seq1 = pF1KB7823.tfa, 1608 bp
seq2 = pF1KB7823/gi568815584r_77618091.tfa (gi568815584r:77618091_77855122), 237032 bp

>pF1KB7823 1608
>gi568815584r:77618091_77855122 (Chr14)

(complement)

6-168  (99995-100156)   98% ->
169-330  (103643-103804)   100% ->
331-426  (116062-116157)   100% ->
427-533  (116239-116345)   100% ->
534-638  (118048-118152)   100% ->
639-708  (119117-119186)   100% ->
709-774  (120111-120176)   100% ->
775-891  (122522-122638)   100% ->
892-1033  (123994-124135)   99% ->
1034-1130  (131846-131942)   100% ->
1131-1248  (134295-134412)   100% ->
1249-1412  (136593-136756)   100% ->
1413-1608  (136837-137032)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      6 GCTCACCAGCTTTTTACCTGCACCTACTCAGCTATCTCAGGACCAGCTTG
        ||| | -|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99995 GCTTAT AGCTTTTTACCTGCACCTACTCAGCTATCTCAGGACCAGCTTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     56 AGGCTGAAGAAAAGGCAAGATCCCAGAGATCACGGCAGACCTCACTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100044 AGGCTGAAGAAAAGGCAAGATCCCAGAGATCACGGCAGACCTCACTGGTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    106 TCCTCCCGAAGAGAACCTCCCCCGTACGGATACCGGAAAGGCTGGATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100094 TCCTCCCGAAGAGAACCTCCCCCGTACGGATACCGGAAAGGCTGGATACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    156 TCGGTTATTAGAG         GATTTTGGAGATGGAGGTGCTTTTCCAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100144 TCGGTTATTAGAGGTA...TAGGATTTTGGAGATGGAGGTGCTTTTCCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    197 AGATCCATGTGGCCCAGTATCCACTGGATATGGGACGAAAGAAAAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103671 AGATCCATGTGGCCCAGTATCCACTGGATATGGGACGAAAGAAAAAAATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    247 TCGAATGCGCTGGCCATTCAGGTGGATTCTGAAGGAAAAATTAAATATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103721 TCGAATGCGCTGGCCATTCAGGTGGATTCTGAAGGAAAAATTAAATATGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    297 TGCAATTGCTCGACAAGGACAGTCAAAAGACAAG         GTCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 103771 TGCAATTGCTCGACAAGGACAGTCAAAAGACAAGGTA...TAGGTCATTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    338 ATAGCAAATACACTGACCTGGTTCCAAAGGAGGTTATGAATGCAGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116069 ATAGCAAATACACTGACCTGGTTCCAAAGGAGGTTATGAATGCAGATGAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    388 CCAGACCTGCAAAGGCCCGATGAAGAAGCTATTAAAGAG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 116119 CCAGACCTGCAAAGGCCCGATGAAGAAGCTATTAAAGAGGTA...CAGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    429 AACAGAAAAGACAAGAGTAGCCTTAGAAAAATCTGTATCACAGAAGGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116241 AACAGAAAAGACAAGAGTAGCCTTAGAAAAATCTGTATCACAGAAGGTCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    479 CCGCAGCCATGCCAGTTCGAGCAGCTGACAAATTGGCTCCTGCTCAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116291 CCGCAGCCATGCCAGTTCGAGCAGCTGACAAATTGGCTCCTGCTCAGTAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    529 ATCCG         ATACACACCATCTCAGCAAGGAGTGGCATTCAACTC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116341 ATCCGGTA...CAGATACACACCATCTCAGCAAGGAGTGGCATTCAACTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    570 TGGAGCTAAACAGAGGGTTATTCGGATGGTAGAAATGCAGAAAGATCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118084 TGGAGCTAAACAGAGGGTTATTCGGATGGTAGAAATGCAGAAAGATCCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    620 TGGAGCCTCCAAGGTTCAA         GATTAATAAGAAAATTCCCCGG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 118134 TGGAGCCTCCAAGGTTCAAGTA...CAGGATTAATAAGAAAATTCCCCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    661 GGACCACCTTCTCCTCCTGCGCCTGTCATGCATTCTCCTAGCCGAAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 119139 GGACCACCTTCTCCTCCTGCGCCTGTCATGCATTCTCCTAGCCGAAAGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    709        ATGACTGTAAAGGAACAACAAGAGTGGAAGATTCCTCCTTGTA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119189 A...CAGATGACTGTAAAGGAACAACAAGAGTGGAAGATTCCTCCTTGTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    752 TTTCTAACTGGAAAAATGCAAAG         GGTTATACAATTCCATTA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 120154 TTTCTAACTGGAAAAATGCAAAGGTA...TAGGGTTATACAATTCCATTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    793 GACAAACGTCTGGCTGCTGATGGAAGAGGACTACAGACAGTACACATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122540 GACAAACGTCTGGCTGCTGATGGAAGAGGACTACAGACAGTACACATAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    843 TGAAAATTTCGCCAAATTGGCAGAAGCCCTCTACATTGCTGATCGGAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 122590 TGAAAATTTCGCCAAATTGGCAGAAGCCCTCTACATTGCTGATCGGAAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892         GCTCGTGAAGCTGTGGAAATGCGTGCCCAAGTAGAGAGAAAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122640 TT...CAGGCTCGTGAAGCTGTGGAAATGCGTGCCCAAGTAGAGAGAAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    934 ATGGCTCAGAAAGAAAAGGAAAAACATGAAGAGAAACTTAGAGAAATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124036 ATGGCTCAGAAAGAAAAGGAAAAACATGAAGAGAAACTTAGAGAAATGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    984 CCAGAAAGCCAGGGAAAGAAGAGCTGGGATCAAAACTCATGTGGAAAAAG
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124086 CCAGAAAGCCAGGGAGAGAAGAGCTGGGATCAAAACTCATGTGGAAAAAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1034          AGGATGGGGAGGCACGTGAGAGGGATGAAATCCGGCATGAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124136 GTA...CAGAGGATGGGGAGGCACGTGAGAGGGATGAAATCCGGCATGAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1075 AGGCGAAAAGAGAGACAGCATGACCGGAATCTTTCCAGGGCAGCTCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131887 AGGCGAAAAGAGAGACAGCATGACCGGAATCTTTCCAGGGCAGCTCCTGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1125 TAAGAG         GTCGAAACTTCAGAGAAATGAAAATCGGGATATCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131937 TAAGAGGTA...TAGGTCGAAACTTCAGAGAAATGAAAATCGGGATATCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1166 GTGAAGTTATTGCTCTCGGTGTTCCTAATCCTCGGACTTCCAATGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134330 GTGAAGTTATTGCTCTCGGTGTTCCTAATCCTCGGACTTCCAATGAAGTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1216 CAGTATGACCAAAGGCTCTTCAACCAATCCAAG         GGTATGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 134380 CAGTATGACCAAAGGCTCTTCAACCAATCCAAGGTA...CAGGGTATGGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1257 CAGTGGATTTGCAGGTGGAGAAGATGAAATTTATAATGTTTATGATCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136601 CAGTGGATTTGCAGGTGGAGAAGATGAAATTTATAATGTTTATGATCAAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1307 CCTGGAGAGGTGGTAAAGATATGGCCCAGAGTATTTATAGGCCCAGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136651 CCTGGAGAGGTGGTAAAGATATGGCCCAGAGTATTTATAGGCCCAGTAAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1357 AATCTGGACAAGGACATGTATGGTGATGACCTAGAAGCCAGAATAAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136701 AATCTGGACAAGGACATGTATGGTGATGACCTAGAAGCCAGAATAAAGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1407 CAACAG         ATTTGTTCCCGACAAGGAGTTTTCTGGTTCAGACC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136751 CAACAGGTG...TAGATTTGTTCCCGACAAGGAGTTTTCTGGTTCAGACC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1448 GTAGACAGAGAGGCCGAGAAGGACCAGTTCAGTTTGAGGAAGATCCTTTT
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 136872 GTAGACAGAGAGGCCGAGAAGGACCAGTGCAGTTTGAGGAAGATCCTTTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1498 GGTTTGGACAAGTTTTTGGAAGAAGCCAAACAGCATGGTGGCTCTAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136922 GGTTTGGACAAGTTTTTGGAAGAAGCCAAACAGCATGGTGGCTCTAAAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1548 ACCCTCAGATAGCAGCCGCCCCAAGGAACACGAGCATGAAGGCAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136972 ACCCTCAGATAGCAGCCGCCCCAAGGAACACGAGCATGAAGGCAAGAAGA

   1700     .    :
   1598 GGAGGAAGGAA
        |||||||||||
 137022 GGAGGAAGGAA