seq1 = pF1KB7828.tfa, 1815 bp
seq2 = pF1KB7828/gi568815596r_177130788.tfa (gi568815596r:177130788_177364576), 233789 bp

>pF1KB7828 1815
>gi568815596r:177130788_177364576 (Chr2)

(complement)

1-45  (100001-100045)   100% ->
46-312  (130306-130572)   100% ->
313-402  (131238-131327)   100% ->
403-594  (131994-132185)   100% ->
595-1815  (132569-133789)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGGACTTGGAGCTGCCGCCGCCGGGACTCCCGTCCCAGCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100001 ATGATGGACTTGGAGCTGCCGCCGCCGGGACTCCCGTCCCAGCAGGTG..

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     46     GACATGGATTTGATTGACATACTTTGGAGGCAAGATATAGATCTTG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 .TAGGACATGGATTTGATTGACATACTTTGGAGGCAAGATATAGATCTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GAGTAAGTCGAGAAGTATTTGACTTCAGTCAGCGACGGAAAGAGTATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130352 GAGTAAGTCGAGAAGTATTTGACTTCAGTCAGCGACGGAAAGAGTATGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGAAAAACAGAAAAAACTTGAAAAGGAAAGACAAGAACAACTCCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130402 CTGGAAAAACAGAAAAAACTTGAAAAGGAAAGACAAGAACAACTCCAAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGAGCAAGAGAAAGCCTTTTTCGCTCAGTTACAACTAGATGAAGAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130452 GGAGCAAGAGAAAGCCTTTTTCGCTCAGTTACAACTAGATGAAGAGACAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTGAATTTCTCCCAATTCAGCCAGCCCAGCACATCCAGTCAGAAACCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130502 GTGAATTTCTCCCAATTCAGCCAGCCCAGCACATCCAGTCAGAAACCAGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGATCTGCCAACTACTCCCAG         GTTGCCCACATTCCCAAATC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 130552 GGATCTGCCAACTACTCCCAGGTA...CAGGTTGCCCACATTCCCAAATC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGATGCTTTGTACTTTGATGACTGCATGCAGCTTTTGGCGCAGACATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131258 AGATGCTTTGTACTTTGATGACTGCATGCAGCTTTTGGCGCAGACATTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CGTTTGTAGATGACAATGAG         GTTTCTTCGGCTACGTTTCAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 131308 CGTTTGTAGATGACAATGAGGTG...TAGGTTTCTTCGGCTACGTTTCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCACTTGTTCCTGATATTCCCGGTCACATCGAGAGCCCAGTCTTCATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132015 TCACTTGTTCCTGATATTCCCGGTCACATCGAGAGCCCAGTCTTCATTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TACTAATCAGGCTCAGTCACCTGAAACTTCTGTTGCTCAGGTAGCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132065 TACTAATCAGGCTCAGTCACCTGAAACTTCTGTTGCTCAGGTAGCCCCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTGATTTAGACGGTATGCAACAGGACATTGAGCAAGTTTGGGAGGAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132115 TTGATTTAGACGGTATGCAACAGGACATTGAGCAAGTTTGGGAGGAGCTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TTATCCATTCCTGAGTTACAG         TGTCTTAATATTGAAAATGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 132165 TTATCCATTCCTGAGTTACAGGTA...CAGTGTCTTAATATTGAAAATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CAAGCTGGTTGAGACTACCATGGTTCCAAGTCCAGAAGCCAAACTGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132589 CAAGCTGGTTGAGACTACCATGGTTCCAAGTCCAGAAGCCAAACTGACAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AAGTTGACAATTATCATTTTTACTCATCTATACCCTCAATGGAAAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132639 AAGTTGACAATTATCATTTTTACTCATCTATACCCTCAATGGAAAAAGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GTAGGTAACTGTAGTCCACATTTTCTTAATGCTTTTGAGGATTCCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132689 GTAGGTAACTGTAGTCCACATTTTCTTAATGCTTTTGAGGATTCCTTCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CAGCATCCTCTCCACAGAAGACCCCAACCAGTTGACAGTGAACTCATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132739 CAGCATCCTCTCCACAGAAGACCCCAACCAGTTGACAGTGAACTCATTAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ATTCAGATGCCACAGTCAACACAGATTTTGGTGATGAATTTTATTCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132789 