
  98107 ATGGCTGCTGGGCAGCGGGAAGCGAGGCCCCAGGTG...CAGGTGTCACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GACGTTTGAGGATGTGGCTGTGCTGTTTACCCGAGATGAGTGGAGAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100012 GACGTTTGAGGATGTGGCTGTGCTGTTTACCCGAGATGAGTGGAGAAAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGCCCCTTCTCAGAGAAACTTGTACCGGGATGTGATGCTGGAGAACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100062 TGGCCCCTTCTCAGAGAAACTTGTACCGGGATGTGATGCTGGAGAACTAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGGAACCTGGTCTCACTGG         GGCTCCCATTTACCAAACCAAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100112 AGGAACCTGGTCTCACTGGGTA...CAGGGCTCCCATTTACCAAACCAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGTGATCTCCCTGTTGCAGCAAGGAGAAGATCCCTGGGAGGTGGAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101680 AGTGATCTCCCTGTTGCAGCAAGGAGAAGATCCCTGGGAGGTGGAGAAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACGGTTCTGGCGTCTCCTCTCTAG         GATCGAAGAGCAGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 101730 ACGGTTCTGGCGTCTCCTCTCTAGGTA...CAGGATCGAAGAGCAGTCAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAAACCACAAAGTCAACGCAAACACAAGACTCTTCATTTCAGGGACTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113525 AAAACCACAAAGTCAACGCAAACACAAGACTCTTCATTTCAGGGACTGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACTGAAAAGATCCAACAGGAATGTACCTTGGGATTTGAAATTAGAAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113575 ACTGAAAAGATCCAACAGGAATGTACCTTGGGATTTGAAATTAGAAAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTTACATATATGAAGGCAGATTAGAGAAAAAGCAGGATAAAAAGGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113625 CTTACATATATGAAGGCAGATTAGAGAAAAAGCAGGATAAAAAGGGAAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTTCAGATAGTTTCAGCCACCCACAAAAAAATCCCCACTATAGAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113675 TTTCAGATAGTTTCAGCCACCCACAAAAAAATCCCCACTATAGAAAGAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCATAAAAATACTGAATTGAGCCAAAACTTCAGCCCAAAGTCAGTGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113725 CCATAAAAATACTGAATTGAGCCAAAACTTCAGCCCAAAGTCAGTGCTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTAGGCAACAGATACTTCCCAGAGAAAAAACACCACCAAAATGTGAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113775 TTAGGCAACAGATACTTCCCAGAGAAAAAACACCACCAAAATGTGAAATA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CAAGGAAACAGCCTCAAACAGAATTCACAATTACTTAATCAACCAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113825 CAAGGAAACAGCCTCAAACAGAATTCACAATTACTTAATCAACCAAAAAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TACAGCAGATAAACGCTATAAATGTAGTCTGTGTGAAAAAACCTTCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113875 TACAGCAGATAAACGCTATAAATGTAGTCTGTGTGAAAAAACCTTCATTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ACACTTCATCCCTTCGTAAACATGAGAAAAACCATAGTGGAGAGAAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113925 ACACTTCATCCCTTCGTAAACATGAGAAAAACCATAGTGGAGAGAAACTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TTTAAGTGTAAAGAATGTTCAAAAGCCTTTAGCCAAAGTTCAGCTCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113975 TTTAAGTGTAAAGAATGTTCAAAAGCCTTTAGCCAAAGTTCAGCTCTTAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TCAACATCAAATAACGCATACTGGAGAGAAACCCTACATATGTAAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114025 TCAACATCAAATAACGCATACTGGAGAGAAACCCTACATATGTAAAGAAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GTGGGAAAGCCTTTACTCTCAGTACATCCCTTTATAAACATCTAAGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114075 GTGGGAAAGCCTTTACTCTCAGTACATCCCTTTATAAACATCTAAGAACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CATACTGTGGAGAAATCCTACAGATGTAAAGAATGTGGTAAATCCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114125 CATACTGTGGAGAAATCCTACAGATGTAAAGAATGTGGTAAATCCTTCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CCGAAGGTCAGGCCTTTTTATACATCAAAAAATTCATGCTGAAGAAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114175 CCGAAGGTCAGGCCTTTTTATACATCAAAAAATTCATGCTGAAGAAAACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CTTGTAAGTATAATCCGGGTAGGAAGGCATCTAGTTGCAGCACATCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114225 CTTGTAAGTATAATCCGGGTAGGAAGGCATCTAGTTGCAGCACATCCCTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 TCTGGATGTCAAAGAATTCATTCTAGAAAGAAGTCCTACTTATGTAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114275 TCTGGATGTCAAAGAATTCATTCTAGAAAGAAGTCCTACTTATGTAATGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 ATGTGGCAACACCTTTAAGTCTAGCTCATCCCTTCGTTATCATCAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114325 ATGTGGCAACACCTTTAAGTCTAGCTCATCCCTTCGTTATCATCAGAGAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 TTCACACTGGAGAGAAGCCTTTTAAATGTAGTGAATGTGGGAGAGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114375 TTCACACTGGAGAGAAGCCTTTTAAATGTAGTGAATGTGGGAGAGCCTTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 AGCCAGAGTGCCTCTCTTATTCAACATGAAAGAATTCACACCGGAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114425 AGCCAGAGTGCCTCTCTTATTCAACATGAAAGAATTCACACCGGAGAAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 GCCCTATAGATGCAATGAATGTGGGAAAGGCTTTACTTCTATTTCACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114475 GCCCTATAGATGCAATGAATGTGGGAAAGGCTTTACTTCTATTTCACGAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 TTAATAGACACCGAATCATTCATACTGGAGAGAAGTTTTATAATTGTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114525 TTAATAGACACCGAATCATTCATACTGGAGAGAAGTTTTATAATTGTAAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 GAATGTGGTAAAGCCTTAAGCTCCCACTCAACACTTATTATTCACGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114575 GAATGTGGTAAAGCCTTAAGCTCCCACTCAACACTTATTATTCACGAGCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 AATTCATACTGGAGAAAAACCATGTAAATGTAAAGTATGTGGAAAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114625 AATTCATACTGGAGAAAAACCATGTAAATGTAAAGTATGTGGAAAAGCCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 TCAGACAGAGTTCAGCTCTCATTCAACATCAGAGAATGCATACTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114675 TCAGACAGAGTTCAGCTCTCATTCAACATCAGAGAATGCATACTGGAGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 AGACCCTATAAATGTAACGAGTGTGGGAAAACATTCAGGTGTAACTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114725 AGACCCTATAAATGTAACGAGTGTGGGAAAACATTCAGGTGTAACTCATC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 ACTTAGTAATCACCAGAGAATTCATACTGGAGAGAAACCATATCGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114775 ACTTAGTAATCACCAGAGAATTCATACTGGAGAGAAACCATATCGATGTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 AGGAATGTGGGATATCTTTTGGCCAAAGTTCAGCTCTTATTCAGCATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114825 AGGAATGTGGGATATCTTTTGGCCAAAGTTCAGCTCTTATTCAGCATCGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 AGGATTCATACAGGAGAAAAACCCTTTAAATGTAATACATGTGGAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114875 AGGATTCATACAGGAGAAAAACCCTTTAAATGTAATACATGTGGAAAAAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 TTTTAGACAAAGCTCATCACGTATTGCACATCAGAGAATTCATACTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114925 TTTTAGACAAAGCTCATCACGTATTGCACATCAGAGAATTCATACTGGAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 AGAAACCCTATGAATGTAATACATGTGGGAAACTTTTCAACCATAGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114975 AGAAACCCTATGAATGTAATACATGTGGGAAACTTTTCAACCATAGGTCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 TCCCTTACTAATCATTATAAAATTCATATCGAAGAGGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115025 TCCCTTACTAATCATTATAAAATTCATATCGAAGAGGACCCC