seq1 = pF1KB7822.tfa, 1800 bp
seq2 = pF1KB7822/gi568815579r_16476030.tfa (gi568815579r:16476030_16727943), 251914 bp

>pF1KB7822 1800
>gi568815579r:16476030_16727943 (Chr19)

(complement)

1-72  (100001-100072)   100% ->
73-147  (149535-149609)   100% ->
148-1800  (150262-151914)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACAGCGGCTCCGGCGTCTCCGCAGCAGATCAGGGACCGGCTGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACAGCGGCTCCGGCGTCTCCGCAGCAGATCAGGGACCGGCTGCTGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCATCGACCCCCAGAGCAAC         ATCCGGAACATGGTGGCGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100051 GGCCATCGACCCCCAGAGCAACGTA...CAGATCCGGAACATGGTGGCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGCTGGAAGTCATCTCCAGCCTGGAGAAATACCCTATTACCAAAGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149554 TGCTGGAAGTCATCTCCAGCCTGGAGAAATACCCTATTACCAAAGAGGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTTGAG         GAAACACGACTTGGGAAGCTCATCAACGACGTCCG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149604 CTTGAGGTG...TAGGAAACACGACTTGGGAAGCTCATCAACGACGTCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAAGAAAACCAAGAACGAGGAGCTCGCCAAGCGGGCCAAGAAGCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150297 CAAGAAAACCAAGAACGAGGAGCTCGCCAAGCGGGCCAAGAAGCTGCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGAGCTGGCAGAAGCTCATCGAGCCGGCACACCAGCATGAGGCGGCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150347 GGAGCTGGCAGAAGCTCATCGAGCCGGCACACCAGCATGAGGCGGCGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGGGGGCTGGCGGGGGCCACCGGCTCTGCCAACGGGGGCGCACACAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150397 CGGGGGCTGGCGGGGGCCACCGGCTCTGCCAACGGGGGCGCACACAACTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCGGCCGGAGGTGGGGGCGGCTGGCCCACCCAGGAGCATCCATGACCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150447 CCGGCCGGAGGTGGGGGCGGCTGGCCCACCCAGGAGCATCCATGACCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGAGCCGCAATGACCTCCAGAGGCTGCCCGGGCAGCGGCTGGACAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150497 AGAGCCGCAATGACCTCCAGAGGCTGCCCGGGCAGCGGCTGGACAGGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGCAGCCGCAAGCGCCGGGGTGACCAGCGTGACCTCGGCCACCCAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150547 GGCAGCCGCAAGCGCCGGGGTGACCAGCGTGACCTCGGCCACCCAGGGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GCCACCCAAGGTCTCCAAAGCTAGCCACGACCCCCTGGTCCCCAACTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150597 GCCACCCAAGGTCTCCAAAGCTAGCCACGACCCCCTGGTCCCCAACTCAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCCCCCTCCCCACCAACGGGATCAGTGGGAGTCCAGAGAGCTTCGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150647 CCCCCCTCCCCACCAACGGGATCAGTGGGAGTCCAGAGAGCTTCGCCAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TCCCTGGATGGCAGTGGGCATGCAGGCCCAGAGGGCAGCCGCCTGGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150697 TCCCTGGATGGCAGTGGGCATGCAGGCCCAGAGGGCAGCCGCCTGGAGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TGACGAGAATGACAAGCACAGTGGCAAGATCCCCGTCAACGCCGTGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150747 TGACGAGAATGACAAGCACAGTGGCAAGATCCCCGTCAACGCCGTGCGAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CGCACACCAGCTCCCCGGGCCTGGGCAAGCCCCCTGGACCCTGCTTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150797 CGCACACCAGCTCCCCGGGCCTGGGCAAGCCCCCTGGACCCTGCTTGCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CCAAAGGCTTCGGTGCTGCAGCAGCTGGACAGGGTGGACGAGACTCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150847 CCAAAGGCTTCGGTGCTGCAGCAGCTGGACAGGGTGGACGAGACTCCGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GCCTCCCCATCCCAAGGGACCCCCTCGCTGCTCTTTCAGTCCTCGGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150897 GCCTCCCCATCCCAAGGGACCCCCTCGCTGCTCTTTCAGTCCTCGGAACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 CACGGCATGAGGGCTCCTTTGCCCGGCAGCAGAGCTTGTATGCACCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150947 CACGGCATGAGGGCTCCTTTGCCCGGCAGCAGAGCTTGTATGCACCCAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GGCTCCGTGCCCAGCCCCTCACCGCGGCCCCAGGCACTCGATGCCACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150997 GGCTCCGTGCCCAGCCCCTCACCGCGGCCCCAGGCACTCGATGCCACACA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GGTGCCGTCACCGCTTCCACTGGCACAGCCGTCCACACCCCCCGTACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151047 GGTGCCGTCACCGCTTCCACTGGCACAGCCGTCCACACCCCCCGTACGGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 GGCTCGAGCTGCTGCCCAGTGCGGAAAGCCCAGTGTGCTGGCTTGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151097 GGCTCGAGCTGCTGCCCAGTGCGGAAAGCCCAGTGTGCTGGCTTGAGCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 CCTGAGAGCCACCAGCGGCTGGCGGGGCCGGGCTGCAAGGCAGGGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151147 CCTGAGAGCCACCAGCGGCTGGCGGGGCCGGGCTGCAAGGCAGGGCTGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 CCCAGCCGAGCCCCTCCTGTCCCGGGCAGGCTTTTCCCCAGACTCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151197 CCCAGCCGAGCCCCTCCTGTCCCGGGCAGGCTTTTCCCCAGACTCCTCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 AGGCGGACAGTGATGCTGCCTCCTCAGGGGGCTCGGACAGTAAAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151247 AGGCGGACAGTGATGCTGCCTCCTCAGGGGGCTCGGACAGTAAAAAGAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 AAGAGGTACCGACCTCGAGACTATACGGTTAACTTGGACGGGCAGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151297 AAGAGGTACCGACCTCGAGACTATACGGTTAACTTGGACGGGCAGGTGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 TGAGGCGGGCGTCAAGCCTGTCCGGTTAAAAGAGCGGAAGCTCACCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151347 TGAGGCGGGCGTCAAGCCTGTCCGGTTAAAAGAGCGGAAGCTCACCTTTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 ACCCCATGACGAGACAGATCAAACCTCTGACCCAGAAAGAGCCAGTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151397 ACCCCATGACGAGACAGATCAAACCTCTGACCCAGAAAGAGCCAGTGCGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 GCAGACAGCCCTGTGCACATGGAGCAGCAGTCCAGGACAGAGCTGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151447 GCAGACAGCCCTGTGCACATGGAGCAGCAGTCCAGGACAGAGCTGGACAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 GCAGGAGGCCAAGGCCAGCCTCCAGAGCCCCTTCGAACAGACGAACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151497 GCAGGAGGCCAAGGCCAGCCTCCAGAGCCCCTTCGAACAGACGAACTGGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 AGGAGCTGTCACGCAACGAGATCATCCAGTCCTACCTGAGCCGGCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151547 AGGAGCTGTCACGCAACGAGATCATCCAGTCCTACCTGAGCCGGCAGAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 AGCCTGCTCTCATCATCGGGCGCGCAGACCCCAGGGGCTCACCACTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151597 AGCCTGCTCTCATCATCGGGCGCGCAGACCCCAGGGGCTCACCACTTCAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 GTCTGAGTACCTGAAGCAGGAGGAGAGCACCCGGCAAGGGGCCAGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151647 GTCTGAGTACCTGAAGCAGGAGGAGAGCACCCGGCAAGGGGCCAGGCAGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 TGCATGTGCTGGTGCCTCAAAGCCCGCCCACGGACCTCCCTGGTCTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151697 TGCATGTGCTGGTGCCTCAAAGCCCGCCCACGGACCTCCCTGGTCTGACC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 CGGGAGGTCACACAGGACGATCTCGACAGAATCCAGGCCAGCCAGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151747 CGGGAGGTCACACAGGACGATCTCGACAGAATCCAGGCCAGCCAGTGGCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 GGGGGTGAACGGGTGTCAGGACACACAGGGTAACTGGTATGACTGGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151797 GGGGGTGAACGGGTGTCAGGACACACAGGGTAACTGGTATGACTGGACGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1733 AGTGCATATCGCTCGATCCGCACGGCGACGACGGGCGCTTGAACATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151847 AGTGCATATCGCTCGATCCGCACGGCGACGACGGGCGCTTGAACATTCTG

   1800     .    :    .
   1783 CCTTATGTCTGCTTGGAC
        ||||||||||||||||||
 151897 CCTTATGTCTGCTTGGAC