ATTCAGATGCCACAGTCAACACAGATTTTGGTGATGAATTTTATTCTGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TTCATAGCTGAGCCCAGTATCAGCAACAGCATGCCCTCACCTGCTACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132839 TTCATAGCTGAGCCCAGTATCAGCAACAGCATGCCCTCACCTGCTACTTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 AAGCCATTCACTCTCTGAACTTCTAAATGGGCCCATTGATGTTTCTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132889 AAGCCATTCACTCTCTGAACTTCTAAATGGGCCCATTGATGTTTCTGATC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TATCACTTTGCAAAGCTTTCAACCAAAACCACCCTGAAAGCACAGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132939 TATCACTTTGCAAAGCTTTCAACCAAAACCACCCTGAAAGCACAGCAGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 TTCAATGATTCTGACTCCGGCATTTCACTAAACACAAGTCCCAGTGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132989 TTCAATGATTCTGACTCCGGCATTTCACTAAACACAAGTCCCAGTGTGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 ATCACCAGAACACTCAGTGGAATCTTCCAGCTATGGAGACACACTACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133039 ATCACCAGAACACTCAGTGGAATCTTCCAGCTATGGAGACACACTACTTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 GCCTCAGTGATTCTGAAGTGGAAGAGCTAGATAGTGCCCCTGGAAGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133089 GCCTCAGTGATTCTGAAGTGGAAGAGCTAGATAGTGCCCCTGGAAGTGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 AAACAGAATGGTCCTAAAACACCAGTACATTCTTCTGGGGATATGGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133139 AAACAGAATGGTCCTAAAACACCAGTACATTCTTCTGGGGATATGGTACA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 ACCCTTGTCACCATCTCAGGGGCAGAGCACTCACGTGCATGATGCCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133189 ACCCTTGTCACCATCTCAGGGGCAGAGCACTCACGTGCATGATGCCCAAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 GTGAGAACACACCAGAGAAAGAATTGCCTGTAAGTCCTGGTCATCGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133239 GTGAGAACACACCAGAGAAAGAATTGCCTGTAAGTCCTGGTCATCGGAAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 ACCCCATTCACAAAAGACAAACATTCAAGCCGCTTGGAGGCTCATCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133289 ACCCCATTCACAAAAGACAAACATTCAAGCCGCTTGGAGGCTCATCTCAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 AAGAGATGAACTTAGGGCAAAAGCTCTCCATATCCCATTCCCTGTAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133339 AAGAGATGAACTTAGGGCAAAAGCTCTCCATATCCCATTCCCTGTAGAAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 AAATCATTAACCTCCCTGTTGTTGACTTCAACGAAATGATGTCTAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 133389 AAATCATTAACCTCCCTGTTGTTGACTTCAACGAAATGATGTCCAAAGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 CAGTTCAATGAAGCTCAACTTGCATTAATTCGGGATATACGTAGGAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133439 CAGTTCAATGAAGCTCAACTTGCATTAATTCGGGATATACGTAGGAGGGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 TAAGAATAAAGTGGCTGCTCAGAATTGCAGAAAAAGAAAACTGGAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133489 TAAGAATAAAGTGGCTGCTCAGAATTGCAGAAAAAGAAAACTGGAAAATA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 TAGTAGAACTAGAGCAAGATTTAGATCATTTGAAAGATGAAAAAGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133539 TAGTAGAACTAGAGCAAGATTTAGATCATTTGAAAGATGAAAAAGAAAAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 TTGCTCAAAGAAAAAGGAGAAAATGACAAAAGCCTTCACCTACTGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133589 TTGCTCAAAGAAAAAGGAGAAAATGACAAAAGCCTTCACCTACTGAAAAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1665 ACAACTCAGCACCTTATATCTCGAAGTTTTCAGCATGCTACGTGATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133639 ACAACTCAGCACCTTATATCTCGAAGTTTTCAGCATGCTACGTGATGAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1715 ATGGAAAACCTTATTCTCCTAGTGAATACTCCCTGCAGCAAACAAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133689 ATGGAAAACCTTATTCTCCTAGTGAATACTCCCTGCAGCAAACAAGAGAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1765 GGCAATGTTTTCCTTGTTCCCAAAAGTAAGAAGCCAGATGTTAAGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133739 GGCAATGTTTTCCTTGTTCCCAAAAGTAAGAAGCCAGATGTTAAGAAAAA

   1850 
   1815 C
        |
 133789 